Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MDL9

Protein Details
Accession B8MDL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-99TSSVFDGPKKRGRKKKADKEREDASIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-94PKKRGRKKKADKER
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSPPPTTPSALLPRKRPSISSTASGQAKRPRMHPLRQTSFPTGMGLEYDNSRSRAPSDAGSVTGSFTGSLGGTSSVFDGPKKRGRKKKADKEREDASIARGGAADGRSTRVGSADIDGGSVRGGAGGGNEEAAEEEEEQDMEGDMLGGTEGFLDVATEKKNLAVLTGSFTPLQADRYEKWNRTRLRKETLRRIVNHALSQSVPQSVVTVVNGFTKVFIGEIIEKARTVQEEWAEAFDLSARVTWEREQAELETAAAAKAAAEAEAKAREEAKAKEDAKAREEAQTNSGSASAESKESDKTTTAMKSEPQSPPGPNNIPALPSAAGFPTTHLTPYASTPNAGQLANGMKMETHRTFIPPVNPHRGQLLPDHIREALRRYKRDGEGGGTGMSGLSQPMMGVRGAFSWQAGPGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.66
3 0.66
4 0.61
5 0.57
6 0.57
7 0.55
8 0.52
9 0.47
10 0.47
11 0.51
12 0.5
13 0.51
14 0.5
15 0.54
16 0.53
17 0.52
18 0.56
19 0.58
20 0.65
21 0.68
22 0.7
23 0.7
24 0.72
25 0.76
26 0.71
27 0.65
28 0.57
29 0.48
30 0.38
31 0.3
32 0.25
33 0.2
34 0.15
35 0.14
36 0.18
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.25
43 0.25
44 0.23
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.25
49 0.23
50 0.19
51 0.17
52 0.15
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.16
67 0.22
68 0.31
69 0.4
70 0.49
71 0.58
72 0.67
73 0.77
74 0.84
75 0.88
76 0.92
77 0.93
78 0.91
79 0.87
80 0.82
81 0.75
82 0.67
83 0.57
84 0.48
85 0.41
86 0.33
87 0.26
88 0.21
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.02
140 0.02
141 0.03
142 0.03
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.2
165 0.26
166 0.3
167 0.35
168 0.42
169 0.47
170 0.54
171 0.61
172 0.6
173 0.64
174 0.68
175 0.7
176 0.73
177 0.76
178 0.73
179 0.66
180 0.67
181 0.63
182 0.57
183 0.51
184 0.4
185 0.32
186 0.25
187 0.24
188 0.18
189 0.12
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.15
239 0.14
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.15
258 0.16
259 0.18
260 0.25
261 0.25
262 0.3
263 0.35
264 0.36
265 0.35
266 0.37
267 0.35
268 0.33
269 0.35
270 0.31
271 0.29
272 0.27
273 0.25
274 0.21
275 0.2
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.21
293 0.23
294 0.3
295 0.32
296 0.32
297 0.34
298 0.34
299 0.36
300 0.41
301 0.4
302 0.35
303 0.36
304 0.32
305 0.3
306 0.27
307 0.27
308 0.19
309 0.16
310 0.14
311 0.11
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.16
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.23
327 0.24
328 0.23
329 0.19
330 0.16
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.15
335 0.13
336 0.15
337 0.23
338 0.2
339 0.2
340 0.19
341 0.22
342 0.26
343 0.3
344 0.37
345 0.38
346 0.44
347 0.51
348 0.51
349 0.49
350 0.5
351 0.47
352 0.41
353 0.39
354 0.41
355 0.38
356 0.38
357 0.39
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.38
362 0.38
363 0.41
364 0.44
365 0.48
366 0.55
367 0.57
368 0.62
369 0.59
370 0.54
371 0.48
372 0.46
373 0.39
374 0.3
375 0.26
376 0.19
377 0.15
378 0.1
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.11
390 0.12
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.15
395 0.17
396 0.18
397 0.22