Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X6T8

Protein Details
Accession A0A2C5X6T8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
875-896GPKSESSSGKKRAKKINASTGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
885-887KRA
Subcellular Location(s) cyto 21.5, cyto_nucl 15, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MHIIKPAWLSHSGEQKDFEVYSCHVSPDGKRLATAGGDGHVRIWSTEAIYNANNDSYTKPRQLCHMSHHLGTIHSVRFSPNGKYLASGADDKIICVYHLDKSAPSVAFGSSEPPPVENWKTYKRLIGHDNDVQDLAWSNDSSILLSVGLDSKVVVWSGHTFEKLKTISTHTSHVKGICFDPANKYLATASDDRTIKIFRFTSPAPNATQHDMVNNFVLESTISAPFRNSPLTTYFRRCSWSPDGNHISASNAVNGPVSSIVIIDRTSWSSDIHLIGHEAPSEVCMFSPRLFYNEDPAKVPNTSLVTVIASAGQDKTLTIWNTNNSRPVVILQDITGKSIVDLSWAPDGQTIFAASLDGSIIGFKFDAGELGWVATEEENYKALHRYGVSRKGMGIAEDVDGLHLENSSKQDESRAAQSRMGALMGDAASAIKEEEAVPQTNGVKNGISKPTITTTITAPGASGAAAAVTPTTNGTTPDLSKEKNKPEEPTQEQESAEKAAARVNELKSRVTVGKDGKKRVAPLLVSSSGTGLSSLPQAQLVGSTTAKAAPNDAPQTIIDISKPYDGLPKGGLVSLIIGSKRKAAIIETEDTHEDAPQRATSGPVPVVTNGPDGVEAVQPTAPADGLVPVPDYLRSAVLNPAVSYSHLRLAVPKVRSLILRPLEKGILLGESTLEDATRLGENIILEAKNPTNAREPTRVVASKRAEVLWEDFLPRAVLLVAGNRNFWAVACEDGSVHVWTPAGRRLLNPMILESQPVILECRDYWLLCITAVGLCYVWDIRSQSSPNPPVSLGPVLEIAATSLSRHGFVTAPGVTSAHLNSSGHIIVTLSNGDGYYYSREMFVWQRLSESWWAVGSQYWNSNDSSISALQSTAVGPKSESSSGKKRAKKINASTGVIPFLERHTTTEFLVKGRAYNLQRIIKLVMAKDGFQNFESSVSIAHLETRIAGSMALEAQDEFRLYLFMYAKRIGAEGHRGKVEELLNSLVGGVMRDMQSDDVPAKGWFTKDGPICGWDRMELLKGVVMILGKFREVQRLTVQYAKLINLTNNGSGDDEDDAMDVDVVTGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.39
4 0.34
5 0.29
6 0.23
7 0.22
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.26
13 0.28
14 0.33
15 0.38
16 0.32
17 0.31
18 0.31
19 0.32
20 0.29
21 0.28
22 0.2
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.17
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.21
38 0.21
39 0.21
40 0.19
41 0.18
42 0.2
43 0.24
44 0.29
45 0.36
46 0.37
47 0.38
48 0.46
49 0.53
50 0.53
51 0.54
52 0.58
53 0.55
54 0.52
55 0.54
56 0.47
57 0.39
58 0.39
59 0.36
60 0.28
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.26
65 0.29
66 0.3
67 0.31
68 0.31
69 0.3
70 0.31
71 0.3
72 0.28
73 0.29
74 0.26
75 0.21
76 0.24
77 0.24
78 0.22
79 0.23
80 0.2
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.15
85 0.19
86 0.21
87 0.19
88 0.22
89 0.28
90 0.26
91 0.25
92 0.22
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.15
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.25
103 0.29
104 0.31
105 0.36
106 0.4
107 0.45
108 0.46
109 0.51
110 0.48
111 0.51
112 0.53
113 0.53
114 0.52
115 0.52
116 0.52
117 0.47
118 0.43
119 0.35
120 0.28
121 0.22
122 0.17
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.11
144 0.15
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.2
149 0.28
150 0.26
151 0.26
152 0.25
153 0.29
154 0.33
155 0.35
156 0.41
157 0.38
158 0.4
159 0.41
160 0.41
161 0.37
162 0.32
163 0.31
164 0.31
165 0.29
166 0.28
167 0.31
168 0.31
169 0.31
170 0.28
171 0.28
172 0.22
173 0.21
174 0.23
175 0.2
176 0.2
177 0.25
178 0.26
179 0.25
180 0.27
181 0.27
182 0.24
183 0.28
184 0.26
185 0.2
186 0.26
187 0.27
188 0.34
189 0.37
190 0.4
191 0.36
192 0.39
193 0.41
194 0.39
195 0.4
196 0.31
197 0.3
198 0.28
199 0.27
200 0.24
201 0.2
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.22
218 0.27
219 0.32
220 0.38
221 0.38
222 0.37
223 0.41
224 0.39
225 0.41
226 0.44
227 0.46
228 0.42
229 0.49
230 0.53
231 0.49
232 0.49
233 0.42
234 0.35
235 0.3
236 0.28
237 0.21
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.09
244 0.09
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.15
275 0.14
276 0.16
277 0.19
278 0.19
279 0.26
280 0.3
281 0.31
282 0.28
283 0.29
284 0.29
285 0.26
286 0.26
287 0.21
288 0.18
289 0.18
290 0.16
291 0.16
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.1
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.17
307 0.22
308 0.27
309 0.29
310 0.33
311 0.28
312 0.27
313 0.26
314 0.24
315 0.22
316 0.18
317 0.17
318 0.13
319 0.19
320 0.18
321 0.19
322 0.18
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.18
373 0.24
374 0.33
375 0.33
376 0.32
377 0.32
378 0.33
379 0.32
380 0.26
381 0.2
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.06
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.14
399 0.16
400 0.22
401 0.27
402 0.27
403 0.28
404 0.28
405 0.27
406 0.25
407 0.23
408 0.15
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.06
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.12
426 0.14
427 0.15
428 0.16
429 0.14
430 0.12
431 0.13
432 0.17
433 0.18
434 0.17
435 0.15
436 0.16
437 0.18
438 0.19
439 0.19
440 0.16
441 0.14
442 0.17
443 0.17
444 0.15
445 0.12
446 0.1
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.05
460 0.06
461 0.07
462 0.09
463 0.09
464 0.14
465 0.16
466 0.16
467 0.22
468 0.28
469 0.34
470 0.4
471 0.42
472 0.42
473 0.46
474 0.54
475 0.53
476 0.51
477 0.47
478 0.42
479 0.4
480 0.36
481 0.31
482 0.23
483 0.18
484 0.14
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.15
490 0.15
491 0.19
492 0.2
493 0.2
494 0.19
495 0.21
496 0.2
497 0.17
498 0.21
499 0.23
500 0.3
501 0.35
502 0.38
503 0.39
504 0.39
505 0.4
506 0.37
507 0.34
508 0.26
509 0.23
510 0.24
511 0.21
512 0.2
513 0.18
514 0.16
515 0.13
516 0.12
517 0.1
518 0.06
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.1
536 0.1
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.15
543 0.14
544 0.13
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.09
549 0.1
550 0.08
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.06
560 0.07
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.12
572 0.15
573 0.17
574 0.16
575 0.17
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.14
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.1
585 0.09
586 0.11
587 0.1
588 0.12
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.11
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.1
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.11
628 0.1
629 0.11
630 0.12
631 0.11
632 0.13
633 0.13
634 0.13
635 0.14
636 0.19
637 0.25
638 0.24
639 0.24
640 0.22
641 0.23
642 0.24
643 0.24
644 0.27
645 0.27
646 0.28
647 0.28
648 0.28
649 0.27
650 0.26
651 0.24
652 0.16
653 0.11
654 0.08
655 0.07
656 0.05
657 0.05
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.09
671 0.08
672 0.08
673 0.1
674 0.1
675 0.13
676 0.14
677 0.15
678 0.21
679 0.24
680 0.28
681 0.31
682 0.33
683 0.31
684 0.37
685 0.39
686 0.33
687 0.38
688 0.37
689 0.34
690 0.34
691 0.32
692 0.26
693 0.24
694 0.25
695 0.2
696 0.18
697 0.17
698 0.15
699 0.16
700 0.15
701 0.13
702 0.1
703 0.06
704 0.06
705 0.05
706 0.1
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.13
713 0.12
714 0.1
715 0.07
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.09
721 0.11
722 0.1
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.11
728 0.15
729 0.17
730 0.17
731 0.17
732 0.23
733 0.26
734 0.29
735 0.27
736 0.24
737 0.24
738 0.23
739 0.24
740 0.17
741 0.15
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.08
746 0.09
747 0.08
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.13
752 0.14
753 0.14
754 0.12
755 0.12
756 0.09
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.06
761 0.05
762 0.06
763 0.07
764 0.07
765 0.08
766 0.1
767 0.11
768 0.15
769 0.18
770 0.21
771 0.3
772 0.34
773 0.33
774 0.33
775 0.32
776 0.29
777 0.3
778 0.28
779 0.19
780 0.15
781 0.14
782 0.13
783 0.12
784 0.11
785 0.08
786 0.06
787 0.06
788 0.06
789 0.07
790 0.08
791 0.09
792 0.09
793 0.1
794 0.1
795 0.1
796 0.14
797 0.13
798 0.13
799 0.13
800 0.13
801 0.12
802 0.13
803 0.12
804 0.09
805 0.1
806 0.1
807 0.1
808 0.13
809 0.12
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.08
814 0.1
815 0.1
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.08
822 0.11
823 0.12
824 0.12
825 0.12
826 0.12
827 0.15
828 0.19
829 0.24
830 0.24
831 0.23
832 0.25
833 0.25
834 0.28
835 0.28
836 0.25
837 0.2
838 0.16
839 0.16
840 0.14
841 0.16
842 0.15
843 0.15
844 0.19
845 0.2
846 0.21
847 0.21
848 0.22
849 0.2
850 0.18
851 0.19
852 0.14
853 0.14
854 0.12
855 0.12
856 0.11
857 0.11
858 0.11
859 0.12
860 0.12
861 0.12
862 0.12
863 0.13
864 0.17
865 0.2
866 0.23
867 0.26
868 0.35
869 0.45
870 0.53
871 0.59
872 0.64
873 0.7
874 0.77
875 0.8
876 0.8
877 0.81
878 0.79
879 0.76
880 0.71
881 0.62
882 0.54
883 0.44
884 0.35
885 0.25
886 0.2
887 0.21
888 0.18
889 0.19
890 0.21
891 0.23
892 0.23
893 0.28
894 0.26
895 0.23
896 0.26
897 0.24
898 0.21
899 0.22
900 0.29
901 0.26
902 0.32
903 0.4
904 0.42
905 0.42
906 0.43
907 0.43
908 0.38
909 0.38
910 0.32
911 0.3
912 0.25
913 0.25
914 0.28
915 0.29
916 0.28
917 0.25
918 0.26
919 0.19
920 0.2
921 0.2
922 0.14
923 0.13
924 0.12
925 0.12
926 0.1
927 0.12
928 0.11
929 0.1
930 0.11
931 0.11
932 0.11
933 0.1
934 0.1
935 0.08
936 0.08
937 0.09
938 0.09
939 0.08
940 0.08
941 0.09
942 0.1
943 0.1
944 0.09
945 0.08
946 0.08
947 0.08
948 0.13
949 0.16
950 0.17
951 0.21
952 0.22
953 0.23
954 0.23
955 0.24
956 0.2
957 0.21
958 0.29
959 0.31
960 0.34
961 0.35
962 0.35
963 0.35
964 0.39
965 0.37
966 0.29
967 0.25
968 0.23
969 0.21
970 0.2
971 0.19
972 0.14
973 0.12
974 0.1
975 0.08
976 0.1
977 0.1
978 0.1
979 0.11
980 0.12
981 0.12
982 0.14
983 0.15
984 0.12
985 0.13
986 0.13
987 0.15
988 0.16
989 0.17
990 0.18
991 0.19
992 0.26
993 0.28
994 0.32
995 0.31
996 0.32
997 0.33
998 0.33
999 0.32
1000 0.25
1001 0.24
1002 0.22
1003 0.23
1004 0.2
1005 0.18
1006 0.17
1007 0.16
1008 0.15
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.11
1012 0.14
1013 0.14
1014 0.13
1015 0.16
1016 0.17
1017 0.25
1018 0.26
1019 0.3
1020 0.35
1021 0.39
1022 0.43
1023 0.46
1024 0.45
1025 0.4
1026 0.42
1027 0.39
1028 0.34
1029 0.31
1030 0.29
1031 0.28
1032 0.31
1033 0.29
1034 0.27
1035 0.27
1036 0.24
1037 0.22
1038 0.21
1039 0.18
1040 0.15
1041 0.12
1042 0.11
1043 0.11
1044 0.1
1045 0.1
1046 0.08