Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X5C4

Protein Details
Accession A0A2C5X5C4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-322CQPKSQHTRSNSKRRRPRSKPSSPVPTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-314SKRRRPRSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDDERSRLLSRISQLAGQINRHKNSQTSGSLRAGAHSQSGYNTPSNGYHPYQRARGTRGGYRGRGHYAGFSGRLPAPNSSNTSTSDVVTSASTSTTTPSFVTRSDRHLQLINTNVYDQDASSHSRALQLSKQKHLQDKSAREKAKLRSFLRSKAISPSNINHSDNRQYTIDVGGIKYHVANGGSKLIKAGSTHPRGPISQSQLSNLSPDKLNMDGPTPKIAMVGGVKFFRSKHGNLYRESITTRTGHEKLRAMQSLFFFRYYSFSKLRFPALRLFEIPNSRYSMWQTTSASGVVCQPKSQHTRSNSKRRRPRSKPSSPVPTLTCVLVFYLGSCPKGPQCRYVHDYSRVAICKEFLQKGTCPSGDHCDLSHDLKPERTPTCLHYSKGNCSNPECRYAHSVASLGAMVCQSFGLYGYCDKGTECPQRHVFECPDFSNTGKCNTKGCKLLHRERASVLRKQQEREANGDYTDISSDEESVGSGDFDSDMEELFHDDDDSDFDLDQDMVAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.39
3 0.4
4 0.41
5 0.47
6 0.5
7 0.5
8 0.52
9 0.51
10 0.47
11 0.48
12 0.48
13 0.47
14 0.43
15 0.47
16 0.46
17 0.48
18 0.45
19 0.42
20 0.37
21 0.3
22 0.28
23 0.22
24 0.2
25 0.17
26 0.21
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.22
32 0.24
33 0.28
34 0.28
35 0.32
36 0.38
37 0.42
38 0.47
39 0.52
40 0.54
41 0.54
42 0.58
43 0.55
44 0.54
45 0.58
46 0.6
47 0.58
48 0.57
49 0.56
50 0.55
51 0.52
52 0.46
53 0.39
54 0.35
55 0.32
56 0.29
57 0.25
58 0.24
59 0.24
60 0.27
61 0.27
62 0.26
63 0.26
64 0.29
65 0.34
66 0.33
67 0.32
68 0.31
69 0.34
70 0.32
71 0.29
72 0.25
73 0.2
74 0.18
75 0.16
76 0.14
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.23
89 0.24
90 0.3
91 0.35
92 0.36
93 0.37
94 0.39
95 0.38
96 0.36
97 0.4
98 0.36
99 0.3
100 0.29
101 0.26
102 0.23
103 0.21
104 0.16
105 0.12
106 0.11
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.26
115 0.32
116 0.36
117 0.41
118 0.48
119 0.49
120 0.56
121 0.56
122 0.58
123 0.58
124 0.63
125 0.66
126 0.69
127 0.66
128 0.62
129 0.66
130 0.66
131 0.66
132 0.65
133 0.58
134 0.59
135 0.61
136 0.64
137 0.64
138 0.57
139 0.49
140 0.48
141 0.5
142 0.43
143 0.42
144 0.39
145 0.4
146 0.42
147 0.43
148 0.37
149 0.37
150 0.41
151 0.39
152 0.39
153 0.32
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.22
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.19
177 0.22
178 0.27
179 0.29
180 0.32
181 0.33
182 0.33
183 0.36
184 0.36
185 0.33
186 0.34
187 0.32
188 0.31
189 0.32
190 0.32
191 0.3
192 0.25
193 0.2
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.13
199 0.11
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.15
217 0.18
218 0.18
219 0.26
220 0.35
221 0.38
222 0.38
223 0.42
224 0.39
225 0.36
226 0.36
227 0.27
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.24
235 0.26
236 0.27
237 0.32
238 0.32
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.17
246 0.15
247 0.18
248 0.18
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.3
255 0.29
256 0.28
257 0.3
258 0.31
259 0.31
260 0.29
261 0.3
262 0.28
263 0.3
264 0.28
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.2
272 0.23
273 0.22
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.17
278 0.13
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.16
284 0.22
285 0.29
286 0.32
287 0.34
288 0.36
289 0.47
290 0.56
291 0.67
292 0.69
293 0.73
294 0.8
295 0.83
296 0.88
297 0.87
298 0.88
299 0.87
300 0.89
301 0.88
302 0.86
303 0.86
304 0.77
305 0.72
306 0.63
307 0.55
308 0.45
309 0.37
310 0.28
311 0.18
312 0.16
313 0.12
314 0.1
315 0.07
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.18
322 0.27
323 0.27
324 0.31
325 0.34
326 0.39
327 0.45
328 0.5
329 0.52
330 0.5
331 0.5
332 0.43
333 0.46
334 0.41
335 0.36
336 0.3
337 0.25
338 0.23
339 0.27
340 0.28
341 0.24
342 0.25
343 0.26
344 0.3
345 0.34
346 0.3
347 0.26
348 0.26
349 0.3
350 0.3
351 0.29
352 0.24
353 0.23
354 0.25
355 0.27
356 0.28
357 0.25
358 0.24
359 0.26
360 0.28
361 0.31
362 0.3
363 0.29
364 0.28
365 0.29
366 0.37
367 0.38
368 0.36
369 0.39
370 0.42
371 0.47
372 0.55
373 0.55
374 0.49
375 0.5
376 0.56
377 0.5
378 0.54
379 0.47
380 0.4
381 0.42
382 0.4
383 0.37
384 0.3
385 0.29
386 0.21
387 0.21
388 0.18
389 0.12
390 0.11
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.07
400 0.08
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.15
406 0.23
407 0.32
408 0.34
409 0.4
410 0.46
411 0.5
412 0.51
413 0.53
414 0.5
415 0.47
416 0.48
417 0.41
418 0.39
419 0.36
420 0.36
421 0.36
422 0.33
423 0.34
424 0.35
425 0.35
426 0.39
427 0.43
428 0.48
429 0.49
430 0.52
431 0.54
432 0.58
433 0.66
434 0.69
435 0.7
436 0.66
437 0.63
438 0.69
439 0.65
440 0.63
441 0.62
442 0.61
443 0.61
444 0.61
445 0.65
446 0.64
447 0.61
448 0.6
449 0.56
450 0.49
451 0.44
452 0.41
453 0.33
454 0.25
455 0.22
456 0.16
457 0.13
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.11
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.13
487 0.12