Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X171

Protein Details
Accession A0A2C5X171    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-405MRERDPEKDRAKQRQRSEKAPDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-398KHEKEKHMRERDPEKDRAKQRQR
Subcellular Location(s) extr 7, E.R. 5, mito 4, cyto 3, golg 3, plas 2, cyto_nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003737  GlcNAc_PI_deacetylase-related  
IPR024078  LmbE-like_dom_sf  
IPR034105  Lsm3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000225  F:N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006506  P:GPI anchor biosynthetic process  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF02585  PIG-L  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01730  LSm3  
Amino Acid Sequences MKMVPAGLRLHDPAMASLLAVGAALVALPALYASLASAVQPRLPTLRNKRICLLIAHPDDEAMFFAPTVLALTRPETGNHVKILCLSSGDADGLGETRKKELQKSAVLLGLRTENDVFVVESPDFPDSMTARWDEGKISNFLARLFTTIHSATQTPITNIDVIVTFDQHGISSHPNHISLFHGAQTFISKLAHIANDGGRSPVDLYTLTTVGMLRKYVGFHDALASLLVWLGSGTGFVSPPATAVTADDNTGEEDGSARESPKSLIFFSPFRGSSRDIPSVSRARAAMTQAHVSQMRWFRWGWITLSRYMYLNDLRLISPMALDLTPDDNSSEDVPDDAEESAEAASDVDVPNAAAPVPAAPTSVIDSEPKSHEAKHEKEKHMRERDPEKDRAKQRQRSEKAPDSSTLTAFSTKYIAGILYMADDEATSSHVSEPLDLVRLLLDEVVFVKLRGDRELKGKLYGYDSHCNLVLGDVEETIYVLEDEEEDEELKTISRKAEMLFVRGDSVVLISPHTPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.13
4 0.11
5 0.1
6 0.08
7 0.07
8 0.06
9 0.03
10 0.03
11 0.03
12 0.02
13 0.02
14 0.02
15 0.02
16 0.02
17 0.02
18 0.02
19 0.03
20 0.03
21 0.04
22 0.05
23 0.06
24 0.1
25 0.11
26 0.14
27 0.15
28 0.17
29 0.21
30 0.24
31 0.34
32 0.4
33 0.5
34 0.56
35 0.59
36 0.62
37 0.62
38 0.61
39 0.55
40 0.5
41 0.49
42 0.45
43 0.42
44 0.38
45 0.33
46 0.3
47 0.26
48 0.21
49 0.13
50 0.09
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.2
64 0.25
65 0.27
66 0.29
67 0.27
68 0.25
69 0.27
70 0.28
71 0.23
72 0.18
73 0.16
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.1
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.13
85 0.18
86 0.21
87 0.26
88 0.33
89 0.38
90 0.42
91 0.44
92 0.44
93 0.43
94 0.4
95 0.35
96 0.29
97 0.26
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.1
115 0.11
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.2
127 0.19
128 0.19
129 0.19
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.18
141 0.18
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.11
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.13
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.17
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.24
262 0.29
263 0.3
264 0.27
265 0.28
266 0.32
267 0.34
268 0.31
269 0.27
270 0.22
271 0.19
272 0.2
273 0.21
274 0.18
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.2
282 0.22
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.23
288 0.25
289 0.22
290 0.23
291 0.24
292 0.26
293 0.28
294 0.26
295 0.24
296 0.23
297 0.23
298 0.18
299 0.17
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.26
361 0.33
362 0.38
363 0.46
364 0.54
365 0.58
366 0.66
367 0.75
368 0.77
369 0.79
370 0.77
371 0.75
372 0.74
373 0.76
374 0.74
375 0.74
376 0.7
377 0.69
378 0.72
379 0.75
380 0.76
381 0.76
382 0.78
383 0.8
384 0.8
385 0.8
386 0.81
387 0.79
388 0.74
389 0.68
390 0.61
391 0.56
392 0.52
393 0.44
394 0.36
395 0.28
396 0.24
397 0.22
398 0.2
399 0.15
400 0.13
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.07
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.12
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.11
437 0.14
438 0.15
439 0.21
440 0.23
441 0.24
442 0.31
443 0.39
444 0.38
445 0.4
446 0.4
447 0.37
448 0.38
449 0.42
450 0.41
451 0.42
452 0.42
453 0.39
454 0.38
455 0.36
456 0.31
457 0.25
458 0.2
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.07
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.11
479 0.12
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.19
484 0.19
485 0.28
486 0.29
487 0.3
488 0.3
489 0.29
490 0.29
491 0.26
492 0.25
493 0.17
494 0.16
495 0.14
496 0.12
497 0.13