Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XJK4

Protein Details
Accession A0A2C5XJK4    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-139PPPVVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
306-325VTPAKTKKPVATGRKRKSATHydrophilic
344-380LAAGAPTPDKKRRRTSGKPNEDKEEPKKAGRKKNVKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-129KKERKKRTH
313-321KPVATGRKR
352-380DKKRRRTSGKPNEDKEEPKKAGRKKNVKA
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.333, cyto 7, cyto_nucl 6.333, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPSKASKEKAAAVIGVSTSNTLTMPPNVIPTSTGGARPPVIDVDNFIRVRDSVYGRLTTIQQLIKSFSDDYLRQTNLLLGLSTPEDGSEDALANLEASMSALSGVSTLMLPPPPVVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIANDLGPEAPKRAVQEEGQRRWASMVPSEKGMWNQAYQYNLRLYNARVHSYKHGNPDAKDMDDDEANKYANNNNIQIPNAEVVEQNAMAEQLQAAAAASSGMDAQGEDDGDLAAAAAMGGVIAPGHTHAAHGHPHAHVHGHPGHTGIPSAAAGVVTPAKTKKPVATGRKRKSATDGDEMAAAMSLAMADSPVLAAGAPTPDKKRRRTSGKPNEDKEEPKKAGRKKNVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.27
4 0.22
5 0.16
6 0.13
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.11
12 0.12
13 0.15
14 0.15
15 0.2
16 0.2
17 0.21
18 0.2
19 0.2
20 0.23
21 0.21
22 0.22
23 0.19
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.2
33 0.28
34 0.27
35 0.26
36 0.24
37 0.23
38 0.25
39 0.27
40 0.26
41 0.23
42 0.27
43 0.28
44 0.27
45 0.3
46 0.29
47 0.27
48 0.28
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.27
53 0.25
54 0.26
55 0.24
56 0.2
57 0.23
58 0.22
59 0.25
60 0.28
61 0.28
62 0.26
63 0.25
64 0.25
65 0.21
66 0.21
67 0.16
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.11
104 0.13
105 0.17
106 0.27
107 0.37
108 0.48
109 0.57
110 0.62
111 0.68
112 0.75
113 0.8
114 0.81
115 0.83
116 0.82
117 0.84
118 0.89
119 0.91
120 0.86
121 0.77
122 0.68
123 0.64
124 0.57
125 0.51
126 0.43
127 0.34
128 0.33
129 0.33
130 0.32
131 0.26
132 0.25
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.15
153 0.24
154 0.32
155 0.35
156 0.4
157 0.39
158 0.38
159 0.37
160 0.37
161 0.28
162 0.23
163 0.25
164 0.19
165 0.21
166 0.22
167 0.21
168 0.19
169 0.2
170 0.16
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.21
186 0.22
187 0.27
188 0.32
189 0.34
190 0.34
191 0.38
192 0.38
193 0.38
194 0.42
195 0.39
196 0.33
197 0.3
198 0.24
199 0.19
200 0.17
201 0.17
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.2
215 0.19
216 0.15
217 0.13
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.09
268 0.13
269 0.14
270 0.17
271 0.16
272 0.18
273 0.18
274 0.2
275 0.18
276 0.21
277 0.23
278 0.22
279 0.22
280 0.21
281 0.22
282 0.2
283 0.2
284 0.14
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.08
294 0.11
295 0.13
296 0.15
297 0.19
298 0.22
299 0.25
300 0.32
301 0.42
302 0.5
303 0.6
304 0.69
305 0.74
306 0.81
307 0.79
308 0.72
309 0.71
310 0.69
311 0.64
312 0.61
313 0.54
314 0.45
315 0.43
316 0.41
317 0.33
318 0.23
319 0.16
320 0.08
321 0.05
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.05
334 0.09
335 0.11
336 0.16
337 0.23
338 0.33
339 0.41
340 0.5
341 0.59
342 0.66
343 0.74
344 0.81
345 0.85
346 0.87
347 0.91
348 0.92
349 0.88
350 0.85
351 0.82
352 0.8
353 0.76
354 0.75
355 0.69
356 0.67
357 0.7
358 0.72
359 0.76
360 0.78