Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MSB6

Protein Details
Accession B8MSB6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
515-536IQERRETRIREREEKRRQEELEBasic
544-578REAQKEVKRAKERPAKQVNTKKRRYSKVIESNEEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-454KKRQKRG
519-568RETRIREREEKRRQEELEKEQLRVAREAQKEVKRAKERPAKQVNTKKRRY
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MVNEADILKAISDLESQKTPQYAKTARKYNLEPSTLRRRYKGQTVSNQEATSIHRKLLTDAQEEVLLHHISKLSSRGLPPTPQILRNLVVELLQHDVGECWIRRFCHRYHDRIDSVYLKAIDHSRKVADNSVHFEHFYNTLTEKVKKYRISPSNTYNFDEKGFNIGLCRTEKRIVSKSQLRSKKLLGAIQDGSIEFITLIACICANGIAIPPALIYQGESGDLQDTWLKDFDGSREKAYFATSEKGWTNEELRFLWLTKIFDPYTKTKAGNLKRLLLTDGHSGHVNLRFIEYCDQNNIILGILPLHSIHQLQPLDIGIFPPLAGAYSHEIDRLTQLSSGFSRITKASFWRLFYAVWKLTLTLQNIRSAFAALGIHPFNPPKVLNILKKKIPSPISSDIENKRKTPGSEKSDLSEATQLALKALQKYAVQNEILEHQQQGLVDALIGEKKRQKRGRPLGLIDKDNPGEAQFFSPGRIEAARQQIQNIELQKEQGKIEAANRRTQKAFARQQKAQEIQERRETRIREREEKRRQEELEKEQLRVAREAQKEVKRAKERPAKQVNTKKRRYSKVIESNEEVSSKRPKTGISRSGRAINLPIRFRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.21
4 0.25
5 0.29
6 0.3
7 0.3
8 0.37
9 0.41
10 0.48
11 0.56
12 0.62
13 0.63
14 0.69
15 0.7
16 0.7
17 0.71
18 0.66
19 0.6
20 0.58
21 0.64
22 0.65
23 0.64
24 0.59
25 0.57
26 0.59
27 0.66
28 0.68
29 0.66
30 0.68
31 0.73
32 0.77
33 0.75
34 0.68
35 0.58
36 0.5
37 0.46
38 0.44
39 0.36
40 0.3
41 0.28
42 0.28
43 0.31
44 0.37
45 0.38
46 0.33
47 0.33
48 0.33
49 0.32
50 0.32
51 0.29
52 0.25
53 0.19
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.22
62 0.23
63 0.28
64 0.31
65 0.34
66 0.35
67 0.41
68 0.41
69 0.4
70 0.42
71 0.4
72 0.38
73 0.35
74 0.33
75 0.25
76 0.21
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.19
89 0.21
90 0.27
91 0.32
92 0.33
93 0.38
94 0.45
95 0.5
96 0.54
97 0.61
98 0.58
99 0.55
100 0.58
101 0.5
102 0.44
103 0.4
104 0.34
105 0.25
106 0.24
107 0.29
108 0.28
109 0.27
110 0.29
111 0.27
112 0.29
113 0.31
114 0.35
115 0.33
116 0.33
117 0.36
118 0.37
119 0.36
120 0.33
121 0.32
122 0.27
123 0.24
124 0.21
125 0.18
126 0.15
127 0.19
128 0.22
129 0.26
130 0.29
131 0.34
132 0.4
133 0.42
134 0.45
135 0.51
136 0.55
137 0.59
138 0.61
139 0.62
140 0.64
141 0.64
142 0.62
143 0.54
144 0.47
145 0.41
146 0.35
147 0.27
148 0.23
149 0.2
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.21
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.33
160 0.38
161 0.39
162 0.45
163 0.51
164 0.56
165 0.62
166 0.67
167 0.64
168 0.62
169 0.6
170 0.58
171 0.53
172 0.47
173 0.39
174 0.36
175 0.33
176 0.3
177 0.28
178 0.21
179 0.18
180 0.15
181 0.12
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.13
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.22
224 0.22
225 0.22
226 0.2
227 0.14
228 0.15
229 0.13
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.16
237 0.18
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.18
247 0.17
248 0.18
249 0.22
250 0.23
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.27
255 0.35
256 0.38
257 0.44
258 0.42
259 0.43
260 0.41
261 0.41
262 0.38
263 0.3
264 0.26
265 0.22
266 0.2
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.18
272 0.16
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.14
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.26
340 0.29
341 0.21
342 0.2
343 0.18
344 0.16
345 0.18
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.26
351 0.26
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.17
356 0.13
357 0.12
358 0.08
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.16
369 0.22
370 0.29
371 0.37
372 0.42
373 0.44
374 0.47
375 0.47
376 0.49
377 0.47
378 0.41
379 0.4
380 0.43
381 0.41
382 0.41
383 0.46
384 0.46
385 0.5
386 0.5
387 0.44
388 0.4
389 0.41
390 0.4
391 0.42
392 0.44
393 0.43
394 0.47
395 0.47
396 0.45
397 0.45
398 0.43
399 0.36
400 0.29
401 0.22
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.13
410 0.15
411 0.14
412 0.17
413 0.2
414 0.21
415 0.2
416 0.18
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.18
421 0.15
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.18
435 0.25
436 0.35
437 0.43
438 0.51
439 0.59
440 0.7
441 0.77
442 0.79
443 0.79
444 0.8
445 0.78
446 0.73
447 0.64
448 0.58
449 0.48
450 0.4
451 0.34
452 0.24
453 0.19
454 0.16
455 0.16
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.27
466 0.31
467 0.3
468 0.31
469 0.31
470 0.32
471 0.35
472 0.32
473 0.26
474 0.22
475 0.24
476 0.27
477 0.27
478 0.26
479 0.23
480 0.22
481 0.2
482 0.27
483 0.33
484 0.32
485 0.38
486 0.42
487 0.44
488 0.44
489 0.46
490 0.47
491 0.48
492 0.56
493 0.58
494 0.63
495 0.63
496 0.69
497 0.74
498 0.72
499 0.68
500 0.67
501 0.63
502 0.61
503 0.66
504 0.62
505 0.58
506 0.59
507 0.57
508 0.57
509 0.6
510 0.63
511 0.63
512 0.69
513 0.75
514 0.79
515 0.85
516 0.83
517 0.81
518 0.77
519 0.76
520 0.76
521 0.73
522 0.73
523 0.65
524 0.59
525 0.54
526 0.53
527 0.47
528 0.4
529 0.37
530 0.35
531 0.36
532 0.42
533 0.48
534 0.52
535 0.57
536 0.6
537 0.65
538 0.66
539 0.67
540 0.7
541 0.72
542 0.72
543 0.76
544 0.8
545 0.78
546 0.8
547 0.86
548 0.87
549 0.87
550 0.89
551 0.89
552 0.88
553 0.89
554 0.87
555 0.85
556 0.85
557 0.85
558 0.84
559 0.8
560 0.75
561 0.69
562 0.63
563 0.56
564 0.45
565 0.39
566 0.4
567 0.35
568 0.35
569 0.33
570 0.35
571 0.43
572 0.53
573 0.58
574 0.57
575 0.62
576 0.63
577 0.68
578 0.64
579 0.57
580 0.54
581 0.51
582 0.5