Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5WTN9

Protein Details
Accession A0A2C5WTN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70VAPMARKLLKQRARVKRMSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-110SRSRSRRSASPIKPVSP
209-232PRAKTPGSTRRKSAGPGTAKRKSA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MADTDVDYLQPDFDPRSVTMPRLRSIMVTHNIQYPSTAKKQDLVNLFNQEVAPMARKLLKQRARVKRMSSGIINAGDILDPEDDEDNIVPRPPSRSRSRRSASPIKPVSPRKSSSRLHTESVEPEYVAEPASTRTVRTTRRSASRGLSMDPEPIHATPSARRSRASMTPQVIVQEPTQPDDDDIPDMLSEAENEESVFTDDNPFQRSPPRAKTPGSTRRKSAGPGTAKRKSAGASSERGSPMGVTLSSIMAQQQQQQSLLPKARSPSAELGRIPSPAPSTQRNLSPSPVPRRSPSPGPFPEYQHDIDAGEEFTPEALQQLEADIAASGQSATASYKATDPSRKFDFATPLWVLLFTIFAAYGVWYRQEKIAVGYCGLGREPTQIIPVDVPVPDWIVPFIEPQCEPCPSHAYCYEDFVVRCEADFIMKPHPLSLGGLIPIPPTCQPDGEKAVRVKAVADKVIEELRTRRAEHECGGILNEDGEKQGSLEIKEQALKEIISRQRRKKLAQQEFDDLWDAAIGEVKTRDEVEITETDSGDLSDTYLSSTSLARLPVTCAIKRTFVKGLERHRFGIGAVVAVLVIGLYIRGRYRNYVATSAKIPALVDHVLDRLSKQKETADEEYDDPWLFLPNLRDDVLRSVHSLSERERIWVRVIRVVEQNANVRTAQRESRSGEVGRAWEWIGPVSSDMSGNRRKSGRTSYGVDTATSSSSVKLETPERAQWGEGKRPIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.24
4 0.25
5 0.3
6 0.36
7 0.38
8 0.39
9 0.39
10 0.38
11 0.33
12 0.35
13 0.39
14 0.37
15 0.36
16 0.36
17 0.4
18 0.4
19 0.38
20 0.37
21 0.31
22 0.33
23 0.36
24 0.38
25 0.33
26 0.37
27 0.41
28 0.46
29 0.5
30 0.47
31 0.46
32 0.47
33 0.46
34 0.43
35 0.38
36 0.31
37 0.25
38 0.23
39 0.2
40 0.14
41 0.17
42 0.2
43 0.24
44 0.32
45 0.41
46 0.47
47 0.54
48 0.64
49 0.72
50 0.76
51 0.8
52 0.78
53 0.76
54 0.73
55 0.7
56 0.62
57 0.55
58 0.51
59 0.45
60 0.39
61 0.3
62 0.25
63 0.19
64 0.16
65 0.13
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.2
79 0.25
80 0.32
81 0.41
82 0.5
83 0.55
84 0.65
85 0.7
86 0.72
87 0.76
88 0.79
89 0.75
90 0.76
91 0.75
92 0.7
93 0.73
94 0.74
95 0.73
96 0.69
97 0.68
98 0.64
99 0.67
100 0.66
101 0.66
102 0.67
103 0.64
104 0.59
105 0.58
106 0.54
107 0.49
108 0.48
109 0.4
110 0.29
111 0.26
112 0.23
113 0.2
114 0.17
115 0.13
116 0.08
117 0.09
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.19
122 0.25
123 0.33
124 0.39
125 0.45
126 0.48
127 0.57
128 0.59
129 0.58
130 0.56
131 0.57
132 0.52
133 0.46
134 0.43
135 0.35
136 0.36
137 0.32
138 0.29
139 0.24
140 0.22
141 0.21
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.29
146 0.34
147 0.33
148 0.34
149 0.35
150 0.39
151 0.46
152 0.48
153 0.47
154 0.42
155 0.43
156 0.42
157 0.41
158 0.37
159 0.31
160 0.24
161 0.23
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.1
187 0.12
188 0.14
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.24
193 0.3
194 0.34
195 0.4
196 0.47
197 0.48
198 0.5
199 0.55
200 0.6
201 0.64
202 0.66
203 0.62
204 0.57
205 0.57
206 0.57
207 0.53
208 0.49
209 0.47
210 0.46
211 0.51
212 0.56
213 0.58
214 0.57
215 0.55
216 0.5
217 0.42
218 0.37
219 0.34
220 0.29
221 0.27
222 0.27
223 0.31
224 0.3
225 0.29
226 0.26
227 0.19
228 0.16
229 0.13
230 0.12
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.22
245 0.25
246 0.29
247 0.25
248 0.24
249 0.24
250 0.27
251 0.27
252 0.27
253 0.29
254 0.28
255 0.31
256 0.3
257 0.31
258 0.29
259 0.29
260 0.25
261 0.19
262 0.18
263 0.16
264 0.2
265 0.2
266 0.23
267 0.25
268 0.29
269 0.32
270 0.31
271 0.3
272 0.32
273 0.36
274 0.42
275 0.46
276 0.43
277 0.42
278 0.46
279 0.48
280 0.51
281 0.47
282 0.47
283 0.45
284 0.48
285 0.48
286 0.46
287 0.44
288 0.39
289 0.36
290 0.28
291 0.24
292 0.19
293 0.17
294 0.14
295 0.12
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.1
324 0.13
325 0.2
326 0.21
327 0.26
328 0.29
329 0.3
330 0.3
331 0.31
332 0.33
333 0.26
334 0.3
335 0.25
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.15
340 0.1
341 0.1
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.14
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.06
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.11
389 0.13
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.21
394 0.19
395 0.23
396 0.22
397 0.25
398 0.23
399 0.26
400 0.25
401 0.22
402 0.21
403 0.2
404 0.19
405 0.15
406 0.14
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.14
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.12
431 0.13
432 0.17
433 0.23
434 0.24
435 0.28
436 0.27
437 0.29
438 0.28
439 0.26
440 0.23
441 0.22
442 0.22
443 0.19
444 0.18
445 0.16
446 0.17
447 0.19
448 0.18
449 0.15
450 0.15
451 0.19
452 0.22
453 0.22
454 0.25
455 0.27
456 0.29
457 0.29
458 0.31
459 0.25
460 0.23
461 0.22
462 0.19
463 0.14
464 0.12
465 0.11
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.05
471 0.08
472 0.09
473 0.1
474 0.13
475 0.14
476 0.15
477 0.18
478 0.18
479 0.18
480 0.17
481 0.16
482 0.14
483 0.21
484 0.27
485 0.34
486 0.43
487 0.49
488 0.57
489 0.63
490 0.67
491 0.68
492 0.72
493 0.73
494 0.72
495 0.69
496 0.66
497 0.61
498 0.58
499 0.5
500 0.39
501 0.28
502 0.2
503 0.15
504 0.08
505 0.11
506 0.09
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.08
514 0.09
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.09
524 0.08
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.14
539 0.19
540 0.24
541 0.23
542 0.25
543 0.26
544 0.33
545 0.33
546 0.35
547 0.34
548 0.34
549 0.41
550 0.45
551 0.53
552 0.56
553 0.58
554 0.56
555 0.51
556 0.47
557 0.38
558 0.37
559 0.26
560 0.17
561 0.14
562 0.11
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.03
567 0.03
568 0.02
569 0.02
570 0.03
571 0.04
572 0.06
573 0.1
574 0.11
575 0.15
576 0.2
577 0.26
578 0.29
579 0.36
580 0.37
581 0.37
582 0.37
583 0.36
584 0.33
585 0.27
586 0.23
587 0.16
588 0.18
589 0.16
590 0.14
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.14
595 0.14
596 0.18
597 0.21
598 0.21
599 0.22
600 0.25
601 0.3
602 0.37
603 0.41
604 0.37
605 0.36
606 0.37
607 0.36
608 0.34
609 0.29
610 0.22
611 0.17
612 0.15
613 0.13
614 0.14
615 0.17
616 0.18
617 0.21
618 0.22
619 0.22
620 0.22
621 0.26
622 0.26
623 0.24
624 0.22
625 0.21
626 0.22
627 0.24
628 0.26
629 0.24
630 0.28
631 0.27
632 0.3
633 0.31
634 0.3
635 0.34
636 0.37
637 0.36
638 0.35
639 0.36
640 0.36
641 0.39
642 0.41
643 0.39
644 0.38
645 0.42
646 0.37
647 0.38
648 0.34
649 0.3
650 0.29
651 0.3
652 0.33
653 0.31
654 0.35
655 0.37
656 0.41
657 0.45
658 0.42
659 0.4
660 0.37
661 0.35
662 0.29
663 0.27
664 0.23
665 0.19
666 0.19
667 0.18
668 0.15
669 0.13
670 0.14
671 0.13
672 0.13
673 0.14
674 0.15
675 0.21
676 0.29
677 0.31
678 0.37
679 0.38
680 0.41
681 0.46
682 0.54
683 0.55
684 0.53
685 0.56
686 0.54
687 0.58
688 0.56
689 0.49
690 0.42
691 0.35
692 0.29
693 0.25
694 0.21
695 0.15
696 0.15
697 0.15
698 0.15
699 0.17
700 0.21
701 0.25
702 0.3
703 0.34
704 0.38
705 0.38
706 0.38
707 0.41
708 0.44
709 0.48