Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MS06

Protein Details
Accession B8MS06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-57GVSRHRLSRRVKGIPSRSKRAPBasic
456-485EDFARLRDTAKRKNNKKTKRQVKASGALYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-55RLSRRVKGIPSRSKR
465-478AKRKNNKKTKRQVK
Subcellular Location(s) cyto 10.5cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, pero 3, mito 1, extr 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF05225  HTH_psq  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MAPKEYKKEEEQIAKAVSAYQSGQNQNISRLAREFGVSRHRLSRRVKGIPSRSKRAPTNRLLSLDQEKALFLWIEYLDNIGAPPTNQQIEQSANFLLREDFTGPGEPRGVGKTWVDRFLTRLPEGYQRIKQKPQEVDRTGAEHYGEIERWFIDLKLVMQKLHITPKNLWNFDETGFIVGQGKSESVVTKYPKTAKRVSSLSSRESLTVVESINAEGRDPEWLIAPASNGFITDEIAFEWLQHFQHYTKPEHTFEWRLLIMDNHTTHLTIQFVQYCEINRIRLFRFPPHSTHLLQPLDGVPFQQYKRVHGRVVNQVARLGGFDFNKNDFFEELRDIRIQTFTPRIIRHGWKDRGIWPYNPDIVLSKLPHPDEAIIDDGNTLKIYGEVDDTIPSSPTTKSISPPSTVTALRRYINKIEKSIEGIKDILEESKPGLVRRIKVVNSSSLAMAGLGELHREDFARLRDTAKRKNNKKTKRQVKASGALYVKDANRLIKRRHDGDLLRIHKQHVLGVPEAEDAEAPREPQNLGFFIDSTGNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.43
3 0.38
4 0.3
5 0.24
6 0.22
7 0.21
8 0.26
9 0.29
10 0.32
11 0.35
12 0.36
13 0.37
14 0.41
15 0.38
16 0.33
17 0.32
18 0.31
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.24
23 0.33
24 0.33
25 0.35
26 0.43
27 0.46
28 0.52
29 0.57
30 0.62
31 0.61
32 0.67
33 0.71
34 0.72
35 0.79
36 0.81
37 0.83
38 0.82
39 0.79
40 0.79
41 0.8
42 0.8
43 0.79
44 0.77
45 0.76
46 0.73
47 0.7
48 0.64
49 0.61
50 0.57
51 0.5
52 0.42
53 0.35
54 0.29
55 0.24
56 0.24
57 0.18
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.18
76 0.22
77 0.23
78 0.22
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.16
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.18
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.17
98 0.19
99 0.25
100 0.27
101 0.32
102 0.32
103 0.3
104 0.33
105 0.36
106 0.39
107 0.31
108 0.31
109 0.28
110 0.34
111 0.39
112 0.41
113 0.42
114 0.46
115 0.52
116 0.58
117 0.61
118 0.61
119 0.65
120 0.67
121 0.71
122 0.64
123 0.62
124 0.56
125 0.53
126 0.46
127 0.38
128 0.3
129 0.19
130 0.18
131 0.16
132 0.15
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.2
147 0.22
148 0.31
149 0.32
150 0.29
151 0.32
152 0.4
153 0.48
154 0.46
155 0.44
156 0.37
157 0.36
158 0.33
159 0.31
160 0.23
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.14
174 0.17
175 0.19
176 0.23
177 0.31
178 0.36
179 0.41
180 0.46
181 0.45
182 0.48
183 0.48
184 0.47
185 0.48
186 0.46
187 0.43
188 0.39
189 0.36
190 0.3
191 0.27
192 0.24
193 0.16
194 0.14
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.08
231 0.13
232 0.17
233 0.19
234 0.23
235 0.27
236 0.28
237 0.29
238 0.32
239 0.3
240 0.27
241 0.27
242 0.22
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.17
267 0.18
268 0.22
269 0.24
270 0.26
271 0.32
272 0.32
273 0.35
274 0.36
275 0.39
276 0.36
277 0.36
278 0.37
279 0.3
280 0.28
281 0.25
282 0.21
283 0.19
284 0.17
285 0.15
286 0.1
287 0.13
288 0.13
289 0.19
290 0.18
291 0.22
292 0.3
293 0.33
294 0.33
295 0.33
296 0.39
297 0.42
298 0.5
299 0.47
300 0.4
301 0.38
302 0.35
303 0.31
304 0.26
305 0.18
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.16
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.15
326 0.18
327 0.18
328 0.22
329 0.23
330 0.25
331 0.29
332 0.34
333 0.39
334 0.46
335 0.48
336 0.47
337 0.49
338 0.52
339 0.55
340 0.52
341 0.47
342 0.4
343 0.39
344 0.37
345 0.34
346 0.29
347 0.22
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.2
352 0.22
353 0.23
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.18
358 0.18
359 0.16
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.07
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.09
381 0.11
382 0.15
383 0.16
384 0.19
385 0.27
386 0.29
387 0.3
388 0.31
389 0.31
390 0.31
391 0.31
392 0.3
393 0.28
394 0.3
395 0.3
396 0.33
397 0.35
398 0.4
399 0.47
400 0.48
401 0.45
402 0.44
403 0.43
404 0.45
405 0.47
406 0.39
407 0.33
408 0.29
409 0.25
410 0.24
411 0.22
412 0.18
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.23
420 0.26
421 0.28
422 0.34
423 0.4
424 0.37
425 0.42
426 0.44
427 0.41
428 0.39
429 0.38
430 0.32
431 0.25
432 0.23
433 0.17
434 0.14
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.1
444 0.13
445 0.17
446 0.2
447 0.21
448 0.24
449 0.33
450 0.4
451 0.49
452 0.55
453 0.63
454 0.68
455 0.79
456 0.86
457 0.88
458 0.91
459 0.92
460 0.92
461 0.93
462 0.93
463 0.92
464 0.91
465 0.89
466 0.8
467 0.77
468 0.68
469 0.58
470 0.49
471 0.45
472 0.36
473 0.32
474 0.32
475 0.31
476 0.38
477 0.45
478 0.49
479 0.54
480 0.61
481 0.6
482 0.63
483 0.65
484 0.6
485 0.61
486 0.65
487 0.6
488 0.59
489 0.57
490 0.53
491 0.48
492 0.46
493 0.42
494 0.36
495 0.36
496 0.31
497 0.3
498 0.29
499 0.26
500 0.26
501 0.2
502 0.16
503 0.12
504 0.14
505 0.13
506 0.14
507 0.16
508 0.18
509 0.18
510 0.21
511 0.25
512 0.23
513 0.25
514 0.24
515 0.21
516 0.22