FuNGI

A0A2C5XIM1

Protein Details

Accession

A0A2C5XIM1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-50	QGLPARRPPPQALRPPRRRPADPMV	Hydrophilic
202-227	IAPGIKEQKQPKQKPKEEKINLNRMP	Hydrophilic
414-443	QMRDERIKREQSRKLKKKFLKRVNENAIES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
31-59	RRPPPQALRPPRRRPADPMVARKRPNAAK
210-217	KQPKQKPK
343-344	KR
420-434	IKREQSRKLKKKFLK
497-535	KKAVPDPLKKKSLKRAGSPGASESSGNESSRKKSKIKKI

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPSGPPQPMGTPTPNGALNGSQGLPARRPPPQALRPPRRRPADPMVARKRPNAAKQIGFRKMADSTSMDRFPTKSLEDLQRRRQQYGGWSEPPPNVSYADYPVVTTKRELREHMRIHAMRFIKSKGGDDSTVIDPTNQNEFTRPVTLHRRDPRQPPPGRAPPKEPTPEPVAVDEKEAERLAQLKADKEAQRAIDQAKIAPGIKEQKQPKQKPKEEKINLNRMPTTAKGKKQSDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYESALSESYVALLIDGNKFRMIPIEKWYKFTAKPPFVPISADQAEDMLRKQIPVTRWLMKKEEEKAEGQKRMQEFRAASGPAKRRRPDQESRDYDEVDMDPGDEFQDDDETGGILDFDDEDAKISNERIRKNQLGANLFGDGDEKDVDEKESAQMRDERIKREQSRKLKKKFLKRVNENAIESDDSDSDPFLAQASSADEDSDEEEEEKKEEEKQKDKPEDDGEEDKTKGSETSNAKKAVPDPLKKKSLKRAGSPGASESSGNESSRKKSKIKKIGVAGQSRASTPLASTQRRKVGGAANLSDDGEATAGEMSDSHPRKKIRIIGNKPVASGSRAGSPVPPTASIGPIQPHEIIAALPELPDGITILNLFKSFDDRVGDRPGLMSKSDWLKLVRENSQYGQDKLLRRKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.37
4	0.37
5	0.34
6	0.31
7	0.29
8	0.24
9	0.21
10	0.21
11	0.19
12	0.18
13	0.2
14	0.22
15	0.24
16	0.29
17	0.31
18	0.34
19	0.39
20	0.44
21	0.51
22	0.58
23	0.66
24	0.71
25	0.78
26	0.83
27	0.88
28	0.9
29	0.88
30	0.83
31	0.8
32	0.79
33	0.79
34	0.77
35	0.78
36	0.79
37	0.8
38	0.78
39	0.74
40	0.73
41	0.7
42	0.69
43	0.68
44	0.65
45	0.64
46	0.69
47	0.75
48	0.73
49	0.68
50	0.6
51	0.54
52	0.49
53	0.42
54	0.36
55	0.31
56	0.28
57	0.31
58	0.33
59	0.31
60	0.3
61	0.3
62	0.29
63	0.3
64	0.27
65	0.24
66	0.29
67	0.38
68	0.46
69	0.54
70	0.62
71	0.66
72	0.67
73	0.66
74	0.61
75	0.55
76	0.53
77	0.55
78	0.52
79	0.48
80	0.47
81	0.49
82	0.49
83	0.48
84	0.4
85	0.31
86	0.25
87	0.22
88	0.21
89	0.22
90	0.22
91	0.2
92	0.2
93	0.23
94	0.23
95	0.22
96	0.23
97	0.27
98	0.32
99	0.35
100	0.4
101	0.43
102	0.51
103	0.54
104	0.56
105	0.59
106	0.53
107	0.51
108	0.53
109	0.48
110	0.42
111	0.42
112	0.39
113	0.34
114	0.33
115	0.34
116	0.32
117	0.33
118	0.3
119	0.28
120	0.3
121	0.26
122	0.26
123	0.23
124	0.2
125	0.17
126	0.18
127	0.23
128	0.2
129	0.19
130	0.19
131	0.21
132	0.23
133	0.26
134	0.24
135	0.24
136	0.34
137	0.38
138	0.46
139	0.52
140	0.58
141	0.62
142	0.7
143	0.73
144	0.74
145	0.75
146	0.72
147	0.74
148	0.76
149	0.77
150	0.73
151	0.7
152	0.66
153	0.68
154	0.67
155	0.59
156	0.52
157	0.5
158	0.48
159	0.42
160	0.39
161	0.34
162	0.29
163	0.29
164	0.26
165	0.2
166	0.2
167	0.18
168	0.15
169	0.12
170	0.14
171	0.12
172	0.15
173	0.16
174	0.15
175	0.17
176	0.25
177	0.26
178	0.26
179	0.3
180	0.27
181	0.28
182	0.29
183	0.28
184	0.24
185	0.22
186	0.21
187	0.18
188	0.19
189	0.17
190	0.15
191	0.18
192	0.22
193	0.25
194	0.33
195	0.37
196	0.44
197	0.54
198	0.64
199	0.7
200	0.74
201	0.78
202	0.81
203	0.85
204	0.87
205	0.84
206	0.85
207	0.84
208	0.83
209	0.78
210	0.71
211	0.62
212	0.52
213	0.47
214	0.4
215	0.4
216	0.36
217	0.38
218	0.43
219	0.45
220	0.49
221	0.54
222	0.59
223	0.58
224	0.57
225	0.55
226	0.5
227	0.48
228	0.45
229	0.39
230	0.33
231	0.25
232	0.19
233	0.16
234	0.12
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.11
245	0.09
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.05
260	0.06
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.14
268	0.16
269	0.15
270	0.22
271	0.32
272	0.32
273	0.36
274	0.38
275	0.36
276	0.35
277	0.4
278	0.43
279	0.37
280	0.38
281	0.4
282	0.4
283	0.37
284	0.38
285	0.31
286	0.28
287	0.24
288	0.23
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.14
293	0.14
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.12
299	0.13
300	0.17
301	0.21
302	0.26
303	0.29
304	0.32
305	0.34
306	0.34
307	0.38
308	0.39
309	0.39
310	0.34
311	0.34
312	0.39
313	0.43
314	0.43
315	0.39
316	0.37
317	0.34
318	0.35
319	0.33
320	0.3
321	0.23
322	0.21
323	0.24
324	0.21
325	0.21
326	0.24
327	0.31
328	0.34
329	0.41
330	0.41
331	0.43
332	0.5
333	0.56
334	0.59
335	0.6
336	0.63
337	0.62
338	0.67
339	0.62
340	0.56
341	0.48
342	0.39
343	0.31
344	0.21
345	0.14
346	0.08
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.1
373	0.15
374	0.18
375	0.23
376	0.29
377	0.31
378	0.33
379	0.34
380	0.37
381	0.34
382	0.33
383	0.29
384	0.23
385	0.21
386	0.18
387	0.16
388	0.1
389	0.09
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.1
398	0.16
399	0.16
400	0.17
401	0.2
402	0.22
403	0.3
404	0.33
405	0.34
406	0.35
407	0.44
408	0.49
409	0.56
410	0.63
411	0.65
412	0.73
413	0.79
414	0.81
415	0.83
416	0.83
417	0.85
418	0.86
419	0.86
420	0.85
421	0.84
422	0.86
423	0.84
424	0.82
425	0.72
426	0.63
427	0.55
428	0.44
429	0.36
430	0.27
431	0.18
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.17
458	0.24
459	0.31
460	0.37
461	0.45
462	0.55
463	0.62
464	0.62
465	0.61
466	0.58
467	0.54
468	0.53
469	0.49
470	0.43
471	0.38
472	0.37
473	0.32
474	0.27
475	0.24
476	0.19
477	0.16
478	0.19
479	0.23
480	0.31
481	0.37
482	0.4
483	0.39
484	0.41
485	0.42
486	0.44
487	0.46
488	0.46
489	0.47
490	0.53
491	0.62
492	0.65
493	0.7
494	0.7
495	0.71
496	0.69
497	0.69
498	0.7
499	0.69
500	0.68
501	0.62
502	0.54
503	0.47
504	0.41
505	0.34
506	0.25
507	0.24
508	0.22
509	0.21
510	0.23
511	0.23
512	0.28
513	0.37
514	0.41
515	0.43
516	0.51
517	0.61
518	0.67
519	0.73
520	0.75
521	0.75
522	0.78
523	0.79
524	0.75
525	0.67
526	0.61
527	0.53
528	0.45
529	0.39
530	0.3
531	0.22
532	0.17
533	0.23
534	0.27
535	0.33
536	0.38
537	0.43
538	0.5
539	0.52
540	0.52
541	0.48
542	0.47
543	0.46
544	0.46
545	0.4
546	0.36
547	0.35
548	0.34
549	0.29
550	0.22
551	0.16
552	0.1
553	0.08
554	0.06
555	0.05
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.06
560	0.16
561	0.2
562	0.23
563	0.29
564	0.31
565	0.35
566	0.43
567	0.5
568	0.51
569	0.59
570	0.64
571	0.69
572	0.77
573	0.74
574	0.68
575	0.62
576	0.52
577	0.43
578	0.37
579	0.28
580	0.23
581	0.23
582	0.23
583	0.23
584	0.24
585	0.26
586	0.26
587	0.25
588	0.22
589	0.23
590	0.25
591	0.22
592	0.23
593	0.22
594	0.21
595	0.23
596	0.21
597	0.19
598	0.17
599	0.17
600	0.13
601	0.11
602	0.11
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.08
614	0.09
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.15
619	0.15
620	0.18
621	0.22
622	0.22
623	0.26
624	0.33
625	0.33
626	0.29
627	0.3
628	0.31
629	0.28
630	0.28
631	0.25
632	0.24
633	0.3
634	0.31
635	0.33
636	0.3
637	0.32
638	0.38
639	0.43
640	0.45
641	0.44
642	0.46
643	0.46
644	0.53
645	0.55
646	0.49
647	0.5
648	0.49
649	0.52

A0A2C5XIM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer