Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XM02

Protein Details
Accession A0A2C5XM02    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-120VEPVPKSASKNKGKKKKADIHVPQARKVHydrophilic
525-546AETVRTRVTKWRRVQDDRDDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-110SASKNKGKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSIHQLSRLLPLPDDELKQVLSYAETLSKEASVEHFQNLLGNSPEVSAFISSFNSRRKTPGPSGSSSGSTARPQPSQSNAQLRAGGPANVLNVEPVPKSASKNKGKKKKADIHVPQARKVDSVGPAPGTAYNKKNQTFEYISSSKKPAFGGLGESASATSASSGIAPDVLSFMEAISGPSSKGGSSSSTRTPTPAPKTEKPQKQSSKVGGYLIGDGPPKKAKSTLAKPTPIVSTKVKITGGLPMGGASAAVSDLDAAIRALEISTNPTLNPSTKARKCNCVATRHPLQSAAPNCMKCGKVICIKEGLGPCSYCGTPLLQPSEIQAILKELTAERGRERMAVDREAHKRTELKAMPSSYAQARGGIMSDSLLLARQHRDRLLNFQSENAQRTRIVDEAADFDVGLAQGHLGGAMWSSPLGRAMELKRQQKLLRELEWDAKPEYEKRRQVVNIDLVGGKVVKKMAAVERPATPESDDDDVDDEYGVLDAIGGSGGDSSAASTGKFSRNPLMGGLIRPVFTPGKGKEAETVRTRVTKWRRVQDDRDDNEAVILDGGIYGHAEENREEPAVCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.18
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.24
25 0.24
26 0.23
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.1
37 0.12
38 0.15
39 0.2
40 0.27
41 0.3
42 0.31
43 0.37
44 0.4
45 0.46
46 0.52
47 0.56
48 0.55
49 0.56
50 0.59
51 0.56
52 0.53
53 0.47
54 0.41
55 0.34
56 0.3
57 0.32
58 0.32
59 0.32
60 0.33
61 0.36
62 0.39
63 0.44
64 0.49
65 0.52
66 0.51
67 0.51
68 0.51
69 0.46
70 0.45
71 0.38
72 0.31
73 0.23
74 0.21
75 0.19
76 0.16
77 0.16
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.14
84 0.15
85 0.2
86 0.27
87 0.37
88 0.45
89 0.55
90 0.65
91 0.72
92 0.79
93 0.84
94 0.87
95 0.87
96 0.86
97 0.87
98 0.85
99 0.86
100 0.86
101 0.8
102 0.75
103 0.69
104 0.61
105 0.5
106 0.42
107 0.36
108 0.3
109 0.29
110 0.25
111 0.21
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.29
119 0.35
120 0.38
121 0.4
122 0.38
123 0.41
124 0.4
125 0.39
126 0.41
127 0.38
128 0.37
129 0.38
130 0.41
131 0.35
132 0.33
133 0.3
134 0.24
135 0.22
136 0.2
137 0.21
138 0.19
139 0.19
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.07
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.13
173 0.17
174 0.21
175 0.24
176 0.24
177 0.26
178 0.29
179 0.34
180 0.38
181 0.42
182 0.45
183 0.48
184 0.57
185 0.65
186 0.7
187 0.67
188 0.7
189 0.7
190 0.69
191 0.71
192 0.67
193 0.63
194 0.56
195 0.52
196 0.43
197 0.35
198 0.3
199 0.23
200 0.19
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.22
209 0.3
210 0.38
211 0.46
212 0.48
213 0.51
214 0.51
215 0.51
216 0.49
217 0.42
218 0.37
219 0.3
220 0.25
221 0.24
222 0.26
223 0.24
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.14
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.03
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.16
259 0.25
260 0.3
261 0.39
262 0.4
263 0.46
264 0.47
265 0.54
266 0.54
267 0.52
268 0.51
269 0.49
270 0.54
271 0.49
272 0.47
273 0.38
274 0.33
275 0.32
276 0.3
277 0.28
278 0.25
279 0.23
280 0.24
281 0.26
282 0.25
283 0.19
284 0.2
285 0.19
286 0.22
287 0.23
288 0.24
289 0.23
290 0.24
291 0.27
292 0.26
293 0.23
294 0.18
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.14
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.14
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.06
317 0.1
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.17
325 0.2
326 0.21
327 0.24
328 0.26
329 0.31
330 0.36
331 0.37
332 0.37
333 0.32
334 0.32
335 0.3
336 0.37
337 0.32
338 0.31
339 0.34
340 0.35
341 0.34
342 0.32
343 0.32
344 0.24
345 0.25
346 0.2
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.13
351 0.11
352 0.09
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.08
360 0.12
361 0.15
362 0.18
363 0.21
364 0.25
365 0.25
366 0.33
367 0.37
368 0.38
369 0.35
370 0.34
371 0.38
372 0.37
373 0.39
374 0.32
375 0.28
376 0.23
377 0.24
378 0.25
379 0.19
380 0.17
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.13
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.07
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.12
408 0.15
409 0.25
410 0.33
411 0.39
412 0.4
413 0.45
414 0.48
415 0.51
416 0.57
417 0.53
418 0.49
419 0.48
420 0.48
421 0.5
422 0.49
423 0.44
424 0.36
425 0.31
426 0.3
427 0.32
428 0.38
429 0.4
430 0.44
431 0.44
432 0.51
433 0.52
434 0.53
435 0.54
436 0.52
437 0.44
438 0.39
439 0.37
440 0.29
441 0.27
442 0.24
443 0.16
444 0.12
445 0.11
446 0.09
447 0.09
448 0.13
449 0.19
450 0.25
451 0.28
452 0.29
453 0.32
454 0.36
455 0.37
456 0.34
457 0.28
458 0.23
459 0.23
460 0.23
461 0.2
462 0.16
463 0.17
464 0.16
465 0.15
466 0.14
467 0.1
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.04
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.13
488 0.19
489 0.21
490 0.24
491 0.29
492 0.31
493 0.32
494 0.32
495 0.34
496 0.3
497 0.29
498 0.32
499 0.27
500 0.24
501 0.24
502 0.26
503 0.22
504 0.21
505 0.27
506 0.24
507 0.29
508 0.31
509 0.32
510 0.35
511 0.39
512 0.44
513 0.42
514 0.45
515 0.42
516 0.45
517 0.46
518 0.49
519 0.54
520 0.56
521 0.6
522 0.66
523 0.72
524 0.76
525 0.83
526 0.84
527 0.85
528 0.8
529 0.77
530 0.68
531 0.58
532 0.5
533 0.41
534 0.3
535 0.19
536 0.14
537 0.08
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.08
544 0.09
545 0.11
546 0.12
547 0.14
548 0.16
549 0.18