Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XFJ2

Protein Details
Accession A0A2C5XFJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-467SKGGRGGDRRHNNTNNNNRDHKPRGGRDHKQPREPKERNENDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
443-460RDHKPRGGRDHKQPREPK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, cyto 6.5, cyto_mito 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR027528  eIF3m  
IPR040750  eIF3m_C_helix  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0071541  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF18005  eIF3m_C_helix  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MAAVSQAQKSSEAASLVFVEGSFEELALEMADFLRIADEVKPLVETKATEEVLAKLVKASSSLTSVPENNFTAAANLMIYLVFQSADPKKHLPALCSSFSKPVANSINGVSLSLNALTTIFNLLPSSNPVRFRVLLEILKYLKQGGMWESLRPYLEFLPAWIQEWDLSRDQQRQVYEETSEVAKEAGHDGESFQYVLKALRTFNPDSTEDLSSEPAQRLALAAVKAALLSNTHFLFQELRSIPAVQALSDSHPAYAQLLEIFAEQDLEDYNDFNDEHNGFLESEGLDANVLHRKMRLLSFASLAAATPNREIPYAAIVKALQIPDDEVELWTIDAIRVGLVEGKLSQQKSVFLVHKVTFRVFSIRQWRELSTRVDQWKTTLRSVLDNLLQARTDLKVQQEREAQELENKLAAAAANNADNEKGNSKGGRGGDRRHNNTNNNNRDHKPRGGRDHKQPREPKERNENDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.12
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.05
23 0.07
24 0.08
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.15
32 0.14
33 0.17
34 0.24
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.23
39 0.26
40 0.25
41 0.2
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.12
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.2
52 0.23
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.23
57 0.22
58 0.2
59 0.17
60 0.15
61 0.13
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.11
72 0.16
73 0.19
74 0.23
75 0.25
76 0.27
77 0.35
78 0.37
79 0.33
80 0.37
81 0.39
82 0.4
83 0.42
84 0.42
85 0.39
86 0.4
87 0.4
88 0.31
89 0.33
90 0.33
91 0.3
92 0.3
93 0.26
94 0.27
95 0.24
96 0.25
97 0.17
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.13
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.23
117 0.27
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.29
122 0.28
123 0.27
124 0.29
125 0.27
126 0.27
127 0.25
128 0.21
129 0.16
130 0.14
131 0.14
132 0.12
133 0.18
134 0.17
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.19
141 0.14
142 0.15
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.18
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.24
157 0.26
158 0.28
159 0.27
160 0.26
161 0.27
162 0.26
163 0.23
164 0.19
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.13
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.24
192 0.24
193 0.25
194 0.27
195 0.24
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.16
200 0.16
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.09
224 0.16
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.06
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.16
283 0.18
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.17
307 0.17
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.1
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.16
335 0.18
336 0.19
337 0.25
338 0.25
339 0.23
340 0.28
341 0.28
342 0.32
343 0.32
344 0.31
345 0.27
346 0.25
347 0.29
348 0.25
349 0.3
350 0.37
351 0.38
352 0.42
353 0.43
354 0.44
355 0.42
356 0.46
357 0.44
358 0.39
359 0.44
360 0.45
361 0.45
362 0.43
363 0.43
364 0.47
365 0.46
366 0.43
367 0.4
368 0.34
369 0.35
370 0.37
371 0.38
372 0.31
373 0.31
374 0.3
375 0.27
376 0.25
377 0.21
378 0.2
379 0.17
380 0.17
381 0.16
382 0.22
383 0.28
384 0.3
385 0.36
386 0.42
387 0.42
388 0.43
389 0.42
390 0.36
391 0.34
392 0.35
393 0.3
394 0.25
395 0.23
396 0.19
397 0.18
398 0.17
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.2
411 0.2
412 0.21
413 0.26
414 0.29
415 0.36
416 0.4
417 0.46
418 0.52
419 0.62
420 0.67
421 0.71
422 0.75
423 0.75
424 0.8
425 0.83
426 0.82
427 0.79
428 0.8
429 0.74
430 0.75
431 0.73
432 0.72
433 0.72
434 0.71
435 0.74
436 0.78
437 0.82
438 0.84
439 0.89
440 0.88
441 0.88
442 0.88
443 0.86
444 0.87
445 0.86
446 0.85
447 0.85