Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X455

Protein Details
Accession A0A2C5X455    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-209GGSRSERGHRHRHRRHRSRSRDSRESSPRRBasic
223-244RDYDRRDRDRDDKRRERRTGSSBasic
257-283RSDDRDRRDRDYRRSGRDRRDGRNSKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-241EKHRDGGSRSERGHRHRHRRHRSRSRDSRESSPRREDRDNGRRSDRRSRDYDRRDRDRDDKRRERRT
263-287RRDRDYRRSGRDRRDGRNSKGGDSR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGSGDLNVKKSFHPSLMKNQARVYDEEQKALSERKKTQQRIQEIKEERAKEEVQRQLEAAGGRKRIDRVEWMYQGPNNGQAGTTEELESFLLGKRSIEKVLIGDDNAKLAKNAAQDSFLSSSSANANNARDLAAKIREDPLLAIKQQEQQVYEAMMNDPTRRRQLMSQMGASDKEKHRDGGSRSERGHRHRHRRHRSRSRDSRESSPRREDRDNGRRSDRRSRDYDRRDRDRDDKRRERRTGSSHRDNTEQRDCDKRSDDRDRRDRDYRRSGRDRRDGRNSKGGDSRRSENRSEISLDRRGGSDRHYNSAHKGGVDRRSESGRSSHHRDEVLVKDTRDTKRGQSLRRHSVSPERD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.59
4 0.63
5 0.6
6 0.61
7 0.6
8 0.55
9 0.55
10 0.51
11 0.5
12 0.46
13 0.45
14 0.42
15 0.37
16 0.37
17 0.4
18 0.38
19 0.36
20 0.42
21 0.49
22 0.59
23 0.65
24 0.71
25 0.72
26 0.78
27 0.79
28 0.78
29 0.78
30 0.73
31 0.74
32 0.73
33 0.66
34 0.57
35 0.52
36 0.49
37 0.45
38 0.48
39 0.47
40 0.42
41 0.41
42 0.39
43 0.34
44 0.35
45 0.31
46 0.29
47 0.27
48 0.27
49 0.28
50 0.3
51 0.32
52 0.31
53 0.32
54 0.33
55 0.35
56 0.4
57 0.42
58 0.42
59 0.43
60 0.42
61 0.42
62 0.35
63 0.33
64 0.25
65 0.21
66 0.19
67 0.15
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.18
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.19
104 0.2
105 0.17
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.2
133 0.23
134 0.23
135 0.2
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.13
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.28
152 0.34
153 0.35
154 0.33
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.29
159 0.27
160 0.21
161 0.22
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.26
166 0.28
167 0.32
168 0.36
169 0.37
170 0.38
171 0.44
172 0.48
173 0.48
174 0.57
175 0.56
176 0.61
177 0.66
178 0.76
179 0.8
180 0.85
181 0.91
182 0.91
183 0.93
184 0.92
185 0.93
186 0.91
187 0.89
188 0.83
189 0.81
190 0.8
191 0.78
192 0.73
193 0.72
194 0.68
195 0.64
196 0.64
197 0.6
198 0.6
199 0.63
200 0.62
201 0.57
202 0.61
203 0.6
204 0.62
205 0.67
206 0.64
207 0.6
208 0.62
209 0.65
210 0.67
211 0.72
212 0.77
213 0.76
214 0.77
215 0.76
216 0.74
217 0.76
218 0.76
219 0.76
220 0.77
221 0.78
222 0.78
223 0.83
224 0.83
225 0.8
226 0.77
227 0.77
228 0.77
229 0.76
230 0.77
231 0.73
232 0.7
233 0.7
234 0.65
235 0.63
236 0.61
237 0.54
238 0.47
239 0.5
240 0.49
241 0.47
242 0.5
243 0.48
244 0.48
245 0.56
246 0.62
247 0.63
248 0.71
249 0.73
250 0.74
251 0.79
252 0.78
253 0.76
254 0.79
255 0.77
256 0.77
257 0.81
258 0.82
259 0.83
260 0.85
261 0.83
262 0.81
263 0.83
264 0.82
265 0.78
266 0.78
267 0.7
268 0.65
269 0.65
270 0.62
271 0.58
272 0.55
273 0.55
274 0.55
275 0.58
276 0.56
277 0.53
278 0.5
279 0.45
280 0.45
281 0.42
282 0.39
283 0.4
284 0.39
285 0.35
286 0.33
287 0.33
288 0.29
289 0.3
290 0.34
291 0.31
292 0.35
293 0.38
294 0.39
295 0.41
296 0.47
297 0.43
298 0.35
299 0.37
300 0.38
301 0.43
302 0.45
303 0.43
304 0.4
305 0.43
306 0.43
307 0.41
308 0.4
309 0.41
310 0.44
311 0.5
312 0.52
313 0.52
314 0.52
315 0.52
316 0.52
317 0.5
318 0.48
319 0.45
320 0.39
321 0.4
322 0.46
323 0.48
324 0.45
325 0.43
326 0.43
327 0.49
328 0.56
329 0.59
330 0.62
331 0.68
332 0.75
333 0.76
334 0.72
335 0.66