Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XDT1

Protein Details
Accession A0A2C5XDT1    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-84AKPSRNTTRRANKKLKTTLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-78KKDKRVIKKSAFVSRIAKANAKPSRNTTRRANKK
109-125KIRHKSLKSRPGALKRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPTVPKLSIGEHRMARLRGDIHPHAPYKVHREETTISDSFASSKKDKRVIKKSAFVSRIAKANAKPSRNTTRRANKKLKTTLTSLADALPNLTGDAEMDDAAAAAAGKIRHKSLKSRPGALKRKEVVVKSEMSRFGANMAQLATVSEAAPKVNTPAPAKLSRKQQKLQSHQQSQAPAPVPVPQMETSTTNRWAALRGFISATMEQNPAFVNKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.39
4 0.35
5 0.35
6 0.32
7 0.38
8 0.38
9 0.37
10 0.42
11 0.42
12 0.4
13 0.4
14 0.41
15 0.41
16 0.44
17 0.45
18 0.4
19 0.43
20 0.44
21 0.45
22 0.47
23 0.39
24 0.32
25 0.26
26 0.26
27 0.23
28 0.23
29 0.24
30 0.21
31 0.27
32 0.33
33 0.41
34 0.48
35 0.56
36 0.63
37 0.68
38 0.71
39 0.73
40 0.73
41 0.74
42 0.69
43 0.63
44 0.57
45 0.5
46 0.48
47 0.42
48 0.4
49 0.32
50 0.4
51 0.42
52 0.41
53 0.41
54 0.43
55 0.52
56 0.51
57 0.55
58 0.55
59 0.59
60 0.67
61 0.74
62 0.77
63 0.71
64 0.77
65 0.8
66 0.76
67 0.68
68 0.62
69 0.59
70 0.52
71 0.47
72 0.38
73 0.3
74 0.24
75 0.21
76 0.17
77 0.11
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.02
92 0.02
93 0.04
94 0.04
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.12
99 0.14
100 0.22
101 0.3
102 0.39
103 0.41
104 0.48
105 0.54
106 0.61
107 0.69
108 0.65
109 0.65
110 0.56
111 0.59
112 0.56
113 0.5
114 0.43
115 0.37
116 0.36
117 0.29
118 0.32
119 0.26
120 0.24
121 0.23
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.15
142 0.17
143 0.21
144 0.26
145 0.34
146 0.38
147 0.42
148 0.5
149 0.55
150 0.61
151 0.63
152 0.67
153 0.69
154 0.73
155 0.79
156 0.78
157 0.76
158 0.74
159 0.72
160 0.67
161 0.58
162 0.56
163 0.47
164 0.37
165 0.3
166 0.29
167 0.27
168 0.24
169 0.26
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.25
174 0.25
175 0.28
176 0.31
177 0.28
178 0.28
179 0.26
180 0.28
181 0.26
182 0.27
183 0.23
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.25
188 0.23
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.18
193 0.18
194 0.19