Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X3X2

Protein Details
Accession A0A2C5X3X2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-277SENSRSRSRESRRRSYSRSRSKSQSRSRSRSYSRSYSRSRSRSRSRSHSHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-152RKLKRKGR
233-272RSRESRRRSYSRSRSKSQSRSRSRSYSRSYSRSRSRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 15.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDTIYADERRFLDERGSHGPLAPNGLNPATIMEKAVRDRIIDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEFVQFIGGTYGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDAILSEYLELGGEHFKYLRALACFYIRLTRPAKECYLLLEPFLEDRRKLKRKGRAGTTLTYVDEFVDHLLVKERVCGTSLWKMPKRDVLEDMDILEPRSTSDVEAMLEEEEEEEEGKNDEDADGMNSDSENSRSRSRESRRRSYSRSRSKSQSRSRSRSYSRSYSRSRSRSRSRSHSHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.33
4 0.33
5 0.37
6 0.4
7 0.35
8 0.36
9 0.39
10 0.32
11 0.35
12 0.3
13 0.25
14 0.24
15 0.24
16 0.21
17 0.17
18 0.19
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.17
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.21
75 0.24
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.1
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.17
111 0.15
112 0.19
113 0.2
114 0.23
115 0.24
116 0.27
117 0.27
118 0.24
119 0.23
120 0.22
121 0.24
122 0.2
123 0.18
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.14
129 0.1
130 0.14
131 0.24
132 0.3
133 0.37
134 0.43
135 0.5
136 0.58
137 0.65
138 0.68
139 0.67
140 0.64
141 0.6
142 0.55
143 0.48
144 0.38
145 0.31
146 0.24
147 0.15
148 0.12
149 0.1
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.08
155 0.1
156 0.09
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.21
164 0.25
165 0.31
166 0.36
167 0.38
168 0.39
169 0.45
170 0.45
171 0.41
172 0.39
173 0.36
174 0.33
175 0.32
176 0.31
177 0.26
178 0.22
179 0.2
180 0.17
181 0.12
182 0.09
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.12
215 0.14
216 0.17
217 0.22
218 0.25
219 0.3
220 0.39
221 0.48
222 0.56
223 0.61
224 0.69
225 0.73
226 0.8
227 0.83
228 0.85
229 0.86
230 0.87
231 0.86
232 0.82
233 0.82
234 0.84
235 0.86
236 0.86
237 0.86
238 0.85
239 0.85
240 0.86
241 0.86
242 0.84
243 0.83
244 0.8
245 0.8
246 0.78
247 0.79
248 0.79
249 0.78
250 0.81
251 0.81
252 0.83
253 0.82
254 0.84
255 0.85
256 0.87
257 0.87