FuNGI

A0A2C5X2J0

Protein Details

Accession

A0A2C5X2J0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
282-305	MEDFKQFKKDQKDKKKTVTFQPSE	Hydrophilic
402-429	GGHEVRPRGTNKKQQRKMRQQDGVARLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAKGKWIDKKNATHFQLVYRPQNDPLIHDENAPGMVLNPIQTPEQSASTNPQQHVGKTLGDLSSLLGSAAHVRENEGEAANHGIYYDDSEYDYMQHMRELGTGAGEAVFIEANKPDANKGKKKMNLEDAIRQMSIGESQKPVDKLDESILPSQNLQPISYQNQQNVPDSIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDSEDDDLFQDLTKGAEELDEYEFDETYDEDFGENDGYESDGTAKPTQEYRDGAGPAIKNDEEDDEVPELVSVDENGEVIPPAASSDWMEDFKQFKKDQKDKKKTVTFQPSEMQASTWTATTNGGNRKRRKGALSTPSMTSMSSSVLVRTEQLELLDRRFEVLQNKEFQNWDGIDDNVSMSEMSAMSSVSTVQGDVRQDFDDILDEFLGGHEVRPRGTNKKQQRKMRQQDGVARLDELRRGLGPAHLRGRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.63
3	0.63
4	0.61
5	0.61
6	0.54
7	0.52
8	0.48
9	0.54
10	0.48
11	0.42
12	0.42
13	0.39
14	0.36
15	0.35
16	0.32
17	0.26
18	0.26
19	0.22
20	0.14
21	0.09
22	0.1
23	0.1
24	0.1
25	0.1
26	0.11
27	0.12
28	0.12
29	0.15
30	0.16
31	0.19
32	0.18
33	0.19
34	0.24
35	0.32
36	0.39
37	0.36
38	0.4
39	0.39
40	0.39
41	0.42
42	0.37
43	0.3
44	0.24
45	0.27
46	0.2
47	0.19
48	0.18
49	0.15
50	0.13
51	0.12
52	0.1
53	0.07
54	0.07
55	0.1
56	0.11
57	0.12
58	0.11
59	0.13
60	0.14
61	0.16
62	0.18
63	0.15
64	0.15
65	0.14
66	0.17
67	0.15
68	0.13
69	0.11
70	0.1
71	0.09
72	0.11
73	0.11
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.13
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.04
97	0.05
98	0.05
99	0.07
100	0.08
101	0.08
102	0.12
103	0.2
104	0.29
105	0.36
106	0.42
107	0.5
108	0.54
109	0.61
110	0.64
111	0.65
112	0.64
113	0.6
114	0.61
115	0.56
116	0.53
117	0.46
118	0.39
119	0.3
120	0.23
121	0.23
122	0.18
123	0.15
124	0.14
125	0.15
126	0.2
127	0.2
128	0.21
129	0.19
130	0.18
131	0.17
132	0.18
133	0.21
134	0.2
135	0.23
136	0.24
137	0.22
138	0.22
139	0.22
140	0.23
141	0.2
142	0.18
143	0.15
144	0.16
145	0.21
146	0.27
147	0.28
148	0.27
149	0.31
150	0.33
151	0.34
152	0.31
153	0.27
154	0.21
155	0.19
156	0.18
157	0.13
158	0.12
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.15
168	0.15
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.11
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.07
221	0.07
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.14
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.16
231	0.19
232	0.19
233	0.18
234	0.2
235	0.18
236	0.16
237	0.17
238	0.15
239	0.12
240	0.12
241	0.13
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.06
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.07
267	0.09
268	0.1
269	0.11
270	0.13
271	0.16
272	0.18
273	0.25
274	0.25
275	0.3
276	0.39
277	0.49
278	0.57
279	0.66
280	0.74
281	0.75
282	0.83
283	0.86
284	0.81
285	0.82
286	0.82
287	0.73
288	0.66
289	0.62
290	0.55
291	0.48
292	0.42
293	0.32
294	0.22
295	0.21
296	0.18
297	0.14
298	0.12
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.17
303	0.24
304	0.33
305	0.42
306	0.48
307	0.56
308	0.62
309	0.65
310	0.64
311	0.64
312	0.65
313	0.65
314	0.66
315	0.6
316	0.55
317	0.52
318	0.47
319	0.39
320	0.3
321	0.21
322	0.14
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.12
333	0.17
334	0.18
335	0.19
336	0.21
337	0.19
338	0.19
339	0.2
340	0.22
341	0.23
342	0.28
343	0.32
344	0.36
345	0.38
346	0.39
347	0.39
348	0.37
349	0.35
350	0.29
351	0.26
352	0.22
353	0.2
354	0.19
355	0.18
356	0.18
357	0.12
358	0.12
359	0.09
360	0.07
361	0.08
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.11
374	0.14
375	0.15
376	0.17
377	0.17
378	0.17
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.13
383	0.14
384	0.11
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.13
392	0.14
393	0.16
394	0.21
395	0.26
396	0.33
397	0.43
398	0.52
399	0.58
400	0.69
401	0.77
402	0.83
403	0.89
404	0.92
405	0.93
406	0.93
407	0.91
408	0.88
409	0.88
410	0.85
411	0.79
412	0.68
413	0.59
414	0.51
415	0.45
416	0.39
417	0.31
418	0.25
419	0.21
420	0.21
421	0.2
422	0.24
423	0.28
424	0.33

A0A2C5X2J0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer