Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XL71

Protein Details
Accession A0A2C5XL71    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-64NETRERDGRRDRDRDRDRSRNRDRDRDRDRDRDRDBasic
103-130ADGGQRDRQHKRYRSRSRSRGHSRERGSBasic
261-282AGSVSKEKKSQYRQYMNRVGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-159ERDGRRDRDRDRDRSRNRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDQDRDRDRGHDRHRSGRRGADGGQRDRQHKRYRSRSRSRGHSRERGSTRKDGERERERERDRERDSRGDKEPVRRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADHSSRRGLRRPDSSTMWDDSERHMSRHNETRERDGRRDRDRDRDRSRNRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDQDRDRDRGHDRHRSGRRGADGGQRDRQHKRYRSRSRSRGHSRERGSTRKDGERERERERDRERDSRGDKEPVRRRDDTGYRATDRRSASPATLPDVLPTRTKPERTAPMSFRMSGNTHKKHDTSGEPAAVGAGTSAVDDDDELEVDIDGGDMDAMQAMLGFGGFGTTKNKKVVGNNAGSVSKEKKSQYRQYMNRVGGFNRPLSPPRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.61
4 0.57
5 0.52
6 0.45
7 0.4
8 0.37
9 0.42
10 0.37
11 0.35
12 0.38
13 0.38
14 0.43
15 0.51
16 0.56
17 0.54
18 0.56
19 0.65
20 0.66
21 0.7
22 0.71
23 0.72
24 0.72
25 0.73
26 0.8
27 0.75
28 0.78
29 0.8
30 0.82
31 0.81
32 0.83
33 0.83
34 0.84
35 0.89
36 0.89
37 0.88
38 0.88
39 0.86
40 0.86
41 0.85
42 0.84
43 0.81
44 0.81
45 0.8
46 0.8
47 0.79
48 0.79
49 0.77
50 0.77
51 0.76
52 0.76
53 0.76
54 0.76
55 0.76
56 0.76
57 0.76
58 0.76
59 0.76
60 0.76
61 0.76
62 0.76
63 0.76
64 0.76
65 0.76
66 0.75
67 0.73
68 0.72
69 0.69
70 0.69
71 0.67
72 0.67
73 0.64
74 0.63
75 0.59
76 0.56
77 0.58
78 0.57
79 0.59
80 0.59
81 0.59
82 0.61
83 0.67
84 0.66
85 0.64
86 0.6
87 0.56
88 0.48
89 0.48
90 0.46
91 0.45
92 0.44
93 0.47
94 0.46
95 0.48
96 0.51
97 0.56
98 0.57
99 0.58
100 0.64
101 0.68
102 0.75
103 0.81
104 0.85
105 0.87
106 0.84
107 0.87
108 0.87
109 0.86
110 0.83
111 0.81
112 0.74
113 0.74
114 0.73
115 0.69
116 0.64
117 0.6
118 0.56
119 0.54
120 0.54
121 0.5
122 0.53
123 0.54
124 0.55
125 0.55
126 0.59
127 0.55
128 0.59
129 0.59
130 0.59
131 0.56
132 0.58
133 0.56
134 0.55
135 0.56
136 0.53
137 0.52
138 0.5
139 0.48
140 0.5
141 0.56
142 0.54
143 0.57
144 0.54
145 0.53
146 0.53
147 0.55
148 0.5
149 0.47
150 0.44
151 0.41
152 0.41
153 0.4
154 0.38
155 0.34
156 0.31
157 0.28
158 0.24
159 0.23
160 0.25
161 0.24
162 0.22
163 0.22
164 0.2
165 0.18
166 0.2
167 0.2
168 0.18
169 0.18
170 0.21
171 0.24
172 0.26
173 0.27
174 0.32
175 0.39
176 0.42
177 0.48
178 0.45
179 0.48
180 0.48
181 0.46
182 0.4
183 0.34
184 0.31
185 0.33
186 0.4
187 0.39
188 0.4
189 0.42
190 0.42
191 0.42
192 0.44
193 0.39
194 0.36
195 0.35
196 0.32
197 0.28
198 0.27
199 0.25
200 0.2
201 0.15
202 0.09
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.12
237 0.16
238 0.2
239 0.23
240 0.26
241 0.3
242 0.36
243 0.45
244 0.47
245 0.49
246 0.48
247 0.48
248 0.47
249 0.44
250 0.42
251 0.37
252 0.31
253 0.31
254 0.34
255 0.4
256 0.49
257 0.58
258 0.64
259 0.71
260 0.76
261 0.81
262 0.85
263 0.81
264 0.77
265 0.7
266 0.61
267 0.58
268 0.54
269 0.47
270 0.41
271 0.4