Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X0H7

Protein Details
Accession A0A2C5X0H7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-418RTEREWEERRLRRRNARLAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-458KKDSGAKKEPKRGS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
Amino Acid Sequences MPQQSAPTPISHSSIGTPQSVPSPSPIAQQTAFTVPPNKRPRLSPPTSQQESPYRAHSYISSPASITTPTVVASPQSGGIALPMATAATTFATPQQSSLMASGLHLPEGAASPTLAMAQAQQRPLIAAPSIDIKAEEAYMASLYAISDENKNTFSHLPPGSRSTMYGSGPLNQPATQTALEQNLFAAQVSEKAWNEALSRWERSHVQELSNPFLLIANLHHRADKIARDQGLSLNLETKINPNLPKIKNAPDPIEPRLQVSTKVLPDSTAIVNVTGSFIPHEANLGDQMALLSLATKCRLKSLIEDADRITRNRQNYSHGEIPEEWQPAAAELKPFKGDVPIDSDAVDADVGTQGPDASHSAGQKRPVEATKPTENGPPSKIPKVSTNHIIQAVRETGRTEREWEERRLRRRNARLAGTTDTSTSQTRAGSVAPGAQSRSIAPDKKDSGAKKEPKRGSKMAEASHASQNQTSSMFAGFGAASGLFGKKRKGKTYDWMNPGSGGGGGTGGRSGTATPGKSGGANAPATPAPLTSDTGRNRLGTWREDKDKGRLIQLRDWVAALTDDGLDSRAIQAALDKLDTSLPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.27
4 0.25
5 0.23
6 0.27
7 0.28
8 0.26
9 0.23
10 0.26
11 0.25
12 0.3
13 0.31
14 0.3
15 0.29
16 0.3
17 0.3
18 0.29
19 0.29
20 0.26
21 0.32
22 0.31
23 0.41
24 0.48
25 0.52
26 0.51
27 0.55
28 0.62
29 0.64
30 0.67
31 0.67
32 0.67
33 0.71
34 0.73
35 0.69
36 0.65
37 0.64
38 0.63
39 0.56
40 0.52
41 0.46
42 0.41
43 0.41
44 0.37
45 0.33
46 0.35
47 0.35
48 0.3
49 0.25
50 0.26
51 0.26
52 0.24
53 0.21
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.1
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.14
87 0.1
88 0.11
89 0.15
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.08
105 0.13
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.19
113 0.13
114 0.1
115 0.09
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.23
143 0.25
144 0.26
145 0.27
146 0.31
147 0.31
148 0.29
149 0.29
150 0.26
151 0.27
152 0.25
153 0.26
154 0.23
155 0.23
156 0.25
157 0.26
158 0.23
159 0.19
160 0.19
161 0.16
162 0.19
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.05
175 0.07
176 0.09
177 0.12
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.2
185 0.2
186 0.23
187 0.22
188 0.25
189 0.26
190 0.29
191 0.34
192 0.3
193 0.28
194 0.29
195 0.32
196 0.33
197 0.31
198 0.27
199 0.2
200 0.18
201 0.16
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.21
211 0.23
212 0.22
213 0.24
214 0.24
215 0.24
216 0.25
217 0.25
218 0.25
219 0.22
220 0.17
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.28
231 0.29
232 0.34
233 0.36
234 0.39
235 0.42
236 0.43
237 0.42
238 0.4
239 0.43
240 0.4
241 0.42
242 0.35
243 0.31
244 0.3
245 0.28
246 0.22
247 0.21
248 0.22
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.14
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.12
287 0.11
288 0.14
289 0.21
290 0.27
291 0.27
292 0.28
293 0.28
294 0.32
295 0.33
296 0.3
297 0.28
298 0.23
299 0.25
300 0.28
301 0.29
302 0.29
303 0.32
304 0.38
305 0.38
306 0.35
307 0.35
308 0.31
309 0.31
310 0.3
311 0.27
312 0.2
313 0.14
314 0.14
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.09
347 0.11
348 0.14
349 0.17
350 0.23
351 0.24
352 0.25
353 0.27
354 0.27
355 0.29
356 0.3
357 0.34
358 0.35
359 0.34
360 0.34
361 0.35
362 0.35
363 0.34
364 0.33
365 0.34
366 0.33
367 0.36
368 0.37
369 0.34
370 0.39
371 0.41
372 0.42
373 0.42
374 0.4
375 0.38
376 0.41
377 0.39
378 0.32
379 0.3
380 0.29
381 0.23
382 0.21
383 0.19
384 0.17
385 0.2
386 0.21
387 0.22
388 0.23
389 0.3
390 0.35
391 0.41
392 0.49
393 0.53
394 0.61
395 0.67
396 0.71
397 0.73
398 0.78
399 0.8
400 0.78
401 0.76
402 0.71
403 0.66
404 0.62
405 0.54
406 0.45
407 0.36
408 0.3
409 0.25
410 0.22
411 0.18
412 0.16
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.13
426 0.19
427 0.21
428 0.24
429 0.25
430 0.32
431 0.34
432 0.37
433 0.44
434 0.41
435 0.44
436 0.5
437 0.57
438 0.58
439 0.66
440 0.71
441 0.73
442 0.77
443 0.74
444 0.7
445 0.7
446 0.67
447 0.6
448 0.59
449 0.53
450 0.49
451 0.5
452 0.47
453 0.39
454 0.34
455 0.32
456 0.26
457 0.24
458 0.2
459 0.14
460 0.12
461 0.11
462 0.09
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.09
471 0.1
472 0.13
473 0.2
474 0.27
475 0.34
476 0.42
477 0.48
478 0.52
479 0.59
480 0.69
481 0.71
482 0.71
483 0.67
484 0.6
485 0.54
486 0.48
487 0.38
488 0.27
489 0.17
490 0.11
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.11
500 0.16
501 0.16
502 0.17
503 0.19
504 0.2
505 0.2
506 0.21
507 0.19
508 0.2
509 0.2
510 0.19
511 0.21
512 0.2
513 0.21
514 0.2
515 0.16
516 0.15
517 0.16
518 0.18
519 0.18
520 0.27
521 0.29
522 0.34
523 0.36
524 0.33
525 0.33
526 0.38
527 0.4
528 0.39
529 0.44
530 0.47
531 0.52
532 0.58
533 0.61
534 0.62
535 0.65
536 0.6
537 0.62
538 0.6
539 0.59
540 0.59
541 0.62
542 0.57
543 0.49
544 0.46
545 0.37
546 0.31
547 0.26
548 0.2
549 0.13
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.13
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.16
565 0.15