FuNGI

A0A2C5X0V8

Protein Details

Accession

A0A2C5X0V8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-130	GVAPRAKMNQQRSRRFRANQEAKEKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
417-433	RRKDQENRREANAKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 6, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPSAFRWLSNKYPKIISPVEEDKPLKMEDGSIIPINMAAKNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPADEEEMMLEVFRYTDRVLNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRANQEAKEKALEQAELLKSVQKETGSIPSTEQEVVRKAFDSNSITPGTPFMDILASSLRYWCAYKLNTDEGWANLKIIISDATVPGEGEHKIMDFIRSQRTSPNHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPYFRVLREDVFYQDSKARMCRLCGQKGHEARNCRGAAIEMEAAKAQAEEAVESDALEAPLKPFIWLHVSVLREYLAVELHVPQLPFKFDVERAIDDWIFLCCFVGNDFLPHLPALEIRENGIDVLTTLWRDNLPVMGGYVTKDGLLDLSRAQMIMDGLGKQEDAIFKRRKDQENRREANAKRRRLDAEARNDRNTYQGRQNHVVSIPNAGALFEIDGKTIDNMIIQKPIAEVNTANKSAASVLKAKLQSQKIAAATSTASETLENAGNSEPANATGATKRKADAIEDRGKEEMPSQPEEPVDPVRLWEDGYADRYYEAKFHKDPRDVSFRQSVAESYMEGLAWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAQDFTNISNMKIGFTPGRIARPFEQLMSVLPAGSRHALPEVFHDLMLNEESDIIDFYPEDFEVDLNGKKMAWQGVALLPFIDMPRLLKSVQAKYPELSEADKLRNQPGREVLILCDKNEHGVYDDITINFYSKKKKNGDDKDRFELDSSHTAGLTGWVEKIPDYTPHGALVYPLERKNMPDIDYDRSISVYYTFPEKIHGHKSMLLRGVKLPTPALNRQDVEMLKNKMNGGGGRSYGGAPLNHNNNYNPRHNQGPIHYGSDRGRGGYNRGGYGGHQYQKDNRSYAAGPSGYNQTGAYPPPPGVTEFRPRSLPAPPPAAQGFYNNNGRGGSHNGRGGYGRGHNNQHNDHYNQAGYAGPRDSYRGRGNGGGGYNHRGGSSTGSNFRGRGNYRGSRGGSGYH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.56
4	0.55
5	0.47
6	0.45
7	0.48
8	0.47
9	0.5
10	0.49
11	0.43
12	0.42
13	0.39
14	0.33
15	0.26
16	0.24
17	0.19
18	0.21
19	0.23
20	0.21
21	0.2
22	0.18
23	0.19
24	0.19
25	0.17
26	0.16
27	0.15
28	0.16
29	0.19
30	0.21
31	0.23
32	0.25
33	0.24
34	0.27
35	0.28
36	0.28
37	0.26
38	0.25
39	0.22
40	0.18
41	0.18
42	0.14
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.34
55	0.37
56	0.41
57	0.41
58	0.39
59	0.37
60	0.36
61	0.29
62	0.25
63	0.21
64	0.18
65	0.14
66	0.1
67	0.09
68	0.08
69	0.08
70	0.06
71	0.08
72	0.08
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.19
77	0.27
78	0.37
79	0.43
80	0.45
81	0.44
82	0.45
83	0.44
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.29
88	0.26
89	0.25
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.36
100	0.45
101	0.55
102	0.66
103	0.73
104	0.79
105	0.82
106	0.81
107	0.8
108	0.82
109	0.82
110	0.81
111	0.82
112	0.77
113	0.69
114	0.67
115	0.57
116	0.5
117	0.41
118	0.32
119	0.24
120	0.27
121	0.26
122	0.24
123	0.23
124	0.24
125	0.22
126	0.23
127	0.25
128	0.17
129	0.18
130	0.19
131	0.27
132	0.25
133	0.25
134	0.25
135	0.24
136	0.26
137	0.26
138	0.24
139	0.2
140	0.22
141	0.23
142	0.22
143	0.22
144	0.2
145	0.2
146	0.25
147	0.27
148	0.25
149	0.27
150	0.28
151	0.28
152	0.27
153	0.27
154	0.23
155	0.17
156	0.15
157	0.11
158	0.1
159	0.1
160	0.11
161	0.12
162	0.12
163	0.11
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.14
168	0.15
169	0.19
170	0.19
171	0.24
172	0.28
173	0.32
174	0.31
175	0.32
176	0.32
177	0.27
178	0.3
179	0.26
180	0.21
181	0.17
182	0.16
183	0.14
184	0.13
185	0.12
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.13
202	0.17
203	0.25
204	0.26
205	0.27
206	0.33
207	0.37
208	0.45
209	0.5
210	0.57
211	0.56
212	0.62
213	0.65
214	0.64
215	0.68
216	0.6
217	0.51
218	0.41
219	0.34
220	0.28
221	0.27
222	0.2
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.08
228	0.06
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.14
241	0.15
242	0.17
243	0.19
244	0.2
245	0.2
246	0.23
247	0.23
248	0.21
249	0.23
250	0.23
251	0.22
252	0.23
253	0.27
254	0.24
255	0.27
256	0.34
257	0.4
258	0.45
259	0.48
260	0.51
261	0.54
262	0.59
263	0.65
264	0.61
265	0.59
266	0.53
267	0.57
268	0.52
269	0.43
270	0.36
271	0.28
272	0.24
273	0.21
274	0.22
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.1
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.13
301	0.14
302	0.15
303	0.17
304	0.18
305	0.18
306	0.19
307	0.18
308	0.13
309	0.13
310	0.11
311	0.07
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.11
319	0.12
320	0.13
321	0.14
322	0.13
323	0.14
324	0.13
325	0.18
326	0.2
327	0.2
328	0.2
329	0.22
330	0.2
331	0.18
332	0.18
333	0.13
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.07
349	0.08
350	0.11
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.11
358	0.07
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.07
398	0.09
399	0.11
400	0.19
401	0.24
402	0.25
403	0.33
404	0.41
405	0.48
406	0.56
407	0.65
408	0.67
409	0.73
410	0.76
411	0.72
412	0.72
413	0.66
414	0.67
415	0.65
416	0.62
417	0.54
418	0.54
419	0.53
420	0.5
421	0.56
422	0.53
423	0.55
424	0.57
425	0.58
426	0.57
427	0.54
428	0.49
429	0.47
430	0.41
431	0.34
432	0.32
433	0.33
434	0.36
435	0.4
436	0.4
437	0.36
438	0.34
439	0.34
440	0.25
441	0.22
442	0.17
443	0.13
444	0.13
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.06
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.1
469	0.15
470	0.15
471	0.14
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.14
476	0.12
477	0.11
478	0.11
479	0.17
480	0.18
481	0.2
482	0.26
483	0.26
484	0.26
485	0.24
486	0.27
487	0.23
488	0.22
489	0.2
490	0.14
491	0.12
492	0.11
493	0.1
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.05
508	0.07
509	0.06
510	0.07
511	0.1
512	0.14
513	0.15
514	0.16
515	0.16
516	0.17
517	0.18
518	0.19
519	0.22
520	0.26
521	0.33
522	0.33
523	0.34
524	0.32
525	0.31
526	0.29
527	0.24
528	0.2
529	0.15
530	0.18
531	0.17
532	0.18
533	0.18
534	0.18
535	0.19
536	0.16
537	0.15
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.12
547	0.11
548	0.11
549	0.11
550	0.12
551	0.11
552	0.14
553	0.15
554	0.17
555	0.2
556	0.27
557	0.34
558	0.38
559	0.4
560	0.41
561	0.49
562	0.45
563	0.45
564	0.44
565	0.37
566	0.33
567	0.3
568	0.26
569	0.18
570	0.18
571	0.14
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.07
576	0.07
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.06
587	0.07
588	0.08
589	0.12
590	0.15
591	0.15
592	0.18
593	0.18
594	0.23
595	0.25
596	0.25
597	0.22
598	0.2
599	0.19
600	0.19
601	0.2
602	0.16
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.15
607	0.21
608	0.19
609	0.17
610	0.18
611	0.18
612	0.17
613	0.16
614	0.17
615	0.11
616	0.11
617	0.15
618	0.14
619	0.19
620	0.19
621	0.22
622	0.23
623	0.28
624	0.28
625	0.24
626	0.24
627	0.18
628	0.18
629	0.18
630	0.16
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.1
636	0.1
637	0.07
638	0.09
639	0.09
640	0.1
641	0.13
642	0.17
643	0.16
644	0.16
645	0.16
646	0.14
647	0.15
648	0.15
649	0.11
650	0.06
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.07
665	0.09
666	0.1
667	0.09
668	0.1
669	0.09
670	0.1
671	0.12
672	0.13
673	0.11
674	0.1
675	0.11
676	0.14
677	0.15
678	0.14
679	0.12
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.09
684	0.06
685	0.06
686	0.09
687	0.1
688	0.1
689	0.13
690	0.19
691	0.25
692	0.29
693	0.33
694	0.32
695	0.31
696	0.33
697	0.31
698	0.27
699	0.22
700	0.22
701	0.21
702	0.23
703	0.26
704	0.26
705	0.31
706	0.35
707	0.34
708	0.34
709	0.35
710	0.34
711	0.33
712	0.32
713	0.27
714	0.31
715	0.31
716	0.27
717	0.26
718	0.22
719	0.23
720	0.22
721	0.21
722	0.14
723	0.14
724	0.14
725	0.15
726	0.17
727	0.14
728	0.15
729	0.15
730	0.13
731	0.15
732	0.17
733	0.24
734	0.27
735	0.36
736	0.42
737	0.5
738	0.6
739	0.68
740	0.76
741	0.78
742	0.8
743	0.78
744	0.74
745	0.66
746	0.56
747	0.47
748	0.4
749	0.35
750	0.31
751	0.23
752	0.21
753	0.2
754	0.19
755	0.19
756	0.15
757	0.11
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.09
762	0.11
763	0.11
764	0.12
765	0.17
766	0.19
767	0.2
768	0.2
769	0.21
770	0.19
771	0.18
772	0.19
773	0.18
774	0.2
775	0.2
776	0.22
777	0.22
778	0.24
779	0.3
780	0.29
781	0.27
782	0.28
783	0.3
784	0.33
785	0.36
786	0.35
787	0.3
788	0.27
789	0.25
790	0.19
791	0.18
792	0.13
793	0.12
794	0.15
795	0.16
796	0.15
797	0.21
798	0.23
799	0.26
800	0.32
801	0.34
802	0.32
803	0.36
804	0.4
805	0.4
806	0.45
807	0.41
808	0.36
809	0.36
810	0.37
811	0.34
812	0.32
813	0.28
814	0.27
815	0.32
816	0.36
817	0.37
818	0.38
819	0.37
820	0.36
821	0.4
822	0.36
823	0.34
824	0.36
825	0.35
826	0.32
827	0.34
828	0.34
829	0.3
830	0.32
831	0.28
832	0.24
833	0.24
834	0.21
835	0.2
836	0.21
837	0.19
838	0.18
839	0.19
840	0.17
841	0.17
842	0.24
843	0.29
844	0.31
845	0.33
846	0.35
847	0.4
848	0.45
849	0.49
850	0.47
851	0.44
852	0.47
853	0.48
854	0.5
855	0.46
856	0.48
857	0.43
858	0.44
859	0.41
860	0.4
861	0.39
862	0.41
863	0.36
864	0.3
865	0.32
866	0.28
867	0.33
868	0.35
869	0.35
870	0.29
871	0.29
872	0.28
873	0.25
874	0.31
875	0.33
876	0.32
877	0.32
878	0.34
879	0.41
880	0.48
881	0.51
882	0.45
883	0.39
884	0.38
885	0.37
886	0.37
887	0.36
888	0.3
889	0.26
890	0.27
891	0.32
892	0.27
893	0.26
894	0.23
895	0.18
896	0.2
897	0.21
898	0.2
899	0.16
900	0.16
901	0.17
902	0.18
903	0.19
904	0.21
905	0.25
906	0.34
907	0.37
908	0.39
909	0.41
910	0.41
911	0.41
912	0.43
913	0.46
914	0.41
915	0.44
916	0.42
917	0.45
918	0.44
919	0.44
920	0.38
921	0.36
922	0.35
923	0.34
924	0.41
925	0.36
926	0.36
927	0.34
928	0.34
929	0.31
930	0.35
931	0.34
932	0.31
933	0.34
934	0.33
935	0.34
936	0.35
937	0.33
938	0.3
939	0.32
940	0.35
941	0.38
942	0.45
943	0.5
944	0.56
945	0.59
946	0.61
947	0.61
948	0.56
949	0.53
950	0.49
951	0.44
952	0.36
953	0.32
954	0.27
955	0.21
956	0.22
957	0.2
958	0.17
959	0.18
960	0.22
961	0.24
962	0.28
963	0.33
964	0.34
965	0.35
966	0.37
967	0.39
968	0.39
969	0.4
970	0.39
971	0.35
972	0.36
973	0.36
974	0.33
975	0.31
976	0.26
977	0.24
978	0.25
979	0.28
980	0.29
981	0.32
982	0.36
983	0.38
984	0.38
985	0.41
986	0.44
987	0.41
988	0.42
989	0.45
990	0.49
991	0.52
992	0.59
993	0.58
994	0.53

A0A2C5X0V8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer