Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5WVH0

Protein Details
Accession A0A2C5WVH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-59TTLVYRMKGRRARKDVRANSMKLHydrophilic
233-254ALSQRRRAKKTHFRKRGSLATKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-249RRRAKKTHFRKRG
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05225  HTH_psq  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MESSSIESRMLLAIQAIKENPKLSTRAAANLYNVPRTTLVYRMKGRRARKDVRANSMKLTELEEKTLLEYILGLGSRGFPPRLVDVEAMANVLLAERNSGRVGKLWASNFVKRQPKLWTRFNRAHDHQRAPCKDPEQTNARPTLAQSMTLQTPTPASPPQPTDDPCVSQTPHDPTEAGLQSTFVESRNAHNHSSSQTPIYSAVDEITKGAEEIMREVVLLRSENKMLREANHALSQRRRAKKTHFRKRGSLATKDGHKSVDQKDLDEQLEQGKRKNGSRKHGTAAAVRRHCGNCGKTGHNARTCEEDSIIAAGFSSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.18
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.27
10 0.26
11 0.32
12 0.31
13 0.34
14 0.36
15 0.36
16 0.36
17 0.4
18 0.41
19 0.38
20 0.36
21 0.32
22 0.29
23 0.29
24 0.28
25 0.29
26 0.33
27 0.36
28 0.45
29 0.5
30 0.59
31 0.64
32 0.71
33 0.73
34 0.77
35 0.77
36 0.79
37 0.83
38 0.81
39 0.84
40 0.83
41 0.74
42 0.69
43 0.63
44 0.54
45 0.44
46 0.41
47 0.37
48 0.3
49 0.3
50 0.26
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.18
55 0.11
56 0.1
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.08
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.14
68 0.16
69 0.18
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.15
76 0.12
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.04
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.14
90 0.15
91 0.2
92 0.19
93 0.26
94 0.3
95 0.34
96 0.35
97 0.4
98 0.46
99 0.41
100 0.44
101 0.46
102 0.51
103 0.54
104 0.6
105 0.62
106 0.62
107 0.69
108 0.72
109 0.71
110 0.67
111 0.71
112 0.68
113 0.66
114 0.64
115 0.66
116 0.63
117 0.59
118 0.57
119 0.5
120 0.47
121 0.42
122 0.42
123 0.39
124 0.4
125 0.39
126 0.37
127 0.35
128 0.31
129 0.28
130 0.29
131 0.22
132 0.19
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.11
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.16
162 0.22
163 0.22
164 0.18
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.19
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.25
181 0.22
182 0.18
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.13
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.26
216 0.27
217 0.28
218 0.31
219 0.33
220 0.35
221 0.39
222 0.47
223 0.5
224 0.56
225 0.57
226 0.58
227 0.65
228 0.71
229 0.77
230 0.78
231 0.79
232 0.77
233 0.81
234 0.82
235 0.82
236 0.78
237 0.73
238 0.68
239 0.64
240 0.65
241 0.6
242 0.54
243 0.45
244 0.41
245 0.41
246 0.39
247 0.42
248 0.35
249 0.34
250 0.36
251 0.39
252 0.37
253 0.32
254 0.28
255 0.27
256 0.32
257 0.32
258 0.32
259 0.34
260 0.37
261 0.44
262 0.53
263 0.54
264 0.58
265 0.66
266 0.67
267 0.67
268 0.69
269 0.65
270 0.63
271 0.64
272 0.64
273 0.58
274 0.54
275 0.54
276 0.5
277 0.51
278 0.51
279 0.45
280 0.42
281 0.44
282 0.47
283 0.5
284 0.58
285 0.62
286 0.61
287 0.61
288 0.55
289 0.57
290 0.55
291 0.48
292 0.4
293 0.31
294 0.26
295 0.24
296 0.22
297 0.14