Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CHQ9

Protein Details
Accession A0A0D1CHQ9    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-310YIDAATGKPKRKRNRKKPDTKKPGGADKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-237PKRTARDSKRRATHSQIERRRRE
289-307GKPKRKRNRKKPDTKKPGG
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045851  AMP-bd_C_sf  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_05486  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
Amino Acid Sequences MLYSTYRPPLAPSTDPRSYDKNYADDFHHRPHPHASLGAPGSVSVSSDRFEYKGQHLLASTLESRLCSNALVRDCSVIGVSQSDGAVITLSSHQAPMLNTTPIAFVALSSAGKERSAHGGDKESKRMKSELIKWIVDFAPPFKLMKGKLLFVEAIARAHDGSVLRHLLVEKATSPPLPAPDKGFFNTVLSESSTPAAPSKAASVVGDMNEPASPPKRTARDSKRRATHSQIERRRREKINDRLVTLRSIVPACAKELEDRRRQKQEEQDEAARIAAGGAPKTYIDAATGKPKRKRNRKKPDTKKPGGADKEEELGLHKLEVLTHAINYIFELKAIIHKLETGSSPEHVPTADNPFGVRNKDGTYRQDAKIEDDPGYGLGARTLEADHGKVAAGRSATSAMQRECQESEEEDDGEQEEVEQDQLEDDVTEGDDEQDTDAADDDQDDQDDDEDEPLGRRSKKHMTCAAFSSHTDRSPASHVKVDCFVVPKRYRHTDAAGSSSSSRGSAEVSPAFSLIQQSPSTISPATTVTSPMMSLSAESPIMLPDSAMGMSKRAGPTASRVSQSPVFSSLPASALPLPSGLPARRESSSFLFKQLSLTSPNFTPFTAAGYYSGVSSCTAASVATAAGGARVKSTTLSFATTYGEESEVRETSSSSQKTPGLSDRDMKTDHVSATVASDASAAELLLNFSTSPEVLRPIGSSSQSSSKRPAHWPASMLDSSPHTRPMVGLTHNNSRSTFSCAHYRPTLQTSPSPALFTTCKPTTLPAPNVSNHQLVSPVNHAHALPLASPPLLALDSSSPLDDDHLSDKTIDDLPESVVKLEASQLVGHVHTAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.55
4 0.55
5 0.54
6 0.56
7 0.53
8 0.52
9 0.48
10 0.48
11 0.49
12 0.51
13 0.51
14 0.49
15 0.54
16 0.48
17 0.48
18 0.53
19 0.52
20 0.46
21 0.44
22 0.38
23 0.37
24 0.37
25 0.34
26 0.27
27 0.22
28 0.21
29 0.18
30 0.18
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.13
35 0.15
36 0.15
37 0.17
38 0.21
39 0.24
40 0.3
41 0.31
42 0.31
43 0.3
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.23
48 0.18
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.17
54 0.14
55 0.16
56 0.2
57 0.23
58 0.26
59 0.26
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.17
65 0.14
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.13
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.19
89 0.16
90 0.17
91 0.11
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.2
103 0.23
104 0.25
105 0.26
106 0.34
107 0.42
108 0.47
109 0.54
110 0.54
111 0.53
112 0.53
113 0.53
114 0.5
115 0.5
116 0.53
117 0.53
118 0.53
119 0.52
120 0.49
121 0.51
122 0.45
123 0.38
124 0.31
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.23
131 0.22
132 0.3
133 0.31
134 0.28
135 0.28
136 0.3
137 0.29
138 0.24
139 0.28
140 0.2
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.14
147 0.1
148 0.11
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.15
161 0.16
162 0.17
163 0.22
164 0.24
165 0.24
166 0.26
167 0.28
168 0.32
169 0.32
170 0.32
171 0.27
172 0.24
173 0.24
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.24
203 0.29
204 0.33
205 0.44
206 0.52
207 0.59
208 0.67
209 0.73
210 0.75
211 0.76
212 0.77
213 0.75
214 0.74
215 0.73
216 0.75
217 0.75
218 0.77
219 0.8
220 0.79
221 0.79
222 0.75
223 0.75
224 0.74
225 0.75
226 0.75
227 0.7
228 0.68
229 0.64
230 0.59
231 0.51
232 0.42
233 0.33
234 0.24
235 0.21
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.19
243 0.27
244 0.35
245 0.41
246 0.48
247 0.54
248 0.62
249 0.64
250 0.65
251 0.67
252 0.68
253 0.67
254 0.65
255 0.61
256 0.53
257 0.5
258 0.43
259 0.33
260 0.23
261 0.15
262 0.1
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.2
275 0.26
276 0.33
277 0.4
278 0.49
279 0.58
280 0.67
281 0.77
282 0.79
283 0.85
284 0.88
285 0.93
286 0.95
287 0.96
288 0.96
289 0.91
290 0.88
291 0.82
292 0.8
293 0.73
294 0.65
295 0.57
296 0.47
297 0.42
298 0.34
299 0.28
300 0.21
301 0.18
302 0.14
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.17
342 0.19
343 0.2
344 0.19
345 0.14
346 0.15
347 0.2
348 0.23
349 0.24
350 0.3
351 0.34
352 0.34
353 0.37
354 0.35
355 0.34
356 0.35
357 0.33
358 0.26
359 0.21
360 0.2
361 0.15
362 0.15
363 0.11
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.13
386 0.11
387 0.15
388 0.16
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.14
394 0.17
395 0.14
396 0.13
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.19
445 0.29
446 0.33
447 0.4
448 0.46
449 0.45
450 0.46
451 0.48
452 0.45
453 0.37
454 0.33
455 0.31
456 0.25
457 0.22
458 0.21
459 0.19
460 0.17
461 0.21
462 0.24
463 0.21
464 0.24
465 0.24
466 0.24
467 0.26
468 0.25
469 0.21
470 0.21
471 0.2
472 0.24
473 0.29
474 0.31
475 0.35
476 0.4
477 0.42
478 0.42
479 0.44
480 0.41
481 0.38
482 0.38
483 0.33
484 0.28
485 0.25
486 0.22
487 0.19
488 0.13
489 0.11
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.1
500 0.12
501 0.09
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.12
509 0.12
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.17
544 0.24
545 0.27
546 0.24
547 0.24
548 0.28
549 0.32
550 0.32
551 0.28
552 0.24
553 0.21
554 0.2
555 0.21
556 0.17
557 0.14
558 0.13
559 0.14
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.13
567 0.12
568 0.14
569 0.16
570 0.19
571 0.2
572 0.21
573 0.24
574 0.25
575 0.32
576 0.3
577 0.31
578 0.29
579 0.28
580 0.3
581 0.27
582 0.24
583 0.22
584 0.22
585 0.21
586 0.2
587 0.23
588 0.21
589 0.2
590 0.19
591 0.14
592 0.16
593 0.15
594 0.14
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.11
599 0.11
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.12
622 0.12
623 0.14
624 0.14
625 0.15
626 0.16
627 0.15
628 0.16
629 0.13
630 0.14
631 0.12
632 0.13
633 0.15
634 0.13
635 0.14
636 0.13
637 0.13
638 0.15
639 0.24
640 0.25
641 0.23
642 0.27
643 0.28
644 0.29
645 0.32
646 0.35
647 0.33
648 0.34
649 0.39
650 0.37
651 0.4
652 0.4
653 0.38
654 0.35
655 0.32
656 0.29
657 0.23
658 0.21
659 0.17
660 0.17
661 0.16
662 0.12
663 0.09
664 0.09
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.05
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.11
681 0.11
682 0.12
683 0.13
684 0.16
685 0.19
686 0.2
687 0.2
688 0.21
689 0.29
690 0.33
691 0.35
692 0.39
693 0.41
694 0.46
695 0.51
696 0.57
697 0.54
698 0.54
699 0.53
700 0.47
701 0.48
702 0.42
703 0.36
704 0.29
705 0.27
706 0.27
707 0.26
708 0.28
709 0.21
710 0.21
711 0.21
712 0.23
713 0.24
714 0.26
715 0.31
716 0.33
717 0.43
718 0.46
719 0.47
720 0.44
721 0.42
722 0.39
723 0.39
724 0.37
725 0.31
726 0.37
727 0.38
728 0.43
729 0.44
730 0.46
731 0.43
732 0.47
733 0.49
734 0.42
735 0.45
736 0.46
737 0.46
738 0.44
739 0.41
740 0.34
741 0.33
742 0.32
743 0.3
744 0.32
745 0.28
746 0.28
747 0.27
748 0.3
749 0.35
750 0.41
751 0.44
752 0.43
753 0.46
754 0.46
755 0.52
756 0.53
757 0.46
758 0.38
759 0.32
760 0.29
761 0.24
762 0.26
763 0.26
764 0.24
765 0.23
766 0.24
767 0.23
768 0.21
769 0.23
770 0.2
771 0.16
772 0.16
773 0.16
774 0.14
775 0.14
776 0.13
777 0.12
778 0.11
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.13
783 0.14
784 0.15
785 0.13
786 0.13
787 0.15
788 0.15
789 0.15
790 0.16
791 0.17
792 0.17
793 0.17
794 0.17
795 0.18
796 0.21
797 0.19
798 0.16
799 0.16
800 0.18
801 0.22
802 0.22
803 0.2
804 0.18
805 0.17
806 0.16
807 0.18
808 0.17
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.15
813 0.15