Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X2N7

Protein Details
Accession A0A2C5X2N7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32SAEPIKKHGRGRPRKGEERVKKVYVBasic
168-188SPGNPAKRGRGRPRKVVQPSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-46IKKHGRGRPRKGEERVKKVYVPTGRPRGRPKGSRN
129-135PRGRPRK
173-182AKRGRGRPRK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MAPVIADSAEPIKKHGRGRPRKGEERVKKVYVPTGRPRGRPKGSRNIKALESITTSISNSVSVATVSAVPPPSAAAPQASIATATPIPLPTSLSSTSAPAKSPALSATTANAAATAAANRSVYVPTGRPRGRPRKDGLPPQQRKPFPSPTSSSPTSSTAVVAAMAVASPGNPAKRGRGRPRKVVQPSVGEAMGNDTLVNEAESALLRTMTTLKTTTTMTDDGRNCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.44
3 0.51
4 0.59
5 0.69
6 0.77
7 0.8
8 0.84
9 0.86
10 0.9
11 0.89
12 0.88
13 0.85
14 0.78
15 0.71
16 0.65
17 0.64
18 0.6
19 0.58
20 0.58
21 0.61
22 0.63
23 0.67
24 0.72
25 0.74
26 0.75
27 0.76
28 0.75
29 0.75
30 0.79
31 0.8
32 0.77
33 0.71
34 0.63
35 0.58
36 0.51
37 0.42
38 0.35
39 0.28
40 0.25
41 0.21
42 0.2
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.09
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.1
77 0.08
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.12
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.1
112 0.13
113 0.22
114 0.23
115 0.28
116 0.38
117 0.48
118 0.53
119 0.57
120 0.58
121 0.6
122 0.66
123 0.7
124 0.71
125 0.71
126 0.71
127 0.73
128 0.77
129 0.69
130 0.67
131 0.64
132 0.63
133 0.54
134 0.54
135 0.51
136 0.47
137 0.52
138 0.49
139 0.45
140 0.38
141 0.37
142 0.33
143 0.28
144 0.23
145 0.16
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.06
157 0.08
158 0.1
159 0.12
160 0.2
161 0.3
162 0.4
163 0.5
164 0.59
165 0.65
166 0.73
167 0.79
168 0.81
169 0.81
170 0.79
171 0.73
172 0.68
173 0.64
174 0.57
175 0.5
176 0.39
177 0.31
178 0.26
179 0.21
180 0.15
181 0.12
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.16
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.23
205 0.23
206 0.3