Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H0ZD17

Protein Details
Accession A0A2H0ZD17    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MATVIPPPTKRQKKTLQESQEAKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 10.333, cyto_nucl 8.333, mito 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR001632  Gprotein_B  
IPR012972  NLE  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0110136  P:protein-RNA complex remodeling  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF08154  NLE  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MATVIPPPTKRQKKTLQESQEAKIIPDDVPNVLIRFKAADSGEMVGGSLRVPGGITEKQLEELLNTLNKDSDDPTPYSFALLKESTQSNNQTELVDIVDDLYHSVLKPGHKSAEDFMTIVFTPQTVFKVRPITRSNNAIAGHGSTILCCQFAPNDSGRMCSGAGDSTARIWDCNTQTPFKKLQGHSSWILCVSYSPCGTMIATGSMDNSVRLWDSDTGEALGGPLLGHYKWISSIAWEPLHLVDEGQKPRLATGSKDGTVKVWDSTRRICLYTMSGHTNAVSCVAWSGSNIIYSASHDKTIRAWDVDAMGKCIQTLKSHAHWVNHLSLSTDYVLRKGGFDHQSSRQTPKTVSAQELRKRAKEAYEKVAKVGGSISERLVTASDDFTMYFWEPLKSSKPVCRMTGHQKLVNHVAFSPDGRYIVSSSFDNSIKLWDGLTGKFLGTFRGHVAAVYQTAWSADNRLLVSCSKDTTLKVWDVKSRKLVTDLPGHSDEVYSVDWSLDGKKVASGGKDKMIRLWSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.85
3 0.83
4 0.83
5 0.83
6 0.76
7 0.72
8 0.61
9 0.52
10 0.43
11 0.35
12 0.26
13 0.24
14 0.23
15 0.18
16 0.19
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.18
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.2
29 0.2
30 0.17
31 0.17
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.08
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.12
41 0.13
42 0.16
43 0.18
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.21
60 0.23
61 0.25
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.26
66 0.22
67 0.23
68 0.22
69 0.2
70 0.21
71 0.24
72 0.24
73 0.27
74 0.32
75 0.29
76 0.31
77 0.32
78 0.27
79 0.26
80 0.24
81 0.19
82 0.13
83 0.11
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.09
92 0.11
93 0.14
94 0.18
95 0.21
96 0.25
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.29
102 0.25
103 0.21
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.14
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.17
115 0.27
116 0.29
117 0.36
118 0.41
119 0.46
120 0.48
121 0.53
122 0.5
123 0.46
124 0.44
125 0.37
126 0.32
127 0.26
128 0.21
129 0.17
130 0.15
131 0.09
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.13
140 0.13
141 0.19
142 0.18
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.15
148 0.14
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.15
159 0.16
160 0.24
161 0.26
162 0.3
163 0.32
164 0.37
165 0.4
166 0.41
167 0.47
168 0.41
169 0.48
170 0.47
171 0.49
172 0.47
173 0.44
174 0.39
175 0.3
176 0.29
177 0.19
178 0.15
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.08
208 0.06
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.09
230 0.11
231 0.16
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.21
238 0.17
239 0.12
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.21
244 0.21
245 0.19
246 0.19
247 0.19
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.17
252 0.19
253 0.23
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.14
267 0.12
268 0.09
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.19
288 0.19
289 0.15
290 0.15
291 0.13
292 0.15
293 0.19
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.15
303 0.17
304 0.19
305 0.27
306 0.3
307 0.29
308 0.3
309 0.32
310 0.32
311 0.29
312 0.26
313 0.2
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.12
319 0.12
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.19
325 0.21
326 0.23
327 0.27
328 0.31
329 0.38
330 0.41
331 0.45
332 0.4
333 0.38
334 0.37
335 0.37
336 0.39
337 0.34
338 0.36
339 0.38
340 0.44
341 0.48
342 0.56
343 0.55
344 0.5
345 0.51
346 0.48
347 0.49
348 0.49
349 0.48
350 0.49
351 0.53
352 0.51
353 0.49
354 0.5
355 0.41
356 0.32
357 0.28
358 0.21
359 0.15
360 0.16
361 0.15
362 0.13
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.15
380 0.2
381 0.21
382 0.25
383 0.3
384 0.38
385 0.41
386 0.44
387 0.45
388 0.48
389 0.53
390 0.6
391 0.58
392 0.54
393 0.51
394 0.52
395 0.56
396 0.51
397 0.42
398 0.32
399 0.29
400 0.26
401 0.25
402 0.23
403 0.16
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.18
414 0.17
415 0.16
416 0.18
417 0.18
418 0.18
419 0.16
420 0.15
421 0.17
422 0.17
423 0.19
424 0.17
425 0.14
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.18
431 0.17
432 0.19
433 0.19
434 0.16
435 0.18
436 0.16
437 0.16
438 0.14
439 0.13
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.18
451 0.23
452 0.22
453 0.22
454 0.21
455 0.23
456 0.23
457 0.25
458 0.29
459 0.31
460 0.34
461 0.37
462 0.43
463 0.46
464 0.51
465 0.57
466 0.55
467 0.51
468 0.51
469 0.51
470 0.48
471 0.52
472 0.48
473 0.45
474 0.44
475 0.42
476 0.37
477 0.33
478 0.28
479 0.2
480 0.19
481 0.14
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.14
487 0.14
488 0.15
489 0.14
490 0.15
491 0.18
492 0.21
493 0.26
494 0.3
495 0.31
496 0.38
497 0.43
498 0.42
499 0.45