FuNGI

B8MBU3

Protein Details

Accession

B8MBU3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MASDKVEKKRKRDSDRHDRPSKKPAIE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-23	KKRKRDSDRHDRPSKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 11.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MASDKVEKKRKRDSDRHDRPSKKPAIEAQNLPPLTASVLKDDNELAPVLINAPGLQFPKKVHGFKPYTKESSTSSKTASSSGRNKGIVSTELLLQSSEHPKLDFVGTEATEDADSQLKHYIAIVDPEKKTWQFVEVRKMTLRSTVKKRNPSVAADEDDSDGADVSYRDQRNALTEAFGTKASRKAAQSEAENSMLAPAGGSSAIESAILSSMPLQGIATANLKAQELQAQVQANKPIPTANLSAMHPSEVYTIESLVAGGMSTLNQLPIQEWQDAVNAGEAVMSTSRYVAHRVDAVVKSTNVTHLQLLRYILALIELTKNIKRGKGSDPPGSKRIPLRADLKRLLSGGSSATTQLPEPVVEAIRRKFAPGGIMIRSNITLLYTTLCALTLHIPPTPTKDGGTSSLGGNTPTELATDPSDLRDDLRLDTATITQYFKELGCRVEKPRESEFAKFGIKSKAEAANKRVCKLRIPLDFPKVSRGGGPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.91
3	0.93
4	0.93
5	0.9
6	0.86
7	0.86
8	0.85
9	0.77
10	0.72
11	0.71
12	0.7
13	0.7
14	0.69
15	0.65
16	0.65
17	0.6
18	0.54
19	0.45
20	0.35
21	0.3
22	0.29
23	0.23
24	0.19
25	0.22
26	0.22
27	0.23
28	0.24
29	0.23
30	0.19
31	0.19
32	0.14
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.1
37	0.09
38	0.08
39	0.08
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.17
44	0.18
45	0.27
46	0.34
47	0.38
48	0.39
49	0.47
50	0.53
51	0.58
52	0.65
53	0.64
54	0.62
55	0.59
56	0.57
57	0.51
58	0.53
59	0.5
60	0.44
61	0.38
62	0.36
63	0.36
64	0.38
65	0.38
66	0.37
67	0.4
68	0.44
69	0.48
70	0.46
71	0.45
72	0.43
73	0.42
74	0.35
75	0.3
76	0.24
77	0.21
78	0.2
79	0.2
80	0.18
81	0.15
82	0.18
83	0.2
84	0.21
85	0.19
86	0.18
87	0.19
88	0.2
89	0.21
90	0.17
91	0.13
92	0.15
93	0.14
94	0.15
95	0.14
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.15
104	0.14
105	0.14
106	0.14
107	0.15
108	0.12
109	0.18
110	0.21
111	0.24
112	0.24
113	0.26
114	0.3
115	0.28
116	0.29
117	0.24
118	0.26
119	0.27
120	0.32
121	0.41
122	0.39
123	0.42
124	0.43
125	0.44
126	0.39
127	0.4
128	0.41
129	0.39
130	0.46
131	0.54
132	0.59
133	0.67
134	0.7
135	0.7
136	0.67
137	0.62
138	0.59
139	0.53
140	0.48
141	0.4
142	0.37
143	0.3
144	0.25
145	0.21
146	0.15
147	0.1
148	0.06
149	0.06
150	0.05
151	0.07
152	0.14
153	0.15
154	0.15
155	0.16
156	0.17
157	0.19
158	0.22
159	0.2
160	0.14
161	0.13
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.12
166	0.11
167	0.15
168	0.16
169	0.19
170	0.19
171	0.21
172	0.25
173	0.27
174	0.28
175	0.28
176	0.29
177	0.26
178	0.25
179	0.21
180	0.17
181	0.14
182	0.11
183	0.07
184	0.04
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.04
195	0.04
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.04
202	0.05
203	0.05
204	0.07
205	0.08
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.13
216	0.14
217	0.15
218	0.17
219	0.19
220	0.17
221	0.17
222	0.16
223	0.14
224	0.12
225	0.15
226	0.14
227	0.13
228	0.14
229	0.13
230	0.15
231	0.15
232	0.14
233	0.12
234	0.1
235	0.1
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.02
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.08
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.04
272	0.05
273	0.06
274	0.07
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.17
281	0.17
282	0.19
283	0.18
284	0.18
285	0.17
286	0.16
287	0.18
288	0.14
289	0.15
290	0.14
291	0.15
292	0.16
293	0.17
294	0.17
295	0.15
296	0.13
297	0.12
298	0.1
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.15
307	0.16
308	0.19
309	0.2
310	0.23
311	0.29
312	0.36
313	0.4
314	0.45
315	0.51
316	0.54
317	0.57
318	0.54
319	0.51
320	0.46
321	0.47
322	0.42
323	0.39
324	0.43
325	0.45
326	0.51
327	0.51
328	0.5
329	0.44
330	0.41
331	0.37
332	0.28
333	0.22
334	0.16
335	0.13
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.13
348	0.18
349	0.18
350	0.23
351	0.23
352	0.24
353	0.23
354	0.23
355	0.24
356	0.23
357	0.26
358	0.23
359	0.25
360	0.24
361	0.24
362	0.23
363	0.2
364	0.15
365	0.12
366	0.1
367	0.08
368	0.09
369	0.08
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.08
374	0.09
375	0.12
376	0.13
377	0.14
378	0.16
379	0.17
380	0.17
381	0.24
382	0.27
383	0.25
384	0.23
385	0.23
386	0.24
387	0.27
388	0.29
389	0.24
390	0.2
391	0.22
392	0.21
393	0.2
394	0.18
395	0.15
396	0.12
397	0.11
398	0.11
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.14
403	0.14
404	0.15
405	0.16
406	0.16
407	0.16
408	0.19
409	0.18
410	0.17
411	0.2
412	0.19
413	0.18
414	0.19
415	0.2
416	0.19
417	0.19
418	0.19
419	0.16
420	0.16
421	0.17
422	0.16
423	0.21
424	0.2
425	0.22
426	0.27
427	0.32
428	0.37
429	0.46
430	0.51
431	0.5
432	0.53
433	0.57
434	0.56
435	0.55
436	0.52
437	0.47
438	0.48
439	0.43
440	0.42
441	0.42
442	0.39
443	0.36
444	0.39
445	0.42
446	0.45
447	0.51
448	0.54
449	0.56
450	0.6
451	0.62
452	0.64
453	0.57
454	0.56
455	0.57
456	0.59
457	0.58
458	0.62
459	0.66
460	0.68
461	0.72
462	0.66
463	0.66
464	0.58
465	0.49
466	0.47

B8MBU3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer