FuNGI

B8M0T5

Protein Details

Accession

B8M0T5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-366	EAEAEYKRRLKQKKKERKDGGKPRNAPG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
345-365	KRRLKQKKKERKDGGKPRNAP
423-447	RGRGRGRGGFDRGSGRGRGNDRRGR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MEDQPDIQMQLGEGQIQPKTEQPEISVLSTTPLEPSSDFYNTPLTGQTPVYPANNTTSNSDEATIESETKPAPPTDGQNTENTQQNGDLANKVASTAEQNLGAHQNEEVPTTDAMETDQPAADQPTTTEEEHPEWEIDSSPYESSSDSSTDSSDDSDEDEEDYPILSAEETARILMQAEGGSDDEGDNKAGGGSQLRTANEQIEEAPPIPDIKVTEDMKIVPLGHLESHVENLILIKATVSGDYQVLESNSLLCLEDRTVIGVVADTLGRVEEPLYTVRYQDPTKIQELGLEKGKQIFYVESHSEFVFTQPLKGMKGSDASNFHDEEVGEDEIEFSDDEAEAEYKRRLKQKKKERKDGGKPRNAPGPSPLSRGELNYDDDGDRATEDGYTPLARPKNYHEIMNHPEAHTESSSSYQNNRGNFRGRGRGRGGFDRGSGRGRGNDRRGRGNHHNNYSQDNSHRADYSRENSATPQYQNYSAPPAALPSVAFPAQQYSQYPSFPQPPQQPQFPQFGQAQTAGLPQFPFRLPFQQTPYQQNTYQQNPYQSVPAGAHINPAFFAALQQQLQQQQQQQQQQPQQPVAPPVPQNQSAFSQVQEQLDILRQLAASRNANPPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.18
4	0.19
5	0.21
6	0.26
7	0.27
8	0.27
9	0.26
10	0.31
11	0.33
12	0.33
13	0.3
14	0.24
15	0.24
16	0.24
17	0.21
18	0.16
19	0.14
20	0.14
21	0.13
22	0.16
23	0.19
24	0.21
25	0.21
26	0.21
27	0.26
28	0.24
29	0.25
30	0.23
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.21
35	0.19
36	0.22
37	0.23
38	0.23
39	0.23
40	0.26
41	0.29
42	0.28
43	0.28
44	0.28
45	0.28
46	0.28
47	0.27
48	0.22
49	0.19
50	0.2
51	0.18
52	0.17
53	0.15
54	0.16
55	0.15
56	0.17
57	0.19
58	0.16
59	0.19
60	0.2
61	0.26
62	0.32
63	0.38
64	0.37
65	0.4
66	0.44
67	0.43
68	0.47
69	0.42
70	0.35
71	0.29
72	0.29
73	0.26
74	0.24
75	0.22
76	0.17
77	0.17
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.11
82	0.13
83	0.15
84	0.15
85	0.16
86	0.16
87	0.18
88	0.22
89	0.22
90	0.19
91	0.16
92	0.17
93	0.16
94	0.17
95	0.17
96	0.15
97	0.14
98	0.16
99	0.16
100	0.12
101	0.13
102	0.14
103	0.13
104	0.12
105	0.12
106	0.1
107	0.11
108	0.13
109	0.12
110	0.1
111	0.1
112	0.13
113	0.17
114	0.18
115	0.19
116	0.2
117	0.21
118	0.23
119	0.24
120	0.2
121	0.17
122	0.16
123	0.16
124	0.14
125	0.13
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.08
181	0.11
182	0.15
183	0.15
184	0.17
185	0.18
186	0.19
187	0.17
188	0.17
189	0.14
190	0.12
191	0.13
192	0.12
193	0.12
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.11
200	0.17
201	0.18
202	0.18
203	0.19
204	0.19
205	0.19
206	0.2
207	0.17
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.07
219	0.08
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.05
261	0.06
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.15
267	0.15
268	0.18
269	0.2
270	0.21
271	0.23
272	0.23
273	0.22
274	0.22
275	0.24
276	0.23
277	0.23
278	0.21
279	0.19
280	0.21
281	0.21
282	0.17
283	0.16
284	0.14
285	0.1
286	0.14
287	0.15
288	0.13
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.13
295	0.11
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.13
301	0.13
302	0.1
303	0.12
304	0.13
305	0.14
306	0.16
307	0.18
308	0.2
309	0.2
310	0.19
311	0.17
312	0.16
313	0.13
314	0.14
315	0.11
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.07
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.07
330	0.09
331	0.13
332	0.17
333	0.26
334	0.35
335	0.45
336	0.55
337	0.65
338	0.74
339	0.8
340	0.87
341	0.89
342	0.91
343	0.91
344	0.93
345	0.92
346	0.9
347	0.84
348	0.76
349	0.73
350	0.63
351	0.52
352	0.46
353	0.43
354	0.35
355	0.35
356	0.33
357	0.28
358	0.28
359	0.28
360	0.26
361	0.2
362	0.21
363	0.18
364	0.18
365	0.15
366	0.14
367	0.14
368	0.11
369	0.09
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.13
379	0.16
380	0.16
381	0.18
382	0.24
383	0.33
384	0.33
385	0.37
386	0.33
387	0.37
388	0.41
389	0.46
390	0.41
391	0.31
392	0.31
393	0.28
394	0.28
395	0.22
396	0.18
397	0.12
398	0.13
399	0.15
400	0.16
401	0.18
402	0.23
403	0.26
404	0.3
405	0.33
406	0.34
407	0.38
408	0.41
409	0.44
410	0.46
411	0.44
412	0.47
413	0.48
414	0.5
415	0.48
416	0.5
417	0.5
418	0.41
419	0.41
420	0.38
421	0.35
422	0.32
423	0.3
424	0.25
425	0.27
426	0.32
427	0.38
428	0.44
429	0.48
430	0.49
431	0.56
432	0.57
433	0.59
434	0.64
435	0.66
436	0.66
437	0.66
438	0.69
439	0.62
440	0.65
441	0.6
442	0.53
443	0.45
444	0.42
445	0.37
446	0.33
447	0.33
448	0.29
449	0.3
450	0.32
451	0.32
452	0.34
453	0.33
454	0.31
455	0.31
456	0.36
457	0.36
458	0.32
459	0.32
460	0.28
461	0.29
462	0.3
463	0.3
464	0.3
465	0.25
466	0.24
467	0.2
468	0.19
469	0.17
470	0.16
471	0.14
472	0.09
473	0.13
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.14
478	0.15
479	0.17
480	0.18
481	0.2
482	0.22
483	0.23
484	0.26
485	0.27
486	0.32
487	0.33
488	0.39
489	0.42
490	0.5
491	0.53
492	0.58
493	0.6
494	0.56
495	0.62
496	0.54
497	0.49
498	0.42
499	0.4
500	0.35
501	0.29
502	0.26
503	0.19
504	0.22
505	0.18
506	0.16
507	0.15
508	0.13
509	0.16
510	0.16
511	0.18
512	0.17
513	0.25
514	0.29
515	0.34
516	0.41
517	0.46
518	0.5
519	0.56
520	0.6
521	0.58
522	0.54
523	0.56
524	0.56
525	0.54
526	0.57
527	0.52
528	0.51
529	0.49
530	0.49
531	0.45
532	0.38
533	0.34
534	0.27
535	0.26
536	0.24
537	0.21
538	0.26
539	0.23
540	0.23
541	0.2
542	0.2
543	0.17
544	0.13
545	0.15
546	0.12
547	0.15
548	0.16
549	0.18
550	0.21
551	0.26
552	0.3
553	0.34
554	0.37
555	0.41
556	0.48
557	0.55
558	0.58
559	0.62
560	0.68
561	0.7
562	0.7
563	0.66
564	0.62
565	0.57
566	0.56
567	0.5
568	0.48
569	0.45
570	0.45
571	0.48
572	0.48
573	0.46
574	0.43
575	0.43
576	0.41
577	0.38
578	0.32
579	0.33
580	0.31
581	0.31
582	0.28
583	0.25
584	0.22
585	0.26
586	0.25
587	0.19
588	0.17
589	0.16
590	0.17
591	0.23
592	0.27
593	0.27
594	0.3

B8M0T5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer