Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XA80

Protein Details
Accession A0A2C5XA80    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKNKGKGGKNRRRGKNETDKAKRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-23KNKGKGGKNRRRGKNETDKAK
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 7.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKNKGKGGKNRRRGKNETDKAKRELMFKEDGQEYAQVVSTIHTILCVCMTTARKWRGGVELLDTAMICSHRVFDKPIVKMLGNGRLEAQCFDGQKRLANIRGTMRKKVWINQGDIILLSLRDYQDSKGDVILKYTADEARSLKAYGELPENAKINETDTYGGDGGEECNFEFADAASDEEEEETGDIDVDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.86
3 0.86
4 0.85
5 0.86
6 0.86
7 0.82
8 0.77
9 0.77
10 0.69
11 0.63
12 0.57
13 0.51
14 0.46
15 0.41
16 0.42
17 0.36
18 0.33
19 0.29
20 0.26
21 0.22
22 0.17
23 0.17
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.11
37 0.14
38 0.18
39 0.26
40 0.3
41 0.32
42 0.33
43 0.34
44 0.33
45 0.34
46 0.3
47 0.25
48 0.23
49 0.2
50 0.19
51 0.17
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.12
61 0.18
62 0.24
63 0.25
64 0.28
65 0.29
66 0.27
67 0.3
68 0.3
69 0.31
70 0.25
71 0.24
72 0.22
73 0.21
74 0.21
75 0.18
76 0.18
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.22
88 0.25
89 0.34
90 0.35
91 0.37
92 0.36
93 0.38
94 0.38
95 0.42
96 0.45
97 0.4
98 0.41
99 0.39
100 0.38
101 0.32
102 0.3
103 0.25
104 0.16
105 0.11
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.14
121 0.13
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.16
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.23
138 0.24
139 0.21
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06