FuNGI

A0A2G7G878

Protein Details

Accession

A0A2G7G878

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-86	DESQFTRPVRLQRRDPRARSHEMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
326-348	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
403-423	SGRPKHIDPLKKSTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.833, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPHPEREKPSSSGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSEKSQGMQKTMSESSHQMDEVEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANLPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKCGEVYGKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEAERLKEEERKAEEEKNKKDATASSKGNNTPSGRPKHIDPLKKSTAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKDLSSQPTPQPSSRNMSPVASSQMPLGKKRVRNVPLGGAGSGSDADGGAGSGGEMSESGKTKKLKLNPPALSQGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVRAGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRLVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.34
3	0.32
4	0.28
5	0.21
6	0.19
7	0.16
8	0.15
9	0.11
10	0.11
11	0.11
12	0.09
13	0.1
14	0.1
15	0.14
16	0.17
17	0.18
18	0.17
19	0.16
20	0.16
21	0.2
22	0.22
23	0.2
24	0.23
25	0.28
26	0.35
27	0.39
28	0.41
29	0.43
30	0.49
31	0.55
32	0.59
33	0.61
34	0.57
35	0.55
36	0.58
37	0.53
38	0.53
39	0.52
40	0.48
41	0.47
42	0.46
43	0.52
44	0.54
45	0.62
46	0.59
47	0.57
48	0.57
49	0.59
50	0.61
51	0.57
52	0.54
53	0.52
54	0.49
55	0.5
56	0.49
57	0.49
58	0.55
59	0.61
60	0.65
61	0.68
62	0.78
63	0.81
64	0.82
65	0.83
66	0.81
67	0.81
68	0.75
69	0.7
70	0.67
71	0.62
72	0.62
73	0.57
74	0.55
75	0.46
76	0.46
77	0.45
78	0.4
79	0.38
80	0.34
81	0.3
82	0.3
83	0.32
84	0.29
85	0.27
86	0.27
87	0.26
88	0.26
89	0.25
90	0.2
91	0.19
92	0.2
93	0.19
94	0.18
95	0.15
96	0.14
97	0.16
98	0.17
99	0.17
100	0.18
101	0.17
102	0.21
103	0.26
104	0.31
105	0.37
106	0.43
107	0.46
108	0.52
109	0.59
110	0.56
111	0.54
112	0.52
113	0.46
114	0.41
115	0.36
116	0.27
117	0.2
118	0.17
119	0.15
120	0.11
121	0.11
122	0.09
123	0.12
124	0.14
125	0.16
126	0.22
127	0.27
128	0.36
129	0.45
130	0.52
131	0.59
132	0.66
133	0.72
134	0.73
135	0.75
136	0.73
137	0.69
138	0.67
139	0.6
140	0.55
141	0.5
142	0.44
143	0.4
144	0.34
145	0.28
146	0.25
147	0.25
148	0.24
149	0.25
150	0.25
151	0.24
152	0.25
153	0.25
154	0.23
155	0.24
156	0.29
157	0.3
158	0.32
159	0.3
160	0.29
161	0.28
162	0.26
163	0.23
164	0.19
165	0.2
166	0.2
167	0.21
168	0.2
169	0.2
170	0.2
171	0.2
172	0.17
173	0.14
174	0.1
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.11
198	0.12
199	0.15
200	0.17
201	0.18
202	0.18
203	0.18
204	0.2
205	0.18
206	0.22
207	0.26
208	0.24
209	0.28
210	0.33
211	0.38
212	0.44
213	0.5
214	0.5
215	0.5
216	0.51
217	0.51
218	0.55
219	0.53
220	0.45
221	0.46
222	0.49
223	0.45
224	0.45
225	0.46
226	0.38
227	0.36
228	0.38
229	0.34
230	0.29
231	0.3
232	0.37
233	0.4
234	0.46
235	0.45
236	0.43
237	0.44
238	0.48
239	0.46
240	0.47
241	0.45
242	0.41
243	0.44
244	0.44
245	0.4
246	0.34
247	0.31
248	0.22
249	0.15
250	0.11
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.05
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.06
283	0.08
284	0.11
285	0.13
286	0.17
287	0.23
288	0.3
289	0.32
290	0.39
291	0.45
292	0.5
293	0.51
294	0.48
295	0.43
296	0.39
297	0.37
298	0.3
299	0.25
300	0.18
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.19
310	0.21
311	0.23
312	0.28
313	0.28
314	0.33
315	0.39
316	0.44
317	0.47
318	0.53
319	0.55
320	0.58
321	0.62
322	0.63
323	0.64
324	0.64
325	0.62
326	0.6
327	0.62
328	0.6
329	0.63
330	0.67
331	0.68
332	0.71
333	0.71
334	0.74
335	0.71
336	0.67
337	0.61
338	0.57
339	0.48
340	0.41
341	0.38
342	0.3
343	0.27
344	0.24
345	0.21
346	0.16
347	0.14
348	0.12
349	0.12
350	0.1
351	0.11
352	0.1
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.12
357	0.1
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.16
365	0.17
366	0.22
367	0.24
368	0.28
369	0.31
370	0.38
371	0.44
372	0.47
373	0.51
374	0.53
375	0.5
376	0.45
377	0.44
378	0.41
379	0.4
380	0.39
381	0.37
382	0.33
383	0.38
384	0.4
385	0.4
386	0.4
387	0.36
388	0.35
389	0.41
390	0.44
391	0.42
392	0.42
393	0.42
394	0.48
395	0.52
396	0.54
397	0.51
398	0.53
399	0.55
400	0.54
401	0.52
402	0.48
403	0.5
404	0.52
405	0.53
406	0.52
407	0.51
408	0.53
409	0.55
410	0.53
411	0.49
412	0.47
413	0.43
414	0.42
415	0.39
416	0.36
417	0.34
418	0.29
419	0.3
420	0.23
421	0.21
422	0.2
423	0.21
424	0.23
425	0.3
426	0.33
427	0.33
428	0.39
429	0.49
430	0.54
431	0.58
432	0.65
433	0.7
434	0.74
435	0.73
436	0.74
437	0.67
438	0.64
439	0.61
440	0.53
441	0.48
442	0.44
443	0.47
444	0.41
445	0.4
446	0.35
447	0.33
448	0.32
449	0.29
450	0.3
451	0.24
452	0.21
453	0.19
454	0.23
455	0.24
456	0.25
457	0.3
458	0.32
459	0.36
460	0.42
461	0.5
462	0.49
463	0.53
464	0.54
465	0.53
466	0.51
467	0.48
468	0.41
469	0.31
470	0.27
471	0.21
472	0.18
473	0.11
474	0.06
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.04
487	0.07
488	0.1
489	0.11
490	0.17
491	0.2
492	0.26
493	0.33
494	0.42
495	0.48
496	0.55
497	0.64
498	0.64
499	0.67
500	0.67
501	0.61
502	0.53
503	0.43
504	0.39
505	0.34
506	0.3
507	0.25
508	0.2
509	0.22
510	0.21
511	0.21
512	0.19
513	0.16
514	0.17
515	0.17
516	0.19
517	0.19
518	0.21
519	0.21
520	0.2
521	0.19
522	0.21
523	0.22
524	0.21
525	0.23
526	0.22
527	0.22
528	0.26
529	0.29
530	0.3
531	0.33
532	0.36
533	0.36
534	0.37
535	0.37
536	0.38
537	0.35
538	0.34
539	0.33
540	0.37
541	0.34
542	0.36
543	0.36
544	0.38
545	0.41
546	0.43
547	0.42
548	0.4
549	0.43
550	0.42
551	0.41
552	0.34
553	0.34
554	0.3
555	0.28
556	0.26
557	0.21
558	0.2
559	0.22
560	0.23
561	0.19
562	0.18
563	0.17
564	0.13
565	0.12
566	0.11
567	0.1
568	0.09
569	0.11
570	0.15
571	0.16
572	0.16
573	0.19
574	0.23
575	0.25
576	0.26
577	0.28
578	0.28
579	0.36
580	0.43
581	0.48
582	0.48
583	0.56
584	0.65
585	0.64
586	0.63
587	0.55
588	0.49
589	0.44
590	0.48
591	0.45
592	0.38
593	0.37
594	0.35
595	0.35
596	0.34
597	0.33
598	0.25
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.22
603	0.21
604	0.23

A0A2G7G878

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer