Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8LUD2

Protein Details
Accession B8LUD2    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
626-647NAQVVKRRKEFQERARNKQEEGHydrophilic
649-681EKGGDNGKRGMKRKRPEGRPNNKGDKTKDKKVDBasic
687-715DEDQKNKIAKRNRIIARKRQQRRQRKGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-554KRRREKGKGIVK
631-679KRRKEFQERARNKQEEGAEKGGDNGKRGMKRKRPEGRPNNKGDKTKDKK
691-715KNKIAKRNRIIARKRQQRRQRKGKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MADDSNKRRRLSEDGSFKPQTAEEIVLEKNETNGESKETPAKPQMRRELFVRSLPASATTEKLTGFFSQSYVIKHATVVIDPETKQSKGYGFVTFADIEDAQRALEEFNGVEFEGRKIKVEVAQPRKREIDEKEGKSVPTAEAARLKAERTKQREQTQPPKLIVRNLPWTIKDSDQLAALFRSFGKVKHAVVPKKGNVQAGFGFVVLRGRKNAEKALEAVNGKEIDGRTLAVDWAVEKNVWEEAQQTAEKKDEDAMEVDDAKSDEAGAEDEEDESVGVASEDGDEEGSFDEDDEDEDDEDDEGEEDDRNSSTIFIRNLPFTTTDESLYEHFKQFGPLRYAQRPRGTGFVCFWKAEDAIECLRGAPRQVDAGKEDAHSKKHSTSIKQSVLQNDMLDPSGKYTIEDRVLNVTLAVSKTEANKLTEEGVSRRSERDKDRRRLFLLNEGTINTSSPLYKKLAPSEIKMREDSLKQRQNLIKNNPTLHLSLTRLSIRNIPRSVTSKDLKALAREAVVGFAKDAKEGRRQPLSTDELSRDSEETKVDDKRRREKGKGIVKQAKIVFEGRDGSKIEEKTGAGRSRGYGFVEYYTHRHALMGLRWLNGHVVQVKSRDGDTEKKKRLIVEFAIENAQVVKRRKEFQERARNKQEEGAEKGGDNGKRGMKRKRPEGRPNNKGDKTKDKKVDADEDEDEDQKNKIAKRNRIIARKRQQRRQRKGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.65
3 0.64
4 0.6
5 0.53
6 0.45
7 0.39
8 0.31
9 0.27
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.22
14 0.23
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.17
21 0.21
22 0.21
23 0.24
24 0.32
25 0.32
26 0.36
27 0.43
28 0.5
29 0.52
30 0.6
31 0.68
32 0.65
33 0.67
34 0.64
35 0.64
36 0.6
37 0.57
38 0.53
39 0.44
40 0.38
41 0.35
42 0.35
43 0.29
44 0.26
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.17
54 0.16
55 0.19
56 0.21
57 0.23
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.21
62 0.23
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.21
68 0.21
69 0.27
70 0.28
71 0.26
72 0.26
73 0.26
74 0.25
75 0.26
76 0.28
77 0.25
78 0.23
79 0.24
80 0.26
81 0.24
82 0.22
83 0.2
84 0.17
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.17
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.21
106 0.25
107 0.32
108 0.4
109 0.45
110 0.52
111 0.53
112 0.57
113 0.59
114 0.56
115 0.55
116 0.5
117 0.5
118 0.53
119 0.54
120 0.55
121 0.54
122 0.52
123 0.47
124 0.43
125 0.32
126 0.29
127 0.26
128 0.22
129 0.25
130 0.26
131 0.28
132 0.27
133 0.28
134 0.28
135 0.35
136 0.41
137 0.44
138 0.53
139 0.58
140 0.65
141 0.73
142 0.77
143 0.79
144 0.79
145 0.78
146 0.71
147 0.7
148 0.64
149 0.61
150 0.57
151 0.52
152 0.52
153 0.49
154 0.48
155 0.42
156 0.44
157 0.4
158 0.36
159 0.32
160 0.25
161 0.22
162 0.21
163 0.2
164 0.18
165 0.15
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.17
173 0.2
174 0.22
175 0.29
176 0.38
177 0.4
178 0.47
179 0.54
180 0.51
181 0.56
182 0.57
183 0.54
184 0.46
185 0.44
186 0.37
187 0.32
188 0.29
189 0.2
190 0.17
191 0.12
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.17
197 0.2
198 0.23
199 0.28
200 0.25
201 0.25
202 0.26
203 0.28
204 0.3
205 0.27
206 0.24
207 0.23
208 0.21
209 0.19
210 0.2
211 0.16
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.17
315 0.17
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.17
320 0.2
321 0.24
322 0.25
323 0.28
324 0.33
325 0.39
326 0.45
327 0.46
328 0.47
329 0.45
330 0.41
331 0.41
332 0.37
333 0.31
334 0.27
335 0.28
336 0.25
337 0.23
338 0.22
339 0.17
340 0.17
341 0.15
342 0.14
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.19
361 0.17
362 0.2
363 0.21
364 0.21
365 0.21
366 0.26
367 0.3
368 0.3
369 0.36
370 0.42
371 0.44
372 0.47
373 0.48
374 0.44
375 0.43
376 0.39
377 0.31
378 0.23
379 0.19
380 0.15
381 0.13
382 0.1
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.12
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.16
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.13
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.17
409 0.16
410 0.17
411 0.15
412 0.17
413 0.18
414 0.18
415 0.2
416 0.23
417 0.28
418 0.35
419 0.45
420 0.51
421 0.59
422 0.65
423 0.69
424 0.68
425 0.68
426 0.61
427 0.59
428 0.53
429 0.44
430 0.38
431 0.33
432 0.3
433 0.25
434 0.23
435 0.14
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.12
440 0.13
441 0.16
442 0.18
443 0.22
444 0.29
445 0.3
446 0.33
447 0.4
448 0.44
449 0.43
450 0.41
451 0.39
452 0.35
453 0.37
454 0.41
455 0.42
456 0.43
457 0.41
458 0.48
459 0.51
460 0.56
461 0.6
462 0.61
463 0.58
464 0.57
465 0.58
466 0.51
467 0.48
468 0.41
469 0.34
470 0.29
471 0.23
472 0.2
473 0.21
474 0.23
475 0.22
476 0.23
477 0.28
478 0.29
479 0.35
480 0.34
481 0.32
482 0.33
483 0.37
484 0.38
485 0.38
486 0.36
487 0.31
488 0.32
489 0.36
490 0.33
491 0.3
492 0.29
493 0.24
494 0.21
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.14
499 0.12
500 0.1
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.14
505 0.15
506 0.24
507 0.29
508 0.35
509 0.4
510 0.4
511 0.41
512 0.47
513 0.48
514 0.42
515 0.41
516 0.37
517 0.32
518 0.34
519 0.32
520 0.26
521 0.22
522 0.2
523 0.18
524 0.18
525 0.2
526 0.25
527 0.32
528 0.39
529 0.46
530 0.55
531 0.64
532 0.69
533 0.7
534 0.72
535 0.74
536 0.77
537 0.77
538 0.78
539 0.76
540 0.7
541 0.71
542 0.65
543 0.57
544 0.49
545 0.43
546 0.33
547 0.27
548 0.3
549 0.23
550 0.25
551 0.24
552 0.25
553 0.29
554 0.28
555 0.27
556 0.26
557 0.25
558 0.25
559 0.32
560 0.32
561 0.27
562 0.28
563 0.29
564 0.29
565 0.3
566 0.29
567 0.23
568 0.2
569 0.21
570 0.22
571 0.22
572 0.23
573 0.25
574 0.24
575 0.22
576 0.21
577 0.21
578 0.24
579 0.25
580 0.3
581 0.28
582 0.28
583 0.28
584 0.28
585 0.28
586 0.23
587 0.23
588 0.19
589 0.19
590 0.22
591 0.24
592 0.26
593 0.26
594 0.25
595 0.26
596 0.25
597 0.33
598 0.4
599 0.48
600 0.54
601 0.57
602 0.59
603 0.6
604 0.61
605 0.59
606 0.53
607 0.49
608 0.42
609 0.39
610 0.39
611 0.34
612 0.29
613 0.24
614 0.22
615 0.22
616 0.25
617 0.31
618 0.35
619 0.41
620 0.49
621 0.58
622 0.65
623 0.69
624 0.76
625 0.77
626 0.82
627 0.86
628 0.81
629 0.71
630 0.68
631 0.64
632 0.6
633 0.58
634 0.52
635 0.43
636 0.4
637 0.42
638 0.42
639 0.37
640 0.32
641 0.31
642 0.34
643 0.4
644 0.48
645 0.55
646 0.59
647 0.67
648 0.75
649 0.8
650 0.84
651 0.87
652 0.91
653 0.91
654 0.91
655 0.92
656 0.92
657 0.89
658 0.86
659 0.83
660 0.83
661 0.8
662 0.81
663 0.8
664 0.75
665 0.74
666 0.73
667 0.75
668 0.68
669 0.66
670 0.58
671 0.53
672 0.5
673 0.45
674 0.39
675 0.3
676 0.26
677 0.24
678 0.27
679 0.27
680 0.33
681 0.41
682 0.5
683 0.58
684 0.68
685 0.73
686 0.78
687 0.83
688 0.85
689 0.87
690 0.88
691 0.89
692 0.89
693 0.91
694 0.92
695 0.93