Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5WTU9

Protein Details
Accession A0A2C5WTU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-569QDSNKQQTKPRAQKKAKGPLPPRKNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
552-566KPRAQKKAKGPLPPR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR044868  Rpn13/ADRM1_Pru  
IPR038633  Rpn13/ADRM1_Pru_sf  
IPR038108  RPN13_DEUBAD_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04683  Proteasom_Rpn13  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51917  PRU  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSTEPLIVFRAGRCDIDTTVTPPRVTPKPDPGYLYLYNGEDELIHLCWRKRSSSSNDQPDLDLVMIPGDGNFLHYDSEAPSAKTNGRIYVLKFQSSSQRYLFWLQSAPEHPTIHSRLSERDRKITDIVFNLLQGEEVDVDAELAALDEDDDEEEEEEEYEDEDEDEDEEMADQTTTARGTTGGAGADATGGDIRDEGEDAREGGADGGRAATETTANVDSVVRNLLASLEGSRQLSDSPRRPEPNDKPFPFLSHLLPTSVTVPIIDSGVSEEKIDQLINLLPPTLVVATANSGTNSAEISQDPTTEMLESAKASLSLADKRDLVKRVLRSPQFAQSLGSLTMAIRDGGLPTIAEALQIDVENNGYMRGSAMPLGNATPSYVKMAAHVELNFPTDKSQFDSDDRISFSKLDQKYIAVHDDGDEYEFDEAAQHWVLCDEGDEGDEPPLPQNLDPSSKALLPSDMDSMSDTRKRKEAPTAADNELKSISNPSKVYSSTRSSRDGHRGFQRDTSYCARVGMRGYLPATCGFGNNTDSANVCSLPNHQQDSNKQQTKPRAQKKAKGPLPPRKNTAVYVTGIPNDATLDEIHDLFSRKGGVVAEEIDSGRPRIKMYTDVDGNFKGDALIVFFKPQSVEMAIMLLDDTDFRFTSAGKPEGRIRVQEADSSYKKTKYEGNQDQQGGNKDAQAPTTRKNDQDRHKIIKKTQKLELKLADWDDDQYPPDKPVIKARWEKTVILSHMFTLKELEEDPTALLDIKEDIRDECSKLGTVTNVILFDMEPEGIVSVKFKEIEAAHACVRMMHGRNFGGQVVEAGLATGKEKFKQSSKASLSDSDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.27
4 0.28
5 0.26
6 0.33
7 0.35
8 0.34
9 0.32
10 0.38
11 0.4
12 0.45
13 0.48
14 0.5
15 0.53
16 0.57
17 0.6
18 0.57
19 0.57
20 0.52
21 0.49
22 0.41
23 0.35
24 0.31
25 0.26
26 0.22
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.2
34 0.27
35 0.3
36 0.33
37 0.36
38 0.44
39 0.5
40 0.57
41 0.65
42 0.69
43 0.7
44 0.67
45 0.63
46 0.55
47 0.48
48 0.37
49 0.26
50 0.16
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.22
69 0.24
70 0.3
71 0.3
72 0.28
73 0.31
74 0.33
75 0.35
76 0.42
77 0.43
78 0.39
79 0.38
80 0.37
81 0.42
82 0.43
83 0.43
84 0.35
85 0.34
86 0.34
87 0.38
88 0.38
89 0.3
90 0.3
91 0.26
92 0.3
93 0.3
94 0.32
95 0.32
96 0.31
97 0.3
98 0.33
99 0.36
100 0.33
101 0.34
102 0.31
103 0.35
104 0.43
105 0.51
106 0.49
107 0.54
108 0.54
109 0.54
110 0.55
111 0.5
112 0.46
113 0.4
114 0.39
115 0.3
116 0.28
117 0.25
118 0.21
119 0.18
120 0.13
121 0.11
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.17
223 0.24
224 0.3
225 0.34
226 0.41
227 0.45
228 0.49
229 0.59
230 0.63
231 0.66
232 0.69
233 0.64
234 0.62
235 0.58
236 0.57
237 0.51
238 0.44
239 0.35
240 0.29
241 0.28
242 0.24
243 0.23
244 0.21
245 0.18
246 0.16
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.05
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.07
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.09
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.23
309 0.24
310 0.25
311 0.26
312 0.29
313 0.34
314 0.41
315 0.41
316 0.41
317 0.41
318 0.45
319 0.42
320 0.38
321 0.33
322 0.25
323 0.25
324 0.2
325 0.18
326 0.11
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.15
386 0.19
387 0.19
388 0.2
389 0.21
390 0.19
391 0.18
392 0.16
393 0.15
394 0.19
395 0.18
396 0.19
397 0.17
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.21
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.16
443 0.14
444 0.13
445 0.11
446 0.12
447 0.11
448 0.1
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.12
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.22
457 0.23
458 0.25
459 0.33
460 0.36
461 0.37
462 0.41
463 0.45
464 0.44
465 0.46
466 0.43
467 0.35
468 0.3
469 0.24
470 0.18
471 0.18
472 0.16
473 0.17
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.2
478 0.23
479 0.24
480 0.28
481 0.29
482 0.32
483 0.35
484 0.35
485 0.4
486 0.46
487 0.44
488 0.44
489 0.47
490 0.49
491 0.46
492 0.49
493 0.48
494 0.39
495 0.41
496 0.4
497 0.33
498 0.28
499 0.29
500 0.24
501 0.21
502 0.21
503 0.19
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.15
508 0.15
509 0.14
510 0.15
511 0.11
512 0.11
513 0.09
514 0.11
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.09
524 0.09
525 0.12
526 0.19
527 0.22
528 0.24
529 0.25
530 0.29
531 0.35
532 0.44
533 0.51
534 0.5
535 0.49
536 0.52
537 0.59
538 0.66
539 0.7
540 0.71
541 0.72
542 0.72
543 0.78
544 0.82
545 0.83
546 0.79
547 0.78
548 0.78
549 0.77
550 0.81
551 0.78
552 0.73
553 0.68
554 0.64
555 0.56
556 0.51
557 0.44
558 0.35
559 0.32
560 0.29
561 0.24
562 0.22
563 0.2
564 0.15
565 0.12
566 0.1
567 0.08
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.12
575 0.11
576 0.12
577 0.11
578 0.1
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.12
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.14
594 0.15
595 0.21
596 0.23
597 0.3
598 0.31
599 0.32
600 0.34
601 0.33
602 0.32
603 0.25
604 0.22
605 0.14
606 0.11
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.09
623 0.08
624 0.06
625 0.05
626 0.04
627 0.05
628 0.06
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.13
634 0.19
635 0.24
636 0.24
637 0.27
638 0.32
639 0.4
640 0.42
641 0.39
642 0.37
643 0.38
644 0.38
645 0.38
646 0.36
647 0.36
648 0.36
649 0.4
650 0.4
651 0.37
652 0.36
653 0.35
654 0.39
655 0.4
656 0.49
657 0.53
658 0.57
659 0.62
660 0.63
661 0.63
662 0.6
663 0.56
664 0.48
665 0.38
666 0.32
667 0.28
668 0.27
669 0.28
670 0.3
671 0.29
672 0.32
673 0.4
674 0.41
675 0.44
676 0.53
677 0.59
678 0.62
679 0.69
680 0.72
681 0.73
682 0.78
683 0.79
684 0.78
685 0.8
686 0.79
687 0.74
688 0.74
689 0.73
690 0.7
691 0.7
692 0.67
693 0.59
694 0.54
695 0.5
696 0.43
697 0.35
698 0.33
699 0.26
700 0.22
701 0.21
702 0.18
703 0.18
704 0.17
705 0.2
706 0.22
707 0.22
708 0.31
709 0.37
710 0.44
711 0.53
712 0.54
713 0.6
714 0.59
715 0.59
716 0.54
717 0.55
718 0.49
719 0.43
720 0.41
721 0.33
722 0.34
723 0.32
724 0.27
725 0.21
726 0.19
727 0.16
728 0.16
729 0.18
730 0.14
731 0.15
732 0.15
733 0.13
734 0.13
735 0.12
736 0.11
737 0.09
738 0.1
739 0.11
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.18
744 0.21
745 0.22
746 0.22
747 0.22
748 0.21
749 0.21
750 0.23
751 0.19
752 0.19
753 0.19
754 0.19
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.13
759 0.13
760 0.12
761 0.1
762 0.08
763 0.07
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.09
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.17
773 0.18
774 0.25
775 0.28
776 0.3
777 0.29
778 0.3
779 0.3
780 0.25
781 0.28
782 0.28
783 0.29
784 0.3
785 0.34
786 0.34
787 0.37
788 0.38
789 0.36
790 0.29
791 0.24
792 0.2
793 0.15
794 0.14
795 0.11
796 0.09
797 0.09
798 0.08
799 0.09
800 0.13
801 0.14
802 0.17
803 0.23
804 0.28
805 0.34
806 0.44
807 0.48
808 0.54
809 0.57
810 0.61
811 0.6
812 0.6