FuNGI

B8MSD2

Protein Details

Accession

B8MSD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-458	GEGTSQKKSRRPRKPIGDKVVDK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
319-357	KPKGRRLMRGPRPGATSSEASPAPEAAPKPKGRLIQRKD
442-450	KKSRRPRKP

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR038718 SNF2-like_sf IPR000330 SNF2_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0140658 F:ATP-dependent chromatin remodeler activity GO:0004386 F:helicase activity GO:0016787 F:hydrolase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00271 Helicase_C PF00176 SNF2-rel_dom
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18793 SF2_C_SNF

Amino Acid Sequences

MEESVPDTPSLRRDVDDTDTVATVLIAPKTQQTPLSQRYTQPTQIIDRTPNEAKSVVQVAASSPAGPATSPSRPRGGMLANLMAPSGTQFRAPTIPQPQKRAPVLSDDEGPNYAGGSSDEDELSIATNIKPRILSKTPSRSPEKIMESPISNNTGSQTAFKDIAARFAYQPGSKRSSEHLDQSFDSAKKFKQTTISRAIPVDDDNSNIFDEIKTIEDIEDNRMRNFVTRLLSLFPSFTIQEGLRAFMKSSGNFDRACEQIAEQEDLDRVSSPDELTTTTHPREHMNTAKQNIKSKQKILEKYTANVQRKDIPEVQDDPKPKGRRLMRGPRPGATSSEASPAPEAAPKPKGRLIQRKDLKRHDSPEEESMASESESDASSEEDNSEIETKVLKFINTCTVPALADLAATPESIATIIINARPFRTLNAVRAVTDNAGEGTSQKKSRRPRKPIGDKVVDKAVEMMKGYEACDALVAHCESLGKPLAAEMKQWGIDIFGNKGNGELELVSLDHDSGIGTPTTDDGDEVVTHGGRKSRFVSQPSIISPDYTLKNYQIVGINWLTLLFHKQLSCILADDMGLGKTFQVIAFLAHLFEQGITGPHLIVVPASTIENWLREFSKFCPTLNVMPYYAKQQERAEIRAAIEDDRENINVVITTYTVAKAKEDSRFLRNLGFCVCVFDEGHVLKNSESKIYDQLVRIPAEFRLLLTGTPLQNNLQELVSLLGFMLPDVFSKHREDLQTIFAQKAKATDASEHATLLSAQRIARARSMIAPFVLRRKKHQVIDLPAKVSRVEYCEMNETQKEIYRQENEEVRALLADRAAGKKTGNKSAHILMKLRFTAIHPLLKRRLYNDKILGKMAKACLKEEQWSLSDPDIIFEELQPYNDFECHSMCVKHPKSLGPFTLKNQEWMNSGKIDKLCELLKKFKENGDRTLIFSQFTLVMDILEYVLETVNMRFFRLDGRTNVEDRQAILDAFYEQTDIPVFMLSTKAGGAGINLACANKVIIFDSSFNPQEDVQAENRAHRVGQTREVEVIRLVTKGTIEEQIYALGQTKLALDQRVVGDDPTESKRSEEAGMKAVEDMIAADLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.33
3	0.34
4	0.31
5	0.28
6	0.27
7	0.26
8	0.23
9	0.18
10	0.14
11	0.14
12	0.13
13	0.12
14	0.12
15	0.17
16	0.2
17	0.22
18	0.24
19	0.28
20	0.36
21	0.43
22	0.51
23	0.49
24	0.52
25	0.58
26	0.61
27	0.6
28	0.55
29	0.51
30	0.5
31	0.53
32	0.52
33	0.5
34	0.46
35	0.48
36	0.48
37	0.45
38	0.41
39	0.36
40	0.32
41	0.3
42	0.31
43	0.25
44	0.2
45	0.19
46	0.17
47	0.21
48	0.21
49	0.16
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.15
56	0.23
57	0.29
58	0.32
59	0.37
60	0.37
61	0.39
62	0.41
63	0.38
64	0.35
65	0.33
66	0.34
67	0.3
68	0.29
69	0.27
70	0.22
71	0.18
72	0.15
73	0.14
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.16
78	0.2
79	0.22
80	0.28
81	0.35
82	0.45
83	0.5
84	0.57
85	0.61
86	0.65
87	0.68
88	0.64
89	0.55
90	0.53
91	0.53
92	0.48
93	0.47
94	0.41
95	0.38
96	0.34
97	0.33
98	0.25
99	0.18
100	0.15
101	0.1
102	0.09
103	0.11
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.1
112	0.09
113	0.09
114	0.15
115	0.15
116	0.17
117	0.19
118	0.2
119	0.27
120	0.31
121	0.37
122	0.41
123	0.52
124	0.56
125	0.62
126	0.68
127	0.63
128	0.64
129	0.66
130	0.64
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.47
135	0.47
136	0.45
137	0.4
138	0.32
139	0.28
140	0.25
141	0.23
142	0.21
143	0.2
144	0.19
145	0.19
146	0.19
147	0.19
148	0.24
149	0.21
150	0.28
151	0.27
152	0.26
153	0.24
154	0.27
155	0.31
156	0.27
157	0.33
158	0.32
159	0.35
160	0.34
161	0.36
162	0.37
163	0.42
164	0.42
165	0.45
166	0.43
167	0.42
168	0.42
169	0.44
170	0.44
171	0.37
172	0.36
173	0.31
174	0.29
175	0.33
176	0.34
177	0.33
178	0.36
179	0.42
180	0.48
181	0.53
182	0.56
183	0.51
184	0.5
185	0.48
186	0.4
187	0.34
188	0.3
189	0.21
190	0.18
191	0.16
192	0.17
193	0.16
194	0.15
195	0.14
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.1
202	0.1
203	0.12
204	0.13
205	0.19
206	0.23
207	0.23
208	0.23
209	0.23
210	0.23
211	0.24
212	0.25
213	0.23
214	0.21
215	0.21
216	0.22
217	0.24
218	0.26
219	0.23
220	0.22
221	0.17
222	0.16
223	0.15
224	0.14
225	0.14
226	0.12
227	0.16
228	0.16
229	0.18
230	0.17
231	0.17
232	0.17
233	0.19
234	0.22
235	0.19
236	0.24
237	0.27
238	0.28
239	0.28
240	0.29
241	0.28
242	0.25
243	0.26
244	0.21
245	0.16
246	0.18
247	0.2
248	0.2
249	0.17
250	0.17
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.12
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.12
263	0.16
264	0.2
265	0.22
266	0.24
267	0.24
268	0.26
269	0.29
270	0.34
271	0.37
272	0.4
273	0.45
274	0.48
275	0.54
276	0.56
277	0.6
278	0.6
279	0.62
280	0.6
281	0.58
282	0.62
283	0.64
284	0.67
285	0.65
286	0.66
287	0.59
288	0.54
289	0.59
290	0.59
291	0.55
292	0.5
293	0.46
294	0.45
295	0.45
296	0.49
297	0.44
298	0.38
299	0.37
300	0.4
301	0.4
302	0.39
303	0.39
304	0.38
305	0.42
306	0.42
307	0.39
308	0.43
309	0.46
310	0.51
311	0.59
312	0.65
313	0.66
314	0.73
315	0.74
316	0.69
317	0.67
318	0.59
319	0.51
320	0.44
321	0.36
322	0.27
323	0.27
324	0.24
325	0.2
326	0.19
327	0.16
328	0.14
329	0.15
330	0.14
331	0.15
332	0.22
333	0.23
334	0.26
335	0.3
336	0.36
337	0.42
338	0.52
339	0.53
340	0.57
341	0.64
342	0.7
343	0.74
344	0.77
345	0.75
346	0.71
347	0.7
348	0.66
349	0.63
350	0.57
351	0.52
352	0.46
353	0.39
354	0.32
355	0.27
356	0.21
357	0.15
358	0.12
359	0.08
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.09
375	0.09
376	0.12
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.21
382	0.2
383	0.21
384	0.18
385	0.18
386	0.17
387	0.17
388	0.16
389	0.08
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.12
408	0.12
409	0.13
410	0.2
411	0.2
412	0.21
413	0.27
414	0.27
415	0.26
416	0.27
417	0.27
418	0.19
419	0.17
420	0.14
421	0.08
422	0.08
423	0.07
424	0.06
425	0.08
426	0.11
427	0.16
428	0.19
429	0.25
430	0.35
431	0.46
432	0.56
433	0.64
434	0.7
435	0.77
436	0.85
437	0.88
438	0.87
439	0.86
440	0.77
441	0.7
442	0.65
443	0.53
444	0.42
445	0.34
446	0.26
447	0.18
448	0.16
449	0.14
450	0.09
451	0.1
452	0.1
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.09
466	0.1
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.11
474	0.12
475	0.12
476	0.13
477	0.11
478	0.08
479	0.09
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.09
488	0.08
489	0.06
490	0.05
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.04
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.09
517	0.09
518	0.11
519	0.13
520	0.2
521	0.24
522	0.27
523	0.31
524	0.29
525	0.32
526	0.31
527	0.32
528	0.25
529	0.21
530	0.19
531	0.18
532	0.18
533	0.16
534	0.16
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.15
539	0.14
540	0.13
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.07
548	0.09
549	0.07
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.1
554	0.1
555	0.11
556	0.09
557	0.08
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.06
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.06
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.1
599	0.1
600	0.11
601	0.13
602	0.13
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.23
607	0.25
608	0.29
609	0.3
610	0.29
611	0.22
612	0.23
613	0.23
614	0.24
615	0.27
616	0.23
617	0.23
618	0.22
619	0.27
620	0.29
621	0.31
622	0.28
623	0.24
624	0.24
625	0.22
626	0.22
627	0.17
628	0.15
629	0.13
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.1
634	0.09
635	0.09
636	0.08
637	0.08
638	0.06
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.11
647	0.14
648	0.18
649	0.23
650	0.25
651	0.28
652	0.3
653	0.3
654	0.33
655	0.3
656	0.27
657	0.24
658	0.22
659	0.18
660	0.19
661	0.18
662	0.14
663	0.13
664	0.13
665	0.15
666	0.13
667	0.16
668	0.14
669	0.15
670	0.14
671	0.17
672	0.17
673	0.16
674	0.16
675	0.15
676	0.18
677	0.19
678	0.22
679	0.2
680	0.24
681	0.26
682	0.25
683	0.24
684	0.21
685	0.19
686	0.18
687	0.17
688	0.12
689	0.11
690	0.1
691	0.1
692	0.11
693	0.14
694	0.13
695	0.14
696	0.15
697	0.14
698	0.15
699	0.15
700	0.14
701	0.11
702	0.1
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.07
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.04
713	0.04
714	0.07
715	0.09
716	0.11
717	0.14
718	0.16
719	0.2
720	0.21
721	0.23
722	0.22
723	0.26
724	0.28
725	0.26
726	0.26
727	0.24
728	0.23
729	0.21
730	0.2
731	0.17
732	0.15
733	0.16
734	0.17
735	0.18
736	0.21
737	0.2
738	0.19
739	0.17
740	0.15
741	0.14
742	0.13
743	0.11
744	0.1
745	0.09
746	0.14
747	0.17
748	0.18
749	0.2
750	0.2
751	0.2
752	0.23
753	0.25
754	0.22
755	0.2
756	0.21
757	0.21
758	0.29
759	0.35
760	0.31
761	0.36
762	0.44
763	0.51
764	0.52
765	0.58
766	0.58
767	0.6
768	0.69
769	0.66
770	0.59
771	0.53
772	0.49
773	0.42
774	0.34
775	0.26
776	0.2
777	0.18
778	0.16
779	0.17
780	0.21
781	0.22
782	0.25
783	0.23
784	0.21
785	0.21
786	0.23
787	0.24
788	0.21
789	0.26
790	0.27
791	0.3
792	0.33
793	0.37
794	0.35
795	0.35
796	0.33
797	0.27
798	0.23
799	0.21
800	0.17
801	0.11
802	0.11
803	0.11
804	0.12
805	0.13
806	0.14
807	0.14
808	0.2
809	0.25
810	0.33
811	0.33
812	0.34
813	0.36
814	0.42
815	0.47
816	0.44
817	0.43
818	0.35
819	0.39
820	0.37
821	0.33
822	0.28
823	0.23
824	0.29
825	0.29
826	0.35
827	0.31
828	0.38
829	0.44
830	0.48
831	0.48
832	0.44
833	0.51
834	0.47
835	0.53
836	0.55
837	0.55
838	0.52
839	0.54
840	0.51
841	0.42
842	0.42
843	0.39
844	0.35
845	0.3
846	0.3
847	0.31
848	0.32
849	0.35
850	0.32
851	0.31
852	0.27
853	0.28
854	0.28
855	0.24
856	0.25
857	0.2
858	0.19
859	0.17
860	0.17
861	0.15
862	0.13
863	0.16
864	0.13
865	0.15
866	0.15
867	0.15
868	0.15
869	0.16
870	0.16
871	0.13
872	0.14
873	0.15
874	0.17
875	0.18
876	0.2
877	0.3
878	0.31
879	0.36
880	0.37
881	0.41
882	0.45
883	0.49
884	0.52
885	0.49
886	0.5
887	0.49
888	0.57
889	0.51
890	0.48
891	0.44
892	0.4
893	0.35
894	0.34
895	0.32
896	0.26
897	0.27
898	0.28
899	0.27
900	0.28
901	0.26
902	0.26
903	0.26
904	0.3
905	0.34
906	0.38
907	0.42
908	0.47
909	0.49
910	0.52
911	0.59
912	0.56
913	0.57
914	0.57
915	0.52
916	0.5
917	0.53
918	0.47
919	0.37
920	0.33
921	0.28
922	0.2
923	0.19
924	0.16
925	0.11
926	0.1
927	0.1
928	0.1
929	0.08
930	0.07
931	0.06
932	0.05
933	0.05
934	0.05
935	0.06
936	0.06
937	0.11
938	0.12
939	0.13
940	0.13
941	0.13
942	0.19
943	0.23
944	0.28
945	0.26
946	0.33
947	0.37
948	0.39
949	0.41
950	0.39
951	0.34
952	0.3
953	0.3
954	0.24
955	0.2
956	0.18
957	0.17
958	0.14
959	0.14
960	0.13
961	0.11
962	0.09
963	0.1
964	0.11
965	0.1
966	0.09
967	0.09
968	0.09
969	0.08
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.07
976	0.07
977	0.07
978	0.11
979	0.11
980	0.12
981	0.13
982	0.13
983	0.12
984	0.13
985	0.13
986	0.09
987	0.1
988	0.1
989	0.11
990	0.13
991	0.15
992	0.17
993	0.23
994	0.24
995	0.24
996	0.25
997	0.23
998	0.24
999	0.23
1000	0.25
1001	0.21
1002	0.26
1003	0.26
1004	0.28
1005	0.3
1006	0.28
1007	0.27
1008	0.28
1009	0.34
1010	0.31
1011	0.39
1012	0.39
1013	0.39
1014	0.43
1015	0.44
1016	0.4
1017	0.33
1018	0.32
1019	0.24
1020	0.2
1021	0.18
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.18
1027	0.18
1028	0.19
1029	0.19
1030	0.19
1031	0.19
1032	0.18
1033	0.18
1034	0.13
1035	0.12
1036	0.11
1037	0.12
1038	0.15
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.17
1042	0.21
1043	0.22
1044	0.25
1045	0.25
1046	0.21
1047	0.19
1048	0.18
1049	0.23
1050	0.24
1051	0.25
1052	0.22
1053	0.23
1054	0.25
1055	0.27
1056	0.3
1057	0.32
1058	0.3
1059	0.33
1060	0.34
1061	0.32
1062	0.31
1063	0.28
1064	0.23
1065	0.17
1066	0.14

B8MSD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer