Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CAB0

Protein Details
Accession A0A0D1CAB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-146ASEHRQRFPEHRFKPTPRKAFSHydrophilic
836-855RLNSFKSKLARAKHRSSPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_11658  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MDEEPLQCCGTSNAGPSKPPPKAQARARSKSLGEPRNVQPYQTNSPPSAPPSHLRKIPRPPNAFILYRTEKIKELKNNKGASLASDVGLDKLDHQRQLSKIVGQLWRDETPEIKAAFQERARQAASEHRQRFPEHRFKPTPRKAFSCAPATCAALQTPETHTHTDFSPGDIRGPLSGSGSGSGRKRASLEGAKSKTSPYSKPHRRTSLASPSSPTVHQTAHDTDHQRGSVKTDAAPDPAAYSAGATQLTRSVSLSTTRQAQITDQQRGSARRSLDGITSQSAAPTHSFDAPVPQHLREHHVFLAPPPAPPLPIGHAITTNHVATNLEAYAQHHELPKPKCSLFDAVSSALPHERRAFLQASLVMKGYPFAVPADASESTEQRTPTVYQTTSSTPKAGQSTTPIEPSESQVFYTTALKRTHTWHSQGVTETTFHQNTGSEAPPIPQTSKANPSPLAVAPPAASSVNLYVDATAAARYGDLGDWSQPEPCFNTSQSQISCYDGSMPPPSASGVYYGQNTSVETSLQAPSGVWDDLVAYLPQPDSFNAIKVASYLPIDSNIHPSNSAFVTLSEPDGANQVQSNFFGFDGQLMAQESVVGESTALGAGVDPVQEELRQRRAVEELLKQMMAPKTPLISTSKCSLHPELHDGTVCLCSSTQQQVVLAEHRSDRQSWPQKAIQGFSESSLLGDVSQPSLQLGADDEACNTCCQPDQTDLKALSTAPASTVQALDNLLTESQVYDYLTSPTTKTNFSRPLLLSAQPQEGRESFFLKGPVSAPPIEQGLSTAEASRLDTAQDSTLDPADSVQTQGEDAVQMATLSGGSHQQRIQQSLRNWKAQRLNSFKSKLARAKHRSSPSSSSLSVEKTKNDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.4
4 0.47
5 0.48
6 0.51
7 0.53
8 0.54
9 0.62
10 0.69
11 0.74
12 0.75
13 0.77
14 0.78
15 0.76
16 0.69
17 0.69
18 0.7
19 0.67
20 0.61
21 0.61
22 0.61
23 0.65
24 0.63
25 0.55
26 0.51
27 0.5
28 0.52
29 0.52
30 0.51
31 0.42
32 0.46
33 0.48
34 0.46
35 0.44
36 0.41
37 0.42
38 0.46
39 0.51
40 0.54
41 0.58
42 0.63
43 0.68
44 0.74
45 0.76
46 0.74
47 0.71
48 0.73
49 0.71
50 0.65
51 0.56
52 0.55
53 0.51
54 0.49
55 0.48
56 0.41
57 0.41
58 0.43
59 0.49
60 0.5
61 0.53
62 0.6
63 0.65
64 0.66
65 0.61
66 0.61
67 0.52
68 0.45
69 0.42
70 0.32
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.18
75 0.19
76 0.16
77 0.13
78 0.21
79 0.25
80 0.27
81 0.28
82 0.34
83 0.34
84 0.4
85 0.4
86 0.34
87 0.33
88 0.37
89 0.4
90 0.36
91 0.39
92 0.37
93 0.36
94 0.35
95 0.32
96 0.27
97 0.26
98 0.3
99 0.26
100 0.22
101 0.23
102 0.24
103 0.29
104 0.3
105 0.36
106 0.32
107 0.36
108 0.36
109 0.34
110 0.33
111 0.37
112 0.44
113 0.45
114 0.48
115 0.47
116 0.5
117 0.53
118 0.6
119 0.59
120 0.61
121 0.56
122 0.62
123 0.66
124 0.73
125 0.8
126 0.83
127 0.82
128 0.78
129 0.78
130 0.74
131 0.73
132 0.69
133 0.67
134 0.58
135 0.51
136 0.47
137 0.43
138 0.38
139 0.31
140 0.25
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.18
145 0.22
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.25
150 0.25
151 0.29
152 0.26
153 0.23
154 0.25
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.24
159 0.18
160 0.19
161 0.16
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.17
168 0.17
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.24
173 0.24
174 0.3
175 0.33
176 0.39
177 0.43
178 0.45
179 0.46
180 0.45
181 0.44
182 0.44
183 0.4
184 0.39
185 0.36
186 0.45
187 0.53
188 0.62
189 0.7
190 0.71
191 0.71
192 0.71
193 0.72
194 0.72
195 0.67
196 0.6
197 0.53
198 0.47
199 0.45
200 0.41
201 0.33
202 0.25
203 0.2
204 0.19
205 0.21
206 0.22
207 0.23
208 0.28
209 0.29
210 0.29
211 0.32
212 0.32
213 0.3
214 0.27
215 0.28
216 0.26
217 0.25
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.25
222 0.26
223 0.21
224 0.18
225 0.16
226 0.15
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.14
241 0.16
242 0.15
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.2
247 0.21
248 0.26
249 0.31
250 0.37
251 0.31
252 0.33
253 0.37
254 0.39
255 0.41
256 0.38
257 0.31
258 0.26
259 0.28
260 0.26
261 0.24
262 0.23
263 0.21
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.18
277 0.18
278 0.23
279 0.24
280 0.23
281 0.24
282 0.25
283 0.31
284 0.26
285 0.29
286 0.24
287 0.24
288 0.23
289 0.21
290 0.28
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.13
299 0.18
300 0.18
301 0.16
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.18
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.1
311 0.11
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.24
322 0.26
323 0.3
324 0.31
325 0.3
326 0.3
327 0.3
328 0.33
329 0.27
330 0.27
331 0.25
332 0.22
333 0.22
334 0.21
335 0.19
336 0.17
337 0.16
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.18
344 0.15
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.17
349 0.17
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.14
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.18
376 0.21
377 0.23
378 0.23
379 0.21
380 0.17
381 0.2
382 0.21
383 0.19
384 0.16
385 0.16
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.21
393 0.2
394 0.15
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.18
400 0.17
401 0.19
402 0.2
403 0.21
404 0.22
405 0.25
406 0.31
407 0.3
408 0.32
409 0.3
410 0.3
411 0.31
412 0.3
413 0.28
414 0.22
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.15
424 0.13
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.17
434 0.24
435 0.25
436 0.26
437 0.26
438 0.25
439 0.24
440 0.22
441 0.21
442 0.15
443 0.13
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.07
469 0.08
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.17
478 0.16
479 0.21
480 0.2
481 0.2
482 0.19
483 0.19
484 0.19
485 0.16
486 0.17
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.08
514 0.1
515 0.09
516 0.07
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.08
521 0.07
522 0.05
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.1
541 0.12
542 0.12
543 0.18
544 0.18
545 0.18
546 0.18
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.16
551 0.1
552 0.09
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.12
560 0.11
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.03
589 0.03
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.1
598 0.14
599 0.2
600 0.22
601 0.22
602 0.23
603 0.25
604 0.28
605 0.3
606 0.3
607 0.29
608 0.28
609 0.28
610 0.26
611 0.29
612 0.28
613 0.24
614 0.2
615 0.16
616 0.16
617 0.16
618 0.19
619 0.18
620 0.19
621 0.2
622 0.25
623 0.27
624 0.27
625 0.32
626 0.33
627 0.32
628 0.32
629 0.35
630 0.31
631 0.31
632 0.29
633 0.24
634 0.23
635 0.21
636 0.18
637 0.13
638 0.1
639 0.1
640 0.13
641 0.17
642 0.17
643 0.16
644 0.17
645 0.19
646 0.21
647 0.23
648 0.21
649 0.19
650 0.19
651 0.21
652 0.22
653 0.22
654 0.23
655 0.31
656 0.39
657 0.41
658 0.46
659 0.47
660 0.51
661 0.51
662 0.49
663 0.41
664 0.35
665 0.32
666 0.27
667 0.25
668 0.19
669 0.17
670 0.15
671 0.12
672 0.08
673 0.09
674 0.08
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.09
683 0.08
684 0.1
685 0.1
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.13
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.13
694 0.15
695 0.21
696 0.26
697 0.29
698 0.35
699 0.35
700 0.34
701 0.33
702 0.3
703 0.25
704 0.2
705 0.17
706 0.12
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.12
712 0.12
713 0.13
714 0.11
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.08
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.09
726 0.11
727 0.13
728 0.14
729 0.14
730 0.18
731 0.2
732 0.24
733 0.26
734 0.33
735 0.4
736 0.4
737 0.47
738 0.43
739 0.47
740 0.45
741 0.45
742 0.42
743 0.37
744 0.43
745 0.37
746 0.37
747 0.35
748 0.32
749 0.34
750 0.3
751 0.29
752 0.23
753 0.24
754 0.26
755 0.22
756 0.23
757 0.2
758 0.22
759 0.24
760 0.23
761 0.21
762 0.21
763 0.22
764 0.2
765 0.19
766 0.15
767 0.14
768 0.15
769 0.15
770 0.14
771 0.13
772 0.14
773 0.15
774 0.16
775 0.14
776 0.12
777 0.13
778 0.14
779 0.15
780 0.15
781 0.15
782 0.15
783 0.16
784 0.16
785 0.14
786 0.13
787 0.14
788 0.13
789 0.13
790 0.12
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.11
795 0.09
796 0.09
797 0.08
798 0.07
799 0.07
800 0.06
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.06
805 0.12
806 0.14
807 0.18
808 0.2
809 0.27
810 0.32
811 0.38
812 0.42
813 0.43
814 0.49
815 0.56
816 0.62
817 0.65
818 0.63
819 0.65
820 0.69
821 0.69
822 0.72
823 0.7
824 0.71
825 0.71
826 0.73
827 0.7
828 0.68
829 0.7
830 0.67
831 0.67
832 0.71
833 0.7
834 0.74
835 0.78
836 0.81
837 0.78
838 0.77
839 0.75
840 0.7
841 0.67
842 0.59
843 0.53
844 0.47
845 0.46
846 0.46
847 0.42