Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X9Y9

Protein Details
Accession A0A2C5X9Y9    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-117SNSRSPTPSRRGRSRSYSQSRSRSSGRSPSRSRSRSRSNSPSRSQSPDRRRRRHRSASFSQSPDSHRGRRRRLNSDSNDKSRSRGRSRSNSRTRSSYSSKSRSKSRSRSRSWSQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-112RRGRSRSYSQSRSRSSGRSPSRSRSRSRSNSPSRSQSPDRRRRRHRSASFSQSPDSHRGRRRRLNSDSNDKSRSRGRSRSNSRTRSSYSSKSRSKSRSRSRS
231-264RSGRNRKNNGGGGGRGGPPSGPRPGKGSRRGADI
266-266R
279-280RR
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSNSRSPTPSRRGRSRSYSQSRSRSSGRSPSRSRSRSRSNSPSRSQSPDRRRRRHRSASFSQSPDSHRGRRRRLNSDSNDKSRSRGRSRSNSRTRSSYSSKSRSKSRSRSRSWSQSSSRSRSRTRSPDHQGSTKIVVERLTKNVNESHLREIFSQFGNIKDLYIPKNNLGVNRGTAYILYFNEEDAEAAITHMHEAQIDSATINVSIVLKGSKFHHMPPQAQLGGPSSSARSGRNRKNNGGGGGRGGPPSGPRPGKGSRRGADIYRPGDGDKATNAAPRRAAGNSGGGGKRAGHMDWDRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.82
4 0.82
5 0.82
6 0.81
7 0.84
8 0.81
9 0.78
10 0.74
11 0.69
12 0.66
13 0.66
14 0.67
15 0.67
16 0.67
17 0.72
18 0.77
19 0.78
20 0.78
21 0.77
22 0.79
23 0.79
24 0.82
25 0.82
26 0.82
27 0.85
28 0.84
29 0.84
30 0.78
31 0.77
32 0.76
33 0.76
34 0.76
35 0.77
36 0.81
37 0.83
38 0.88
39 0.9
40 0.92
41 0.93
42 0.91
43 0.9
44 0.89
45 0.88
46 0.86
47 0.79
48 0.71
49 0.64
50 0.58
51 0.56
52 0.52
53 0.51
54 0.51
55 0.57
56 0.64
57 0.7
58 0.75
59 0.76
60 0.79
61 0.8
62 0.8
63 0.82
64 0.8
65 0.77
66 0.74
67 0.65
68 0.6
69 0.57
70 0.58
71 0.55
72 0.55
73 0.57
74 0.63
75 0.72
76 0.79
77 0.83
78 0.81
79 0.77
80 0.74
81 0.7
82 0.66
83 0.63
84 0.61
85 0.59
86 0.61
87 0.64
88 0.62
89 0.67
90 0.68
91 0.72
92 0.73
93 0.75
94 0.76
95 0.77
96 0.81
97 0.8
98 0.82
99 0.79
100 0.76
101 0.7
102 0.69
103 0.7
104 0.68
105 0.67
106 0.62
107 0.6
108 0.58
109 0.62
110 0.62
111 0.61
112 0.63
113 0.64
114 0.67
115 0.66
116 0.64
117 0.57
118 0.5
119 0.46
120 0.38
121 0.31
122 0.23
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.23
132 0.23
133 0.23
134 0.25
135 0.24
136 0.25
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.18
141 0.18
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.22
154 0.23
155 0.23
156 0.22
157 0.2
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.08
198 0.1
199 0.17
200 0.18
201 0.21
202 0.29
203 0.33
204 0.35
205 0.37
206 0.42
207 0.36
208 0.35
209 0.34
210 0.28
211 0.24
212 0.22
213 0.18
214 0.12
215 0.14
216 0.16
217 0.19
218 0.26
219 0.35
220 0.44
221 0.54
222 0.6
223 0.62
224 0.69
225 0.7
226 0.66
227 0.61
228 0.52
229 0.45
230 0.41
231 0.37
232 0.29
233 0.24
234 0.19
235 0.18
236 0.21
237 0.26
238 0.25
239 0.25
240 0.3
241 0.39
242 0.48
243 0.54
244 0.6
245 0.54
246 0.59
247 0.61
248 0.59
249 0.59
250 0.58
251 0.52
252 0.45
253 0.43
254 0.36
255 0.35
256 0.33
257 0.26
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.22
262 0.24
263 0.25
264 0.27
265 0.26
266 0.27
267 0.26
268 0.27
269 0.24
270 0.26
271 0.24
272 0.29
273 0.29
274 0.27
275 0.26
276 0.24
277 0.25
278 0.23
279 0.21
280 0.22