FuNGI

A0A2C5XBY0

Protein Details

Accession

A0A2C5XBY0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
895-914	QFSRPRPSFRPRNNNPGHNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1131-1158	RPGSLRKGTPAQAESKSRRANGKKTAKE

Subcellular Location(s)

nucl 9, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5, pero 3, golg 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR045055 DNA2/NAM7-like IPR041679 DNA2/NAM7-like_C IPR041677 DNA2/NAM7_AAA_11 IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR027417 P-loop_NTPase IPR047187 SF1_C_Upf1 IPR040812 UPF1_1B_dom IPR018999 UPF1_CH/ZBD
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF13086 AAA_11 PF13087 AAA_12 PF18141 UPF1_1B_dom PF09416 UPF1_Zn_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS51997 UPF1_CH_RICH
CDD	cd21407 1B_UPF1-like cd18039 DEXXQc_UPF1 cd18808 SF1_C_Upf1 cd21400 ZBD_UPF1-like

Amino Acid Sequences

MDDKADASVTHQNFDSQSVADPDNEETLLFSGLAGRRRTNDEDNLIDDDSASEDNNHDHDHDHDNDNDSSVSAAIDDLDRLSITAPEEPVLPAHACSYCEIHNPSCVVKCLVCNKWFCNGRTRGRSAHIINHLVRSRHKEVSLHPDSTLGGTTLECYVCGIKNVFLLGFIPAKADSVVVLLCRSPCASDPSRKEATWDITKWQPLIEDRTFLPWLVHLPSEEEKMRSRHITNDQMSSLEALWKTNPERGIDFLNCTDDIEDEPLPVLLNYNDPYHYHSVFGPLVTMESDYDKELKEAQTEDDLTITWDQALNTRTTARFKLRKIELGDVKLAVGDEMRLHYSSGNRLIWEGVGYVIKIPNNESATVTLELRKTGNDKPVPQHLETGFSADYVWKATSYERMLWALNTFQRDEKSIHGYIFHKLLGHDVTPKPKDRGRHQNLSRKIHAPGLPALNDSQSNAVRTVLQQPLSLIQGPPGTGKTVTSATIIYNMAKQSGGEPVLVCAPSNVAVDQLCERISLTGLKVVRLTAKSREDVESSVNHLSLHEQVRQGQTNSELARLLQLQTEIGELTSEDEKRYRKLLRKAEKDFLNNADVICCTCVGAGDPRLLKKSFRHVLIDESTQSAEPECLIPIVHGATQVVLVGDHKQLGPVIMNKKAARAGLNQSLFERLVHLGMNPIRLNVQYRMHPCLSDFPSNMFYDGDLQNGIGYESRIRNDIDFPWPVKESPMMFWANMGNEEISASGTSYLNRTEASNVEKVVTRFLKEGVQPTDIGVITPYEGQRSFLVTTMQTTGTCNKDLYKRVEVASVDAFQGREKDWIVLSCVRSNDNQGIGFLSDPRRLNVALTRAKYGLVIIGNPKALSKNELWHSLLSHYKDKNCFVEGPLSNLQKSLMQFSRPRPSFRPRNNNPGHNAGLNANHQPHGIYGPTSSASTVGGSGGLGNGSSSRFGSGSGRDFDTGSMMSYIPDDASSLHGSIYNGASLNLKFNNGFLAGLAPEMWPGLPGVPALPRGSRRHARPAESIAGESDATSEFTDATSVVGGNGVGQGGVSLNLGSNGAPGGLHPHQQPHHHHALSGSSSAQKDRFNRYIQNGGRMGVNRPLDDDEKSVSTAFQSQIGDPRRGGPGSTVGRPGSLRKGTPAQAESKSRRANGKKTAKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.25
3	0.17
4	0.19
5	0.21
6	0.22
7	0.21
8	0.21
9	0.21
10	0.21
11	0.2
12	0.17
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.11
17	0.09
18	0.13
19	0.17
20	0.24
21	0.26
22	0.28
23	0.31
24	0.38
25	0.44
26	0.45
27	0.49
28	0.49
29	0.49
30	0.49
31	0.49
32	0.43
33	0.36
34	0.29
35	0.22
36	0.18
37	0.15
38	0.13
39	0.1
40	0.1
41	0.13
42	0.15
43	0.16
44	0.15
45	0.16
46	0.19
47	0.24
48	0.27
49	0.29
50	0.3
51	0.33
52	0.33
53	0.33
54	0.29
55	0.23
56	0.19
57	0.15
58	0.13
59	0.08
60	0.07
61	0.06
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.1
71	0.13
72	0.14
73	0.13
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.16
78	0.15
79	0.12
80	0.15
81	0.16
82	0.16
83	0.17
84	0.2
85	0.19
86	0.25
87	0.29
88	0.27
89	0.3
90	0.31
91	0.33
92	0.33
93	0.33
94	0.3
95	0.27
96	0.32
97	0.36
98	0.42
99	0.44
100	0.46
101	0.46
102	0.52
103	0.58
104	0.53
105	0.55
106	0.57
107	0.61
108	0.65
109	0.67
110	0.63
111	0.6
112	0.67
113	0.6
114	0.6
115	0.57
116	0.56
117	0.52
118	0.56
119	0.55
120	0.5
121	0.52
122	0.52
123	0.5
124	0.48
125	0.49
126	0.45
127	0.46
128	0.54
129	0.55
130	0.48
131	0.42
132	0.38
133	0.35
134	0.32
135	0.27
136	0.17
137	0.11
138	0.09
139	0.1
140	0.12
141	0.11
142	0.1
143	0.1
144	0.12
145	0.12
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.15
150	0.16
151	0.15
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.13
156	0.12
157	0.12
158	0.11
159	0.12
160	0.11
161	0.11
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.2
174	0.25
175	0.33
176	0.39
177	0.45
178	0.5
179	0.48
180	0.49
181	0.48
182	0.49
183	0.48
184	0.43
185	0.41
186	0.41
187	0.44
188	0.41
189	0.36
190	0.32
191	0.27
192	0.33
193	0.3
194	0.27
195	0.25
196	0.3
197	0.3
198	0.27
199	0.23
200	0.16
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.13
205	0.17
206	0.19
207	0.23
208	0.24
209	0.24
210	0.26
211	0.29
212	0.33
213	0.34
214	0.34
215	0.37
216	0.43
217	0.5
218	0.49
219	0.5
220	0.46
221	0.41
222	0.4
223	0.33
224	0.25
225	0.2
226	0.17
227	0.13
228	0.14
229	0.18
230	0.19
231	0.22
232	0.24
233	0.22
234	0.24
235	0.25
236	0.3
237	0.26
238	0.28
239	0.25
240	0.25
241	0.23
242	0.22
243	0.2
244	0.15
245	0.14
246	0.14
247	0.13
248	0.1
249	0.11
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.06
255	0.09
256	0.11
257	0.12
258	0.13
259	0.14
260	0.19
261	0.22
262	0.22
263	0.2
264	0.19
265	0.22
266	0.22
267	0.21
268	0.17
269	0.12
270	0.12
271	0.11
272	0.11
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.1
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.15
281	0.15
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.19
286	0.19
287	0.19
288	0.16
289	0.15
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.12
297	0.14
298	0.13
299	0.14
300	0.17
301	0.19
302	0.21
303	0.26
304	0.31
305	0.37
306	0.39
307	0.47
308	0.48
309	0.53
310	0.53
311	0.57
312	0.53
313	0.49
314	0.48
315	0.39
316	0.35
317	0.28
318	0.24
319	0.15
320	0.09
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.12
329	0.16
330	0.21
331	0.2
332	0.19
333	0.19
334	0.19
335	0.18
336	0.16
337	0.12
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.12
346	0.16
347	0.17
348	0.18
349	0.18
350	0.17
351	0.19
352	0.2
353	0.19
354	0.17
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.16
360	0.19
361	0.27
362	0.29
363	0.32
364	0.36
365	0.44
366	0.47
367	0.44
368	0.46
369	0.37
370	0.37
371	0.33
372	0.32
373	0.23
374	0.18
375	0.18
376	0.13
377	0.13
378	0.09
379	0.1
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.13
384	0.15
385	0.17
386	0.17
387	0.18
388	0.19
389	0.18
390	0.19
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.16
395	0.17
396	0.17
397	0.19
398	0.2
399	0.2
400	0.23
401	0.22
402	0.21
403	0.23
404	0.24
405	0.23
406	0.23
407	0.2
408	0.15
409	0.14
410	0.16
411	0.14
412	0.13
413	0.17
414	0.18
415	0.25
416	0.28
417	0.31
418	0.33
419	0.34
420	0.4
421	0.43
422	0.52
423	0.53
424	0.6
425	0.65
426	0.71
427	0.78
428	0.78
429	0.73
430	0.64
431	0.58
432	0.53
433	0.47
434	0.4
435	0.34
436	0.3
437	0.27
438	0.25
439	0.23
440	0.18
441	0.16
442	0.14
443	0.14
444	0.12
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.12
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.18
457	0.18
458	0.12
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.11
474	0.12
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.1
483	0.11
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.11
488	0.11
489	0.1
490	0.07
491	0.06
492	0.07
493	0.08
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.1
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.11
512	0.14
513	0.14
514	0.16
515	0.18
516	0.21
517	0.22
518	0.24
519	0.25
520	0.23
521	0.22
522	0.22
523	0.17
524	0.18
525	0.17
526	0.15
527	0.13
528	0.12
529	0.12
530	0.14
531	0.16
532	0.15
533	0.15
534	0.18
535	0.21
536	0.23
537	0.22
538	0.18
539	0.18
540	0.19
541	0.19
542	0.16
543	0.14
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.11
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.07
559	0.07
560	0.08
561	0.11
562	0.12
563	0.14
564	0.19
565	0.23
566	0.29
567	0.38
568	0.47
569	0.54
570	0.62
571	0.66
572	0.69
573	0.67
574	0.62
575	0.56
576	0.48
577	0.39
578	0.3
579	0.25
580	0.18
581	0.14
582	0.11
583	0.09
584	0.07
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.07
590	0.08
591	0.11
592	0.12
593	0.13
594	0.16
595	0.17
596	0.18
597	0.19
598	0.27
599	0.29
600	0.3
601	0.32
602	0.3
603	0.33
604	0.34
605	0.33
606	0.24
607	0.2
608	0.18
609	0.15
610	0.14
611	0.1
612	0.07
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.06
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.08
638	0.12
639	0.15
640	0.17
641	0.22
642	0.21
643	0.23
644	0.24
645	0.24
646	0.2
647	0.21
648	0.23
649	0.26
650	0.27
651	0.26
652	0.25
653	0.26
654	0.24
655	0.2
656	0.17
657	0.1
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.11
662	0.12
663	0.15
664	0.14
665	0.14
666	0.14
667	0.14
668	0.17
669	0.17
670	0.18
671	0.2
672	0.23
673	0.28
674	0.28
675	0.27
676	0.25
677	0.29
678	0.31
679	0.29
680	0.27
681	0.24
682	0.27
683	0.27
684	0.27
685	0.19
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.13
690	0.1
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.05
696	0.05
697	0.08
698	0.1
699	0.11
700	0.12
701	0.13
702	0.13
703	0.15
704	0.17
705	0.18
706	0.2
707	0.2
708	0.21
709	0.22
710	0.21
711	0.2
712	0.2
713	0.17
714	0.16
715	0.19
716	0.17
717	0.16
718	0.17
719	0.17
720	0.15
721	0.14
722	0.13
723	0.09
724	0.07
725	0.08
726	0.07
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.09
737	0.09
738	0.1
739	0.12
740	0.16
741	0.16
742	0.16
743	0.16
744	0.19
745	0.18
746	0.23
747	0.22
748	0.2
749	0.19
750	0.2
751	0.22
752	0.22
753	0.27
754	0.24
755	0.24
756	0.22
757	0.22
758	0.24
759	0.2
760	0.17
761	0.12
762	0.09
763	0.08
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.1
768	0.12
769	0.12
770	0.14
771	0.14
772	0.13
773	0.15
774	0.12
775	0.14
776	0.14
777	0.15
778	0.12
779	0.13
780	0.16
781	0.17
782	0.18
783	0.17
784	0.19
785	0.24
786	0.3
787	0.34
788	0.35
789	0.35
790	0.34
791	0.38
792	0.34
793	0.31
794	0.27
795	0.22
796	0.18
797	0.17
798	0.16
799	0.13
800	0.14
801	0.12
802	0.12
803	0.12
804	0.13
805	0.13
806	0.13
807	0.17
808	0.2
809	0.22
810	0.23
811	0.23
812	0.23
813	0.23
814	0.26
815	0.25
816	0.23
817	0.21
818	0.18
819	0.18
820	0.16
821	0.16
822	0.16
823	0.16
824	0.19
825	0.19
826	0.2
827	0.21
828	0.21
829	0.22
830	0.23
831	0.28
832	0.29
833	0.3
834	0.32
835	0.3
836	0.3
837	0.29
838	0.24
839	0.19
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.15
844	0.16
845	0.16
846	0.16
847	0.15
848	0.15
849	0.17
850	0.17
851	0.22
852	0.25
853	0.29
854	0.3
855	0.28
856	0.29
857	0.29
858	0.32
859	0.29
860	0.33
861	0.33
862	0.37
863	0.4
864	0.43
865	0.42
866	0.4
867	0.37
868	0.32
869	0.37
870	0.32
871	0.34
872	0.37
873	0.36
874	0.33
875	0.32
876	0.31
877	0.24
878	0.25
879	0.25
880	0.21
881	0.25
882	0.3
883	0.37
884	0.47
885	0.47
886	0.52
887	0.51
888	0.59
889	0.64
890	0.69
891	0.73
892	0.69
893	0.77
894	0.8
895	0.81
896	0.75
897	0.71
898	0.63
899	0.53
900	0.48
901	0.38
902	0.34
903	0.3
904	0.29
905	0.25
906	0.23
907	0.22
908	0.2
909	0.19
910	0.17
911	0.16
912	0.12
913	0.11
914	0.12
915	0.13
916	0.13
917	0.12
918	0.1
919	0.1
920	0.09
921	0.09
922	0.07
923	0.06
924	0.06
925	0.06
926	0.05
927	0.05
928	0.04
929	0.04
930	0.05
931	0.06
932	0.07
933	0.07
934	0.08
935	0.08
936	0.1
937	0.13
938	0.16
939	0.2
940	0.22
941	0.24
942	0.23
943	0.24
944	0.23
945	0.22
946	0.18
947	0.14
948	0.12
949	0.1
950	0.1
951	0.1
952	0.1
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.06
957	0.1
958	0.11
959	0.11
960	0.11
961	0.13
962	0.13
963	0.15
964	0.15
965	0.13
966	0.12
967	0.12
968	0.15
969	0.13
970	0.17
971	0.16
972	0.17
973	0.16
974	0.16
975	0.17
976	0.15
977	0.15
978	0.1
979	0.11
980	0.09
981	0.1
982	0.1
983	0.08
984	0.07
985	0.07
986	0.07
987	0.05
988	0.06
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.08
993	0.1
994	0.12
995	0.14
996	0.18
997	0.24
998	0.29
999	0.38
1000	0.45
1001	0.49
1002	0.57
1003	0.62
1004	0.63
1005	0.63
1006	0.64
1007	0.62
1008	0.55
1009	0.5
1010	0.4
1011	0.35
1012	0.29
1013	0.23
1014	0.17
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.1
1018	0.1
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.09
1022	0.07
1023	0.07
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.06
1031	0.06
1032	0.05
1033	0.04
1034	0.05
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.12
1049	0.14
1050	0.18
1051	0.2
1052	0.27
1053	0.31
1054	0.39
1055	0.47
1056	0.48
1057	0.56
1058	0.52
1059	0.51
1060	0.46
1061	0.47
1062	0.42
1063	0.36
1064	0.3
1065	0.25
1066	0.26
1067	0.29
1068	0.31
1069	0.32
1070	0.35
1071	0.42
1072	0.47
1073	0.48
1074	0.54
1075	0.57
1076	0.63
1077	0.6
1078	0.63
1079	0.56
1080	0.5
1081	0.49
1082	0.43
1083	0.4
1084	0.37
1085	0.37
1086	0.29
1087	0.3
1088	0.34
1089	0.31
1090	0.32
1091	0.31
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.27
1095	0.24
1096	0.2
1097	0.2
1098	0.22
1099	0.2
1100	0.21
1101	0.21
1102	0.21
1103	0.3
1104	0.35
1105	0.36
1106	0.32
1107	0.34
1108	0.35
1109	0.34
1110	0.33
1111	0.27
1112	0.32
1113	0.34
1114	0.37
1115	0.38
1116	0.33
1117	0.35
1118	0.36
1119	0.38
1120	0.38
1121	0.38
1122	0.36
1123	0.38
1124	0.44
1125	0.47
1126	0.52
1127	0.52
1128	0.49
1129	0.51
1130	0.59
1131	0.59
1132	0.62
1133	0.64
1134	0.61
1135	0.68
1136	0.7
1137	0.72
1138	0.73

A0A2C5XBY0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer