FuNGI

A0A2C5WYA2

Protein Details

Accession

A0A2C5WYA2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-47	LEEKERRRLADKKARQAKKYRDELKLARTK	Basic
376-398	SNIVCRHCKKKGHREAKCWGRNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-51	KERRRLADKKARQAKKYRDELKLARTKAKKA

Subcellular Location(s)

cyto 11, nucl 9, pero 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MLSKIQVEAYLEQYVDALEEKERRRLADKKARQAKKYRDELKLARTKAKKALERMAIQHGQEHGSDSGSDVDDGVEEVPGPEGPAARLDKRRAHFTTPLSEAVTPEIPEADVFNRESADSFRQYDPLSEIRQMTRMEATSWFNGNLAGMHVRLQGKKNWKDWVVQLRSALVDFSRTHVSEVSGLNGHFDNALKKLMHRTVATDIGDKLQASHSSEEMFNMLERTYGTSATTDVMMATDELFHIRWDQSMTVDEFGIKYKSAYQAYKTNVSALTRKSVVAHLMLLVDKRSSSLTLELSDRIEGHWASQNVDELIVSFVDWLCTRCREFNPKVDSKSGDSKGKSAGKSAGQAAGGGGKGGANTGNGSGGAPKGDNKDSNIVCRHCKKKGHREAKCWGRNPELHPAKTQGQAHTADGAASAAAGGQGQRLMAASKGPLQVDNNTWFVAPAMKAAMQREVGTDVLPARTGTLPVGRVNTLMYTACVEDDDAELDTDELVQTVFQQEESLVAGDMERSVSDCGVKKVPRADGQALALKVLNHESTGHAYTVKGHSMRNEWLFDTGSTLHICNDLKWFVPGTLAPVGAKGGSITTGGGVVRFLLKGTVAVQLLRRDGTFADIRLTNVALVPQFDINIISGLDFFRKGGSIDKQGLVDRQGKHMAKLDVHERGFYLYLNGVPWPVEPTGKINTEAREVLVKMNVLQKGGDTTFVTGEHAESAGKVRLGHPHFEALKKTIEASEGGLIPAKKLVDPDDPCISCELSKAKTFKPKDRRTDLAQFPGQFVHADVTKVKEEGIGQQRWLVVMLDEYSGRIHAGSFSYKGDCNRCITDQLKWYRNQTGRQLKRITVDNGTDVNIQELTAFVRSVGADIRTSPTYSPAQNGRTLYGLKQAGRQWQLTLFEELRSHGYKAIQCDQASLVGNGVVAVSHVDDMLYAGPESAVDAFEKAVTGKFKTKLLGQPEWLLGMDVLCTRGEAGEAGNRDLEVIVSQKTYLQSILEKEGMLNANAVLTPIEKKLTLGVEGTDKVLDEDGKLQYGKRMGKLNYLATMTRPDLSFAISQHSKYLQAPCEKHMQTSKRMLRYLVDKGDYGLRYRRPEGWAKGQPVPIIAYADASLQDEEVNGHSSWGFVVLMAGAPVSWASRRHKTAIPSTAESEYVAAYATGQHLRWIANFVHEAGFDSQIQLYG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.13
3	0.12
4	0.1
5	0.12
6	0.2
7	0.23
8	0.31
9	0.33
10	0.36
11	0.42
12	0.49
13	0.55
14	0.59
15	0.66
16	0.69
17	0.78
18	0.83
19	0.85
20	0.87
21	0.87
22	0.86
23	0.87
24	0.85
25	0.82
26	0.83
27	0.81
28	0.81
29	0.79
30	0.74
31	0.73
32	0.69
33	0.68
34	0.68
35	0.7
36	0.67
37	0.66
38	0.7
39	0.69
40	0.69
41	0.67
42	0.67
43	0.62
44	0.54
45	0.51
46	0.43
47	0.36
48	0.31
49	0.3
50	0.22
51	0.19
52	0.18
53	0.15
54	0.16
55	0.15
56	0.15
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.09
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.15
72	0.2
73	0.25
74	0.33
75	0.39
76	0.47
77	0.5
78	0.59
79	0.58
80	0.6
81	0.61
82	0.58
83	0.59
84	0.54
85	0.52
86	0.46
87	0.42
88	0.36
89	0.32
90	0.29
91	0.22
92	0.19
93	0.17
94	0.14
95	0.13
96	0.15
97	0.13
98	0.14
99	0.15
100	0.15
101	0.15
102	0.15
103	0.16
104	0.18
105	0.22
106	0.23
107	0.26
108	0.26
109	0.29
110	0.29
111	0.3
112	0.3
113	0.3
114	0.29
115	0.29
116	0.31
117	0.3
118	0.34
119	0.33
120	0.31
121	0.29
122	0.27
123	0.25
124	0.25
125	0.27
126	0.26
127	0.28
128	0.25
129	0.21
130	0.21
131	0.19
132	0.16
133	0.14
134	0.12
135	0.1
136	0.12
137	0.16
138	0.2
139	0.24
140	0.27
141	0.32
142	0.41
143	0.49
144	0.52
145	0.55
146	0.54
147	0.54
148	0.59
149	0.63
150	0.59
151	0.54
152	0.5
153	0.43
154	0.42
155	0.37
156	0.29
157	0.19
158	0.16
159	0.14
160	0.16
161	0.2
162	0.19
163	0.21
164	0.21
165	0.22
166	0.22
167	0.22
168	0.22
169	0.19
170	0.18
171	0.19
172	0.18
173	0.17
174	0.14
175	0.14
176	0.14
177	0.13
178	0.17
179	0.16
180	0.18
181	0.25
182	0.29
183	0.32
184	0.3
185	0.32
186	0.33
187	0.38
188	0.38
189	0.32
190	0.29
191	0.26
192	0.27
193	0.23
194	0.19
195	0.17
196	0.18
197	0.19
198	0.2
199	0.19
200	0.2
201	0.2
202	0.19
203	0.16
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.08
209	0.09
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.09
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.16
236	0.17
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.13
241	0.15
242	0.15
243	0.11
244	0.1
245	0.13
246	0.19
247	0.23
248	0.25
249	0.27
250	0.33
251	0.38
252	0.43
253	0.39
254	0.36
255	0.34
256	0.34
257	0.35
258	0.3
259	0.3
260	0.26
261	0.26
262	0.25
263	0.24
264	0.23
265	0.19
266	0.18
267	0.13
268	0.13
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.13
279	0.14
280	0.15
281	0.17
282	0.18
283	0.17
284	0.17
285	0.16
286	0.13
287	0.14
288	0.12
289	0.13
290	0.18
291	0.17
292	0.18
293	0.19
294	0.2
295	0.17
296	0.18
297	0.15
298	0.1
299	0.1
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.13
309	0.15
310	0.19
311	0.25
312	0.33
313	0.38
314	0.45
315	0.52
316	0.55
317	0.57
318	0.56
319	0.53
320	0.48
321	0.53
322	0.49
323	0.46
324	0.41
325	0.39
326	0.43
327	0.46
328	0.42
329	0.36
330	0.35
331	0.31
332	0.33
333	0.32
334	0.27
335	0.21
336	0.2
337	0.18
338	0.15
339	0.13
340	0.1
341	0.08
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.13
358	0.16
359	0.18
360	0.19
361	0.27
362	0.27
363	0.33
364	0.36
365	0.35
366	0.39
367	0.46
368	0.5
369	0.49
370	0.58
371	0.62
372	0.67
373	0.75
374	0.79
375	0.79
376	0.81
377	0.84
378	0.86
379	0.84
380	0.78
381	0.72
382	0.67
383	0.64
384	0.6
385	0.61
386	0.57
387	0.5
388	0.46
389	0.46
390	0.43
391	0.44
392	0.43
393	0.34
394	0.3
395	0.3
396	0.29
397	0.25
398	0.22
399	0.16
400	0.13
401	0.11
402	0.07
403	0.05
404	0.04
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.1
419	0.12
420	0.13
421	0.14
422	0.15
423	0.17
424	0.2
425	0.22
426	0.19
427	0.18
428	0.17
429	0.16
430	0.14
431	0.14
432	0.1
433	0.08
434	0.08
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.14
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.04
496	0.05
497	0.04
498	0.03
499	0.04
500	0.05
501	0.05
502	0.08
503	0.09
504	0.11
505	0.16
506	0.17
507	0.19
508	0.23
509	0.27
510	0.29
511	0.32
512	0.32
513	0.28
514	0.29
515	0.31
516	0.27
517	0.23
518	0.19
519	0.15
520	0.13
521	0.13
522	0.11
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.17
538	0.21
539	0.21
540	0.21
541	0.18
542	0.18
543	0.18
544	0.16
545	0.15
546	0.12
547	0.11
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.11
558	0.11
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.09
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.07
569	0.07
570	0.04
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.11
592	0.12
593	0.13
594	0.13
595	0.12
596	0.1
597	0.1
598	0.12
599	0.11
600	0.1
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.12
605	0.12
606	0.08
607	0.07
608	0.08
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.05
617	0.06
618	0.05
619	0.04
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.1
629	0.12
630	0.16
631	0.18
632	0.19
633	0.2
634	0.21
635	0.21
636	0.21
637	0.24
638	0.2
639	0.21
640	0.28
641	0.27
642	0.28
643	0.32
644	0.3
645	0.25
646	0.26
647	0.27
648	0.26
649	0.26
650	0.25
651	0.2
652	0.19
653	0.18
654	0.16
655	0.13
656	0.07
657	0.07
658	0.08
659	0.07
660	0.07
661	0.06
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.11
668	0.15
669	0.16
670	0.17
671	0.17
672	0.18
673	0.2
674	0.2
675	0.17
676	0.15
677	0.15
678	0.14
679	0.13
680	0.12
681	0.11
682	0.16
683	0.16
684	0.14
685	0.14
686	0.13
687	0.14
688	0.14
689	0.14
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.1
694	0.11
695	0.08
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.06
700	0.05
701	0.07
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.1
706	0.18
707	0.2
708	0.22
709	0.21
710	0.25
711	0.26
712	0.28
713	0.29
714	0.23
715	0.23
716	0.21
717	0.21
718	0.16
719	0.15
720	0.13
721	0.12
722	0.12
723	0.1
724	0.1
725	0.12
726	0.11
727	0.1
728	0.11
729	0.1
730	0.09
731	0.09
732	0.13
733	0.18
734	0.21
735	0.25
736	0.3
737	0.3
738	0.3
739	0.3
740	0.28
741	0.2
742	0.2
743	0.19
744	0.15
745	0.2
746	0.23
747	0.26
748	0.35
749	0.4
750	0.48
751	0.56
752	0.62
753	0.67
754	0.71
755	0.71
756	0.69
757	0.74
758	0.68
759	0.65
760	0.59
761	0.5
762	0.44
763	0.39
764	0.32
765	0.23
766	0.18
767	0.13
768	0.1
769	0.1
770	0.1
771	0.13
772	0.13
773	0.13
774	0.13
775	0.12
776	0.12
777	0.19
778	0.26
779	0.24
780	0.24
781	0.25
782	0.26
783	0.24
784	0.24
785	0.16
786	0.08
787	0.08
788	0.09
789	0.08
790	0.07
791	0.08
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.06
796	0.05
797	0.06
798	0.08
799	0.09
800	0.11
801	0.12
802	0.14
803	0.16
804	0.2
805	0.23
806	0.24
807	0.26
808	0.28
809	0.28
810	0.31
811	0.31
812	0.32
813	0.36
814	0.42
815	0.44
816	0.44
817	0.47
818	0.5
819	0.53
820	0.53
821	0.55
822	0.58
823	0.58
824	0.64
825	0.64
826	0.57
827	0.56
828	0.56
829	0.5
830	0.43
831	0.38
832	0.32
833	0.3
834	0.29
835	0.26
836	0.2
837	0.18
838	0.13
839	0.12
840	0.09
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.07
845	0.06
846	0.07
847	0.07
848	0.08
849	0.09
850	0.09
851	0.09
852	0.1
853	0.14
854	0.14
855	0.15
856	0.14
857	0.17
858	0.19
859	0.19
860	0.23
861	0.25
862	0.27
863	0.31
864	0.31
865	0.29
866	0.28
867	0.28
868	0.25
869	0.26
870	0.27
871	0.23
872	0.28
873	0.3
874	0.35
875	0.37
876	0.37
877	0.31
878	0.31
879	0.34
880	0.31
881	0.32
882	0.25
883	0.24
884	0.23
885	0.23
886	0.24
887	0.22
888	0.21
889	0.18
890	0.22
891	0.23
892	0.28
893	0.33
894	0.34
895	0.32
896	0.33
897	0.31
898	0.3
899	0.29
900	0.24
901	0.17
902	0.12
903	0.12
904	0.1
905	0.1
906	0.05
907	0.04
908	0.04
909	0.04
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.05
915	0.06
916	0.06
917	0.05
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.06
922	0.06
923	0.06
924	0.05
925	0.06
926	0.06
927	0.06
928	0.07
929	0.07
930	0.1
931	0.12
932	0.15
933	0.21
934	0.23
935	0.25
936	0.27
937	0.33
938	0.36
939	0.41
940	0.43
941	0.39
942	0.4
943	0.38
944	0.37
945	0.32
946	0.25
947	0.18
948	0.13
949	0.11
950	0.08
951	0.09
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.07
956	0.07
957	0.06
958	0.07
959	0.11
960	0.12
961	0.13
962	0.14
963	0.13
964	0.13
965	0.13
966	0.12
967	0.08
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.1
972	0.12
973	0.13
974	0.14
975	0.13
976	0.13
977	0.15
978	0.18
979	0.22
980	0.21
981	0.2
982	0.19
983	0.23
984	0.22
985	0.19
986	0.16
987	0.12
988	0.11
989	0.11
990	0.12
991	0.07
992	0.07
993	0.09
994	0.1
995	0.12
996	0.11
997	0.12
998	0.15
999	0.17
1000	0.17
1001	0.16
1002	0.16
1003	0.18
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.16
1007	0.14
1008	0.13
1009	0.14
1010	0.13
1011	0.1
1012	0.14
1013	0.14
1014	0.17
1015	0.17
1016	0.17
1017	0.2
1018	0.27
1019	0.3
1020	0.31
1021	0.38
1022	0.36
1023	0.44
1024	0.49
1025	0.48
1026	0.45
1027	0.43
1028	0.39
1029	0.33
1030	0.36
1031	0.29
1032	0.27
1033	0.24
1034	0.21
1035	0.19
1036	0.21
1037	0.22
1038	0.17
1039	0.24
1040	0.24
1041	0.24
1042	0.26
1043	0.27
1044	0.26
1045	0.28
1046	0.35
1047	0.34
1048	0.41
1049	0.43
1050	0.43
1051	0.51
1052	0.49
1053	0.51
1054	0.53
1055	0.52
1056	0.51
1057	0.59
1058	0.64
1059	0.62
1060	0.63
1061	0.59
1062	0.55
1063	0.56
1064	0.56
1065	0.52
1066	0.46
1067	0.39
1068	0.39
1069	0.44
1070	0.4
1071	0.37
1072	0.36
1073	0.36
1074	0.4
1075	0.43
1076	0.47
1077	0.46
1078	0.54
1079	0.57
1080	0.6
1081	0.62
1082	0.61
1083	0.64
1084	0.62
1085	0.57
1086	0.49
1087	0.44
1088	0.35
1089	0.29
1090	0.23
1091	0.18
1092	0.15
1093	0.15
1094	0.14
1095	0.13
1096	0.12
1097	0.1
1098	0.1
1099	0.09
1100	0.1
1101	0.1
1102	0.13
1103	0.11
1104	0.12
1105	0.12
1106	0.12
1107	0.12
1108	0.12
1109	0.1
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.06
1113	0.07
1114	0.07
1115	0.06
1116	0.04
1117	0.05
1118	0.05
1119	0.07
1120	0.09
1121	0.15
1122	0.22
1123	0.31
1124	0.36
1125	0.41
1126	0.46
1127	0.52
1128	0.59
1129	0.62
1130	0.62
1131	0.57
1132	0.57
1133	0.53
1134	0.48
1135	0.41
1136	0.32
1137	0.24
1138	0.17
1139	0.13
1140	0.09
1141	0.07
1142	0.08
1143	0.12
1144	0.14
1145	0.14
1146	0.16
1147	0.18
1148	0.2
1149	0.21
1150	0.23
1151	0.21
1152	0.23
1153	0.24
1154	0.23
1155	0.23
1156	0.22
1157	0.24
1158	0.23
1159	0.24
1160	0.19
1161	0.19

A0A2C5WYA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer