Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1C3A1

Protein Details
Accession A0A0D1C3A1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-274DKDNKVKKFAFKCHRRANADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 8, cyto 6.5, extr 6, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006405  P:RNA export from nucleus  
GO:0000972  P:transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery  
KEGG uma:UMAG_03762  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MAFFSSASTPSTFGARPAATPGQINTSAATKTSGDQDQEVAPGATDTVSCLAFSPTADFLAVGSWDNNVRIYQINKTSPTPVQPWQQYSHEAPVLDLCWSTDGAKVFSVGADKVCRMFDMNTNQPTVVAQHADTIRSVCWLNVAGGVLLTAGWDKQLKIWKIDNPASPQAVHSLTLPEKCYVMDNVQNVVVVAMAERMVLGFRLEETGSITPLTEQQSPLKYQTRSMAVLPDGDGYALGGVEGRVGVQYFHDPPDKDNKVKKFAFKCHRRANADHPEVPRNESHLFPVNCIAFNVHGTFATGGADGSINFWCKQSRTRLKTMETKGPANAPKELLKTNPAKQPITAIGFNRDATILAYAVGYDWHKGYAGAGAVEPKVYIQPVNYEDVKKRPPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.21
4 0.27
5 0.29
6 0.27
7 0.28
8 0.28
9 0.28
10 0.28
11 0.28
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.19
16 0.2
17 0.15
18 0.15
19 0.21
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.25
24 0.23
25 0.23
26 0.23
27 0.17
28 0.13
29 0.11
30 0.11
31 0.09
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.15
58 0.17
59 0.22
60 0.28
61 0.33
62 0.35
63 0.37
64 0.4
65 0.38
66 0.41
67 0.39
68 0.37
69 0.41
70 0.43
71 0.45
72 0.45
73 0.46
74 0.45
75 0.44
76 0.43
77 0.37
78 0.32
79 0.28
80 0.25
81 0.23
82 0.18
83 0.15
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.19
106 0.25
107 0.31
108 0.32
109 0.33
110 0.32
111 0.3
112 0.29
113 0.24
114 0.18
115 0.12
116 0.1
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.09
143 0.17
144 0.18
145 0.22
146 0.26
147 0.3
148 0.36
149 0.41
150 0.41
151 0.39
152 0.41
153 0.37
154 0.34
155 0.3
156 0.25
157 0.21
158 0.18
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.17
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.13
169 0.13
170 0.15
171 0.14
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.11
177 0.09
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.1
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.15
204 0.18
205 0.19
206 0.23
207 0.27
208 0.24
209 0.25
210 0.28
211 0.28
212 0.27
213 0.26
214 0.24
215 0.19
216 0.19
217 0.17
218 0.14
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.08
236 0.09
237 0.12
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.29
242 0.33
243 0.36
244 0.42
245 0.45
246 0.5
247 0.53
248 0.59
249 0.57
250 0.62
251 0.67
252 0.69
253 0.74
254 0.75
255 0.8
256 0.78
257 0.75
258 0.75
259 0.75
260 0.71
261 0.67
262 0.61
263 0.58
264 0.53
265 0.51
266 0.42
267 0.35
268 0.31
269 0.26
270 0.26
271 0.29
272 0.28
273 0.27
274 0.3
275 0.27
276 0.25
277 0.25
278 0.22
279 0.14
280 0.16
281 0.16
282 0.11
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.14
299 0.16
300 0.23
301 0.32
302 0.42
303 0.47
304 0.55
305 0.61
306 0.65
307 0.73
308 0.73
309 0.71
310 0.65
311 0.61
312 0.54
313 0.54
314 0.53
315 0.46
316 0.43
317 0.36
318 0.36
319 0.37
320 0.37
321 0.33
322 0.35
323 0.39
324 0.43
325 0.47
326 0.48
327 0.45
328 0.43
329 0.46
330 0.44
331 0.43
332 0.4
333 0.36
334 0.36
335 0.37
336 0.36
337 0.32
338 0.26
339 0.21
340 0.18
341 0.17
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.18
369 0.21
370 0.27
371 0.3
372 0.33
373 0.37
374 0.44
375 0.53