Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8LXU0

Protein Details
Accession B8LXU0    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-359ANALKRVKKGLEKKKKERDSDTSBasic
649-668NDFKDYCKRKRKTLVTTVPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-354LKRVKKGLEKKKKER
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MDEKKTTVILKTSDDWRKWMEQLRTKATKEQVWEYMNPSTINTGDLEPAPTKPIEPIQPSKPDLSSDEDIAIKQFKLMNWQADMAAHDSQRRIYEHNKARYEKHIERMTNVKNYILDTVELGHQSEIRQMEDIKEIIRTLKRRFALTEQRENDLLLSRERSLLNPKRTQRPKEWAEKWRTLVLDMKLANFYELSDTRLARDFIQSTAEIAPKFHDIWSTRILEYDMGLDTSGLTEIPDINEIIGTFDKWVEANNKLESSHRRDIAMATLNGKSDQPEDNKKSQMRSKSKDKTCLCGQKHQFEDCPYVNPAKRPKDWESDISIEEKFKNLEKKDTPYANALKRVKKGLEKKKKERDSDTSKKTDKDSERSNFMYDSDEIACAVRLDTALLASNDDLTNKVIMDNGTTTHIFNDRRRLRNLGNESRWLLVGNTRIKMTGPGETIVYPTQPISEKVKRKGIIVRDAYQELCHIRREGNLYLIEWDENKPARSSLSVDFAFNSMEKNILKDPMNVWHKRFGHVSSRAIEKLQEATEGAIVMSVPSHNNEGFKIKCETCELTTAKRQISRVAMPLPTRPFQKIFVDIIVMNLARNFDRYILHAVDPLTKFHVLVTTTTKSVNFDLERLIEDIEHTFKCVIETIHVDGESSINGNDFKDYCKRKRKTLVTTVPDTPEQNGLSEKAGDIIATRARSMIIEANLPEGLWPEAARAAVHIMNRTPTKSLNYKTLYESVYGKKPYVGNLFLFGSKTYVRIDTKKSHKVAPRAQIGYLVGYEAHNIWLIWTTGPRGTKVIRARDVVFDETKRYDPEHPFAREIIRDSVTTITESLEILNLEDIDKDNQVFDSVDDDMRLQRWQPASIRFSPARGSNECSNQPDTETPVQIEAPITGIGNIEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.47
3 0.48
4 0.49
5 0.51
6 0.55
7 0.56
8 0.56
9 0.63
10 0.69
11 0.72
12 0.7
13 0.71
14 0.69
15 0.63
16 0.6
17 0.57
18 0.55
19 0.51
20 0.51
21 0.48
22 0.46
23 0.44
24 0.38
25 0.33
26 0.28
27 0.23
28 0.22
29 0.19
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.19
40 0.24
41 0.28
42 0.34
43 0.4
44 0.44
45 0.51
46 0.54
47 0.54
48 0.5
49 0.45
50 0.4
51 0.41
52 0.37
53 0.31
54 0.3
55 0.27
56 0.26
57 0.26
58 0.26
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.17
63 0.25
64 0.3
65 0.33
66 0.32
67 0.33
68 0.31
69 0.3
70 0.31
71 0.25
72 0.24
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.23
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.31
81 0.4
82 0.47
83 0.56
84 0.61
85 0.62
86 0.63
87 0.68
88 0.71
89 0.67
90 0.66
91 0.65
92 0.58
93 0.58
94 0.63
95 0.61
96 0.59
97 0.54
98 0.46
99 0.39
100 0.39
101 0.37
102 0.29
103 0.23
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.17
113 0.17
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.21
119 0.21
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.2
124 0.26
125 0.3
126 0.32
127 0.39
128 0.41
129 0.43
130 0.46
131 0.5
132 0.54
133 0.56
134 0.62
135 0.56
136 0.57
137 0.55
138 0.51
139 0.43
140 0.36
141 0.3
142 0.22
143 0.23
144 0.2
145 0.23
146 0.23
147 0.25
148 0.31
149 0.39
150 0.44
151 0.5
152 0.56
153 0.63
154 0.72
155 0.77
156 0.75
157 0.76
158 0.76
159 0.78
160 0.8
161 0.79
162 0.78
163 0.78
164 0.72
165 0.67
166 0.59
167 0.5
168 0.48
169 0.39
170 0.37
171 0.31
172 0.29
173 0.26
174 0.25
175 0.24
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.19
184 0.22
185 0.23
186 0.19
187 0.23
188 0.21
189 0.19
190 0.22
191 0.2
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.19
202 0.18
203 0.22
204 0.27
205 0.28
206 0.26
207 0.26
208 0.26
209 0.21
210 0.19
211 0.17
212 0.12
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.12
238 0.15
239 0.18
240 0.2
241 0.21
242 0.21
243 0.26
244 0.3
245 0.36
246 0.39
247 0.37
248 0.35
249 0.35
250 0.35
251 0.35
252 0.35
253 0.27
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.17
260 0.14
261 0.18
262 0.21
263 0.3
264 0.35
265 0.39
266 0.46
267 0.48
268 0.51
269 0.53
270 0.58
271 0.58
272 0.59
273 0.65
274 0.69
275 0.73
276 0.77
277 0.72
278 0.69
279 0.68
280 0.71
281 0.64
282 0.63
283 0.62
284 0.6
285 0.62
286 0.58
287 0.52
288 0.45
289 0.48
290 0.38
291 0.36
292 0.3
293 0.32
294 0.31
295 0.34
296 0.39
297 0.4
298 0.43
299 0.47
300 0.49
301 0.52
302 0.53
303 0.51
304 0.48
305 0.44
306 0.41
307 0.36
308 0.32
309 0.25
310 0.22
311 0.19
312 0.15
313 0.16
314 0.23
315 0.22
316 0.29
317 0.32
318 0.37
319 0.43
320 0.45
321 0.43
322 0.42
323 0.47
324 0.43
325 0.48
326 0.49
327 0.47
328 0.47
329 0.49
330 0.46
331 0.47
332 0.54
333 0.56
334 0.62
335 0.67
336 0.74
337 0.81
338 0.86
339 0.84
340 0.81
341 0.79
342 0.78
343 0.78
344 0.75
345 0.72
346 0.67
347 0.63
348 0.58
349 0.57
350 0.52
351 0.49
352 0.5
353 0.46
354 0.48
355 0.47
356 0.46
357 0.37
358 0.32
359 0.28
360 0.2
361 0.18
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.08
368 0.07
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.14
396 0.17
397 0.18
398 0.28
399 0.34
400 0.38
401 0.4
402 0.44
403 0.42
404 0.48
405 0.55
406 0.53
407 0.48
408 0.46
409 0.45
410 0.4
411 0.38
412 0.29
413 0.21
414 0.14
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.17
421 0.19
422 0.17
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.08
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.16
437 0.24
438 0.3
439 0.34
440 0.41
441 0.4
442 0.42
443 0.45
444 0.43
445 0.45
446 0.42
447 0.41
448 0.36
449 0.37
450 0.34
451 0.29
452 0.25
453 0.18
454 0.16
455 0.14
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.18
460 0.17
461 0.19
462 0.18
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.15
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.13
476 0.15
477 0.13
478 0.18
479 0.17
480 0.17
481 0.17
482 0.17
483 0.16
484 0.13
485 0.12
486 0.07
487 0.09
488 0.08
489 0.1
490 0.1
491 0.14
492 0.15
493 0.15
494 0.16
495 0.23
496 0.31
497 0.31
498 0.32
499 0.37
500 0.37
501 0.38
502 0.39
503 0.33
504 0.34
505 0.37
506 0.38
507 0.32
508 0.35
509 0.33
510 0.31
511 0.28
512 0.21
513 0.18
514 0.15
515 0.13
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.08
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.05
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.15
533 0.15
534 0.18
535 0.21
536 0.2
537 0.2
538 0.23
539 0.25
540 0.21
541 0.27
542 0.26
543 0.26
544 0.32
545 0.34
546 0.34
547 0.34
548 0.34
549 0.31
550 0.34
551 0.32
552 0.3
553 0.29
554 0.29
555 0.28
556 0.33
557 0.32
558 0.31
559 0.3
560 0.29
561 0.28
562 0.28
563 0.3
564 0.29
565 0.26
566 0.24
567 0.23
568 0.2
569 0.19
570 0.17
571 0.14
572 0.1
573 0.09
574 0.09
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.12
581 0.16
582 0.17
583 0.17
584 0.18
585 0.18
586 0.23
587 0.23
588 0.22
589 0.2
590 0.18
591 0.18
592 0.16
593 0.18
594 0.13
595 0.14
596 0.19
597 0.18
598 0.19
599 0.2
600 0.2
601 0.19
602 0.19
603 0.22
604 0.17
605 0.16
606 0.17
607 0.17
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.1
612 0.1
613 0.11
614 0.13
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.11
622 0.11
623 0.13
624 0.15
625 0.16
626 0.16
627 0.16
628 0.14
629 0.14
630 0.12
631 0.1
632 0.07
633 0.06
634 0.07
635 0.07
636 0.09
637 0.09
638 0.12
639 0.21
640 0.29
641 0.38
642 0.48
643 0.52
644 0.59
645 0.69
646 0.76
647 0.77
648 0.8
649 0.8
650 0.76
651 0.77
652 0.71
653 0.64
654 0.56
655 0.47
656 0.38
657 0.31
658 0.25
659 0.21
660 0.19
661 0.17
662 0.16
663 0.16
664 0.14
665 0.11
666 0.11
667 0.09
668 0.08
669 0.1
670 0.12
671 0.13
672 0.13
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.14
677 0.15
678 0.13
679 0.15
680 0.15
681 0.17
682 0.16
683 0.16
684 0.14
685 0.11
686 0.1
687 0.08
688 0.08
689 0.07
690 0.08
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.1
695 0.12
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.21
700 0.23
701 0.24
702 0.23
703 0.23
704 0.28
705 0.34
706 0.35
707 0.39
708 0.41
709 0.42
710 0.44
711 0.46
712 0.41
713 0.36
714 0.38
715 0.34
716 0.37
717 0.36
718 0.33
719 0.32
720 0.32
721 0.36
722 0.37
723 0.35
724 0.29
725 0.3
726 0.31
727 0.28
728 0.28
729 0.22
730 0.19
731 0.16
732 0.17
733 0.15
734 0.19
735 0.23
736 0.27
737 0.34
738 0.41
739 0.5
740 0.57
741 0.58
742 0.61
743 0.64
744 0.69
745 0.7
746 0.7
747 0.7
748 0.63
749 0.6
750 0.55
751 0.48
752 0.4
753 0.31
754 0.23
755 0.14
756 0.12
757 0.13
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.1
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.13
768 0.17
769 0.19
770 0.2
771 0.22
772 0.23
773 0.3
774 0.37
775 0.43
776 0.44
777 0.47
778 0.48
779 0.5
780 0.52
781 0.49
782 0.46
783 0.38
784 0.37
785 0.37
786 0.37
787 0.34
788 0.33
789 0.36
790 0.37
791 0.43
792 0.47
793 0.48
794 0.48
795 0.48
796 0.49
797 0.44
798 0.42
799 0.39
800 0.33
801 0.29
802 0.28
803 0.28
804 0.25
805 0.23
806 0.19
807 0.15
808 0.13
809 0.13
810 0.12
811 0.11
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.09
816 0.09
817 0.1
818 0.12
819 0.12
820 0.14
821 0.14
822 0.13
823 0.13
824 0.14
825 0.14
826 0.12
827 0.13
828 0.14
829 0.14
830 0.14
831 0.15
832 0.16
833 0.17
834 0.18
835 0.16
836 0.21
837 0.23
838 0.28
839 0.33
840 0.39
841 0.45
842 0.47
843 0.54
844 0.49
845 0.49
846 0.48
847 0.49
848 0.47
849 0.44
850 0.45
851 0.45
852 0.51
853 0.55
854 0.54
855 0.52
856 0.46
857 0.46
858 0.42
859 0.42
860 0.4
861 0.37
862 0.33
863 0.31
864 0.31
865 0.28
866 0.26
867 0.19
868 0.15
869 0.13
870 0.12
871 0.1