Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7WSF6

Protein Details
Accession A0A2B7WSF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-88VNGANNRQPTRPRREPQKPGDPASRVHydrophilic
404-424EDPRHRNKPPSPKTRRRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
409-419RNKPPSPKTRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKPPAPKIKRPAPSFIQTGINGAKPSQPSPSPLSLASSRVASAKQPGTATPTSATAVNGANNRQPTRPRREPQKPGDPASRVQRLSIKPPSADGAAIDRKQLKKFPEPYVKTTSYILKKYSKVPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIKAGTVPHDMIEELVRGGVRFYENCLIVRVVDHKSISTQPSPSSNASSGEKSSPFSLHNYNQHITPSPFVPYPQQNQSKIKPTTNGLSTDSSQKADEQPSSETNKDSAAPNGITAGSAGSKQSALKPRVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRTVNRRQPQPYSASRTGSAAQPPTPLSALPSSPITDRAPPAKRQKMMVEPSELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDGLAASANLLKFLEDPRHRNKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPSTSGNSGAAKAPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRLEHEEKAKIEHEKKLQQDHAKRLQQEAEREKRRATEQRLAEEQSREDSRRQAAAAQHVQVQAQAQLLAAQNRRPQSRGNPPMGMPHQPQPQQMVPASQGQQSSPLVRNITPHSSSPMTGNLMGPQMNQGIPMAMTSSAQGAGSPLQVTSGVQHSHPAVMGHPMVTTRSQQGPSRHGTPQMAHGTPAMSHATPIMRNATPTQRMTHASPNASTMVQTPVMNHAIMANPQMNGVMMTPQQQQQAILQQRQQLMMQRNLQAQAQASGQQFTPQQMAQLQLQANMHAQHNIQNAQQQQHPNIFMQQQAQAQAQAQAQAQQQQQQQQVQQQQVQQNQFPNAAAYQAHAMRSQLAQMQMSQPQAPHGQQQGTPQQLPQQQVMAQANGVGAQGQGALPPRYRLLYTQRMLPQAQTEVRTKFMQQFGHPSNWHEAIRQQYQEQVEKTSKQYLLEFMKREGQQRAQQAQAQAQAQAQAQAQVIQHQQQQQQQQQQQQQAMMGNGIGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.77
4 0.78
5 0.75
6 0.73
7 0.67
8 0.6
9 0.56
10 0.47
11 0.47
12 0.41
13 0.37
14 0.31
15 0.28
16 0.3
17 0.27
18 0.28
19 0.3
20 0.29
21 0.31
22 0.37
23 0.4
24 0.38
25 0.36
26 0.39
27 0.35
28 0.35
29 0.32
30 0.26
31 0.22
32 0.22
33 0.22
34 0.19
35 0.25
36 0.26
37 0.28
38 0.28
39 0.28
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.27
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.17
49 0.18
50 0.2
51 0.22
52 0.23
53 0.27
54 0.32
55 0.35
56 0.38
57 0.45
58 0.5
59 0.57
60 0.65
61 0.69
62 0.74
63 0.82
64 0.87
65 0.88
66 0.89
67 0.86
68 0.83
69 0.82
70 0.75
71 0.7
72 0.69
73 0.67
74 0.57
75 0.53
76 0.54
77 0.5
78 0.55
79 0.57
80 0.53
81 0.45
82 0.47
83 0.46
84 0.39
85 0.35
86 0.27
87 0.26
88 0.29
89 0.29
90 0.32
91 0.35
92 0.38
93 0.43
94 0.47
95 0.46
96 0.48
97 0.55
98 0.6
99 0.65
100 0.66
101 0.68
102 0.72
103 0.68
104 0.59
105 0.55
106 0.54
107 0.5
108 0.49
109 0.48
110 0.46
111 0.47
112 0.52
113 0.59
114 0.57
115 0.55
116 0.55
117 0.58
118 0.58
119 0.6
120 0.57
121 0.5
122 0.49
123 0.47
124 0.46
125 0.42
126 0.38
127 0.39
128 0.36
129 0.35
130 0.33
131 0.33
132 0.39
133 0.36
134 0.39
135 0.37
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.28
141 0.27
142 0.22
143 0.19
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.14
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.22
176 0.21
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.21
185 0.25
186 0.28
187 0.27
188 0.26
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.32
193 0.32
194 0.29
195 0.29
196 0.3
197 0.3
198 0.28
199 0.27
200 0.26
201 0.24
202 0.24
203 0.23
204 0.21
205 0.23
206 0.27
207 0.3
208 0.36
209 0.4
210 0.39
211 0.39
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.24
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.32
223 0.39
224 0.45
225 0.48
226 0.54
227 0.58
228 0.62
229 0.6
230 0.58
231 0.52
232 0.49
233 0.48
234 0.45
235 0.42
236 0.36
237 0.34
238 0.32
239 0.35
240 0.33
241 0.28
242 0.25
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.26
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.31
251 0.31
252 0.28
253 0.25
254 0.24
255 0.24
256 0.22
257 0.19
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.15
273 0.23
274 0.26
275 0.3
276 0.33
277 0.34
278 0.39
279 0.39
280 0.33
281 0.31
282 0.39
283 0.35
284 0.34
285 0.32
286 0.28
287 0.28
288 0.29
289 0.22
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.15
305 0.21
306 0.27
307 0.36
308 0.43
309 0.51
310 0.55
311 0.58
312 0.59
313 0.6
314 0.61
315 0.59
316 0.56
317 0.49
318 0.44
319 0.41
320 0.38
321 0.34
322 0.3
323 0.23
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.18
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.16
338 0.15
339 0.16
340 0.18
341 0.25
342 0.28
343 0.35
344 0.44
345 0.49
346 0.49
347 0.49
348 0.52
349 0.53
350 0.54
351 0.49
352 0.43
353 0.36
354 0.35
355 0.33
356 0.28
357 0.19
358 0.15
359 0.12
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.16
391 0.19
392 0.25
393 0.32
394 0.42
395 0.43
396 0.49
397 0.55
398 0.58
399 0.64
400 0.69
401 0.73
402 0.74
403 0.79
404 0.82
405 0.82
406 0.76
407 0.72
408 0.65
409 0.62
410 0.54
411 0.48
412 0.39
413 0.32
414 0.26
415 0.2
416 0.15
417 0.07
418 0.05
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.1
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.06
456 0.06
457 0.05
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.12
462 0.16
463 0.22
464 0.23
465 0.28
466 0.34
467 0.39
468 0.45
469 0.45
470 0.44
471 0.4
472 0.46
473 0.44
474 0.41
475 0.38
476 0.35
477 0.33
478 0.33
479 0.34
480 0.31
481 0.32
482 0.32
483 0.33
484 0.34
485 0.37
486 0.4
487 0.43
488 0.46
489 0.49
490 0.52
491 0.55
492 0.54
493 0.52
494 0.48
495 0.48
496 0.43
497 0.45
498 0.46
499 0.46
500 0.47
501 0.48
502 0.46
503 0.43
504 0.46
505 0.47
506 0.45
507 0.43
508 0.41
509 0.44
510 0.46
511 0.46
512 0.42
513 0.36
514 0.29
515 0.25
516 0.24
517 0.22
518 0.2
519 0.21
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.2
524 0.2
525 0.25
526 0.27
527 0.24
528 0.25
529 0.24
530 0.24
531 0.21
532 0.19
533 0.13
534 0.1
535 0.09
536 0.06
537 0.08
538 0.09
539 0.13
540 0.13
541 0.15
542 0.19
543 0.23
544 0.24
545 0.23
546 0.25
547 0.29
548 0.39
549 0.44
550 0.44
551 0.43
552 0.42
553 0.47
554 0.46
555 0.43
556 0.34
557 0.33
558 0.34
559 0.35
560 0.35
561 0.34
562 0.32
563 0.31
564 0.29
565 0.25
566 0.2
567 0.22
568 0.22
569 0.2
570 0.19
571 0.16
572 0.18
573 0.18
574 0.19
575 0.18
576 0.19
577 0.18
578 0.18
579 0.21
580 0.22
581 0.26
582 0.24
583 0.22
584 0.24
585 0.23
586 0.23
587 0.22
588 0.21
589 0.18
590 0.17
591 0.16
592 0.13
593 0.14
594 0.13
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.06
614 0.07
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.12
629 0.09
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.11
637 0.12
638 0.13
639 0.17
640 0.2
641 0.25
642 0.29
643 0.33
644 0.36
645 0.39
646 0.38
647 0.37
648 0.36
649 0.32
650 0.35
651 0.36
652 0.31
653 0.27
654 0.26
655 0.23
656 0.21
657 0.22
658 0.16
659 0.1
660 0.1
661 0.11
662 0.12
663 0.12
664 0.14
665 0.16
666 0.14
667 0.16
668 0.19
669 0.24
670 0.28
671 0.29
672 0.3
673 0.29
674 0.32
675 0.33
676 0.38
677 0.36
678 0.33
679 0.32
680 0.32
681 0.3
682 0.27
683 0.24
684 0.17
685 0.15
686 0.15
687 0.15
688 0.13
689 0.16
690 0.17
691 0.17
692 0.15
693 0.13
694 0.12
695 0.13
696 0.15
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.11
701 0.1
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.11
707 0.13
708 0.16
709 0.18
710 0.18
711 0.18
712 0.18
713 0.26
714 0.29
715 0.31
716 0.31
717 0.34
718 0.36
719 0.36
720 0.36
721 0.34
722 0.34
723 0.37
724 0.38
725 0.37
726 0.38
727 0.38
728 0.37
729 0.32
730 0.26
731 0.22
732 0.18
733 0.2
734 0.18
735 0.18
736 0.17
737 0.18
738 0.18
739 0.18
740 0.2
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.19
745 0.17
746 0.21
747 0.2
748 0.21
749 0.21
750 0.2
751 0.21
752 0.2
753 0.2
754 0.17
755 0.17
756 0.19
757 0.22
758 0.23
759 0.22
760 0.25
761 0.28
762 0.29
763 0.33
764 0.33
765 0.33
766 0.35
767 0.36
768 0.32
769 0.33
770 0.31
771 0.28
772 0.27
773 0.27
774 0.24
775 0.25
776 0.25
777 0.22
778 0.21
779 0.23
780 0.21
781 0.2
782 0.18
783 0.2
784 0.21
785 0.26
786 0.27
787 0.29
788 0.32
789 0.36
790 0.41
791 0.41
792 0.43
793 0.44
794 0.49
795 0.48
796 0.49
797 0.49
798 0.5
799 0.53
800 0.54
801 0.5
802 0.48
803 0.46
804 0.42
805 0.36
806 0.31
807 0.24
808 0.21
809 0.17
810 0.13
811 0.15
812 0.16
813 0.17
814 0.16
815 0.16
816 0.17
817 0.17
818 0.18
819 0.17
820 0.17
821 0.17
822 0.18
823 0.21
824 0.23
825 0.25
826 0.24
827 0.21
828 0.22
829 0.26
830 0.25
831 0.27
832 0.29
833 0.3
834 0.3
835 0.38
836 0.42
837 0.44
838 0.43
839 0.38
840 0.41
841 0.42
842 0.43
843 0.38
844 0.33
845 0.28
846 0.34
847 0.35
848 0.29
849 0.24
850 0.22
851 0.2
852 0.17
853 0.16
854 0.09
855 0.06
856 0.05
857 0.06
858 0.05
859 0.07
860 0.11
861 0.14
862 0.15
863 0.17
864 0.19
865 0.21
866 0.22
867 0.26
868 0.3
869 0.38
870 0.38
871 0.45
872 0.48
873 0.5
874 0.5
875 0.46
876 0.41
877 0.38
878 0.4
879 0.36
880 0.37
881 0.34
882 0.37
883 0.37
884 0.36
885 0.37
886 0.39
887 0.39
888 0.37
889 0.45
890 0.46
891 0.52
892 0.5
893 0.47
894 0.47
895 0.47
896 0.45
897 0.37
898 0.37
899 0.37
900 0.43
901 0.42
902 0.37
903 0.38
904 0.43
905 0.48
906 0.44
907 0.43
908 0.41
909 0.42
910 0.45
911 0.47
912 0.43
913 0.39
914 0.39
915 0.4
916 0.44
917 0.47
918 0.46
919 0.42
920 0.48
921 0.49
922 0.52
923 0.52
924 0.51
925 0.5
926 0.57
927 0.59
928 0.56
929 0.57
930 0.56
931 0.54
932 0.51
933 0.46
934 0.38
935 0.33
936 0.31
937 0.27
938 0.26
939 0.22
940 0.19
941 0.18
942 0.2
943 0.19
944 0.22
945 0.25
946 0.27
947 0.32
948 0.36
949 0.41
950 0.44
951 0.53
952 0.56
953 0.63
954 0.65
955 0.69
956 0.7
957 0.72
958 0.69
959 0.62
960 0.56
961 0.49
962 0.43
963 0.34