FuNGI

A0A2B7WLB1

Protein Details

Accession

A0A2B7WLB1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-52	GPPMRVRRLKVDPLVRPKQRRIPRPPGQGQPGA	Hydrophilic
527-546	GTDTSRKKPKSKHGDVQPGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-50	ARAPPGQPGPPMRVRRLKVDPLVRPKQRRIPRPPGQGQP
474-477	KEKG
495-520	SGRPKHTDPLSKKAASRAARKRPGSP
531-572	SRKKPKSKHGDVQPGSRPMSPGPSGQRKPGVPADQAGKKRSR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPPPARAPPGQPGPPMRVRRLKVDPLVRPKQRRIPRPPGQGQPGAGPVANGRVGSPRPLPPQAAPRPAAPTKPTIPSADDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLITTKRAWREGFKYHVAKFASKKNIDPRDESSFTRPVRLQRRDPRASNTGPAADRDDQPPRRHGELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSAAMAQKKANAPKPRTQQVFKSKMTPEEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKIRMVPLDKWYKFTTKTPFKTLTIEEAEKFMAKKVKDPRWFAEKEQDRVQKKALEDYARQSKLFTGRREGSGVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHAGIFDEDEDAKVAEKRIKEDQLKANIFDLKDEHMYDEEENQEKKEKEALKNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETERLKEEQQKLEEERTKKEKGKESDRNSGISTKGTNTPSGRPKHTDPLSKKAASRAARKRPGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHGDVQPGSRPMSPGPSGQRKPGVPADQAGKKRSRNGPAGYGSGSDGERGVGSAAEMSDSTTTGAKKLKPNPPGVLSRTGTPRGSRAGSPAGHLPPRTGPGSGVNSPAPPTRTSTPGLPSSANLAFPTASEIHSAIPPTGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKEGSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.6
3	0.66
4	0.63
5	0.61
6	0.57
7	0.59
8	0.62
9	0.63
10	0.62
11	0.63
12	0.61
13	0.64
14	0.68
15	0.69
16	0.69
17	0.71
18	0.72
19	0.73
20	0.8
21	0.81
22	0.81
23	0.81
24	0.83
25	0.83
26	0.84
27	0.84
28	0.85
29	0.85
30	0.88
31	0.87
32	0.86
33	0.84
34	0.78
35	0.69
36	0.61
37	0.54
38	0.45
39	0.36
40	0.27
41	0.21
42	0.2
43	0.19
44	0.16
45	0.14
46	0.17
47	0.19
48	0.23
49	0.27
50	0.3
51	0.36
52	0.4
53	0.42
54	0.42
55	0.51
56	0.55
57	0.58
58	0.53
59	0.49
60	0.53
61	0.53
62	0.53
63	0.45
64	0.44
65	0.41
66	0.44
67	0.44
68	0.39
69	0.39
70	0.36
71	0.38
72	0.34
73	0.29
74	0.25
75	0.25
76	0.22
77	0.19
78	0.16
79	0.12
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.07
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.1
88	0.12
89	0.13
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.15
94	0.16
95	0.16
96	0.17
97	0.24
98	0.33
99	0.4
100	0.42
101	0.44
102	0.49
103	0.55
104	0.59
105	0.6
106	0.58
107	0.52
108	0.56
109	0.51
110	0.51
111	0.48
112	0.51
113	0.52
114	0.48
115	0.53
116	0.57
117	0.63
118	0.61
119	0.61
120	0.58
121	0.57
122	0.57
123	0.54
124	0.49
125	0.48
126	0.44
127	0.45
128	0.43
129	0.43
130	0.5
131	0.55
132	0.6
133	0.63
134	0.72
135	0.75
136	0.76
137	0.74
138	0.71
139	0.66
140	0.6
141	0.53
142	0.48
143	0.4
144	0.38
145	0.36
146	0.31
147	0.31
148	0.31
149	0.38
150	0.39
151	0.42
152	0.46
153	0.46
154	0.47
155	0.49
156	0.46
157	0.46
158	0.49
159	0.51
160	0.52
161	0.47
162	0.43
163	0.39
164	0.39
165	0.31
166	0.22
167	0.18
168	0.16
169	0.15
170	0.2
171	0.25
172	0.29
173	0.34
174	0.39
175	0.42
176	0.48
177	0.55
178	0.52
179	0.49
180	0.48
181	0.43
182	0.4
183	0.34
184	0.24
185	0.18
186	0.15
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.08
191	0.1
192	0.11
193	0.15
194	0.2
195	0.27
196	0.34
197	0.41
198	0.46
199	0.53
200	0.61
201	0.66
202	0.67
203	0.64
204	0.66
205	0.67
206	0.7
207	0.63
208	0.61
209	0.55
210	0.53
211	0.53
212	0.46
213	0.38
214	0.37
215	0.38
216	0.36
217	0.37
218	0.34
219	0.31
220	0.29
221	0.28
222	0.22
223	0.23
224	0.23
225	0.22
226	0.25
227	0.24
228	0.24
229	0.23
230	0.22
231	0.19
232	0.15
233	0.16
234	0.15
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.14
241	0.11
242	0.1
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.08
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.12
264	0.13
265	0.13
266	0.13
267	0.19
268	0.28
269	0.28
270	0.32
271	0.34
272	0.34
273	0.35
274	0.39
275	0.43
276	0.43
277	0.46
278	0.49
279	0.5
280	0.48
281	0.49
282	0.44
283	0.4
284	0.34
285	0.32
286	0.26
287	0.23
288	0.22
289	0.2
290	0.19
291	0.16
292	0.16
293	0.15
294	0.21
295	0.29
296	0.38
297	0.45
298	0.49
299	0.51
300	0.54
301	0.56
302	0.51
303	0.52
304	0.49
305	0.45
306	0.49
307	0.53
308	0.47
309	0.46
310	0.47
311	0.41
312	0.35
313	0.37
314	0.33
315	0.29
316	0.29
317	0.33
318	0.39
319	0.37
320	0.36
321	0.31
322	0.29
323	0.34
324	0.38
325	0.34
326	0.32
327	0.32
328	0.34
329	0.35
330	0.32
331	0.25
332	0.23
333	0.21
334	0.14
335	0.13
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.04
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.1
370	0.11
371	0.14
372	0.18
373	0.25
374	0.27
375	0.33
376	0.38
377	0.44
378	0.44
379	0.42
380	0.39
381	0.35
382	0.32
383	0.27
384	0.21
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.12
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.13
394	0.15
395	0.15
396	0.15
397	0.2
398	0.19
399	0.19
400	0.25
401	0.28
402	0.31
403	0.39
404	0.46
405	0.48
406	0.52
407	0.54
408	0.56
409	0.54
410	0.5
411	0.48
412	0.48
413	0.49
414	0.53
415	0.61
416	0.63
417	0.67
418	0.71
419	0.73
420	0.68
421	0.66
422	0.58
423	0.51
424	0.46
425	0.39
426	0.36
427	0.3
428	0.27
429	0.22
430	0.21
431	0.19
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.17
448	0.25
449	0.29
450	0.33
451	0.35
452	0.39
453	0.39
454	0.46
455	0.48
456	0.43
457	0.44
458	0.45
459	0.49
460	0.5
461	0.55
462	0.56
463	0.57
464	0.65
465	0.68
466	0.69
467	0.73
468	0.69
469	0.64
470	0.56
471	0.51
472	0.41
473	0.32
474	0.27
475	0.19
476	0.24
477	0.23
478	0.25
479	0.25
480	0.32
481	0.38
482	0.42
483	0.43
484	0.43
485	0.46
486	0.51
487	0.55
488	0.57
489	0.55
490	0.58
491	0.61
492	0.59
493	0.56
494	0.51
495	0.53
496	0.5
497	0.55
498	0.57
499	0.6
500	0.66
501	0.67
502	0.7
503	0.71
504	0.73
505	0.69
506	0.61
507	0.56
508	0.49
509	0.48
510	0.39
511	0.3
512	0.28
513	0.24
514	0.22
515	0.22
516	0.23
517	0.27
518	0.36
519	0.42
520	0.43
521	0.5
522	0.6
523	0.66
524	0.72
525	0.77
526	0.78
527	0.84
528	0.79
529	0.79
530	0.75
531	0.69
532	0.61
533	0.53
534	0.44
535	0.33
536	0.36
537	0.3
538	0.28
539	0.31
540	0.39
541	0.4
542	0.44
543	0.49
544	0.44
545	0.47
546	0.49
547	0.46
548	0.37
549	0.39
550	0.41
551	0.42
552	0.47
553	0.47
554	0.47
555	0.45
556	0.52
557	0.57
558	0.58
559	0.58
560	0.58
561	0.6
562	0.56
563	0.55
564	0.47
565	0.4
566	0.33
567	0.27
568	0.23
569	0.16
570	0.12
571	0.1
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.08
585	0.1
586	0.1
587	0.13
588	0.18
589	0.23
590	0.31
591	0.4
592	0.47
593	0.52
594	0.59
595	0.61
596	0.62
597	0.64
598	0.6
599	0.59
600	0.52
601	0.49
602	0.48
603	0.47
604	0.44
605	0.38
606	0.37
607	0.34
608	0.36
609	0.32
610	0.31
611	0.33
612	0.31
613	0.32
614	0.35
615	0.35
616	0.37
617	0.36
618	0.34
619	0.3
620	0.34
621	0.33
622	0.27
623	0.23
624	0.26
625	0.32
626	0.32
627	0.32
628	0.29
629	0.28
630	0.3
631	0.33
632	0.28
633	0.23
634	0.27
635	0.27
636	0.3
637	0.32
638	0.34
639	0.35
640	0.37
641	0.39
642	0.34
643	0.31
644	0.33
645	0.31
646	0.28
647	0.22
648	0.19
649	0.16
650	0.15
651	0.19
652	0.15
653	0.14
654	0.14
655	0.15
656	0.15
657	0.17
658	0.18
659	0.14
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.12
664	0.11
665	0.09
666	0.1
667	0.11
668	0.13
669	0.14
670	0.13
671	0.14
672	0.18
673	0.19
674	0.2
675	0.22
676	0.25
677	0.33
678	0.4
679	0.45
680	0.46
681	0.56
682	0.65
683	0.64
684	0.63
685	0.55
686	0.49
687	0.44
688	0.48
689	0.46
690	0.4
691	0.39
692	0.38
693	0.39
694	0.38
695	0.37
696	0.3
697	0.24
698	0.22
699	0.21
700	0.21
701	0.24
702	0.27
703	0.32
704	0.34
705	0.33
706	0.34
707	0.35
708	0.4

A0A2B7WLB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer