FuNGI

B8M0U5

Protein Details

Accession

B8M0U5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-446	RRRRQAEERKAANEQRRKEEEKARNAERSQKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIISPVIEEQPYEVNGEVIPVDTTKPNPNGEETDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEIFRYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEARENDQKKEEFQKLLARQNAAKGIDPDNNLEEQVIKKTWDSNVITPGTPFMDILSASLRYWISYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKVMNFIRSQRQDPSHDPNTRHVLYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKPRTCRLCGQTGHKAEECRGQAKEKNGEFDEKQKAAVLKPFIWLNVSVLREYLAIELQVPQQRFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIKENAIDLLISIWRENIPLMDDYVTKDGIVNFKHAQLILTGLGKQEEAIFRRRRQAEERKAANEQRRKEEEKARNAERSQKRRRSSPDYTAGEPTIAAPPSKARKSGEGFIASTEVTLITPSRGHLDKETRQLTHSMVVNRSAIYKANEANKSAAAALKSQLLKGKLAVNDEAESANSDGPSGEDTAQDESQGISPSVLGKRKVEDLADADNGTPGRDSPVPAGQSKPTDEMPPDTVRLWEPGYTERYYEQKFHVDPSNVEFRHQVARSYAEGLQWVLLYYMQGCPSWTWYYPYHYAPFASDFVDIGDMKPNFVKGKPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEIFHDLMSDPNSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEVRLLAAMEKKYPLLSADEHARNTVGSDVLLLSDQHPLYQELAMNFYSKKQVVPKFKLNMRVSEGLAGKVERDDNHIPHSSLNPPYDVDMPSLDENRSMMVNYEIPKSTHLHKSMLLRGVRFPPPTLDQSDISAVKAKSRYNGGGRGGYRGNNGGGRGGNQYNPPRPGMNERANPFAAHLDPSFVPPPQGGWVPPVGGAGYSRGPPPPPRGGSYGYQNSSRGYNNSGYYGQDNSYQRGYDQYGYSAPPADYNQQGYYNGPRGGGSNRGDPRGYNSNQGGYQSQGRGGYNFRRGDGYDRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.48
3	0.52
4	0.52
5	0.47
6	0.44
7	0.46
8	0.47
9	0.44
10	0.42
11	0.35
12	0.34
13	0.33
14	0.27
15	0.19
16	0.15
17	0.13
18	0.14
19	0.12
20	0.09
21	0.1
22	0.09
23	0.11
24	0.13
25	0.17
26	0.23
27	0.28
28	0.31
29	0.32
30	0.36
31	0.39
32	0.39
33	0.42
34	0.39
35	0.39
36	0.36
37	0.34
38	0.3
39	0.25
40	0.22
41	0.17
42	0.13
43	0.09
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.1
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.44
55	0.5
56	0.5
57	0.54
58	0.57
59	0.6
60	0.52
61	0.46
62	0.39
63	0.34
64	0.32
65	0.24
66	0.17
67	0.13
68	0.14
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.14
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.27
77	0.37
78	0.43
79	0.45
80	0.44
81	0.45
82	0.44
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.75
110	0.77
111	0.73
112	0.69
113	0.74
114	0.7
115	0.61
116	0.59
117	0.51
118	0.46
119	0.49
120	0.51
121	0.44
122	0.44
123	0.52
124	0.5
125	0.57
126	0.56
127	0.51
128	0.48
129	0.49
130	0.52
131	0.44
132	0.4
133	0.34
134	0.34
135	0.35
136	0.35
137	0.33
138	0.29
139	0.28
140	0.26
141	0.23
142	0.2
143	0.17
144	0.2
145	0.18
146	0.17
147	0.17
148	0.21
149	0.22
150	0.29
151	0.31
152	0.3
153	0.35
154	0.36
155	0.36
156	0.32
157	0.32
158	0.25
159	0.21
160	0.17
161	0.11
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.13
169	0.13
170	0.12
171	0.14
172	0.17
173	0.19
174	0.21
175	0.25
176	0.27
177	0.33
178	0.32
179	0.36
180	0.35
181	0.36
182	0.39
183	0.36
184	0.31
185	0.29
186	0.34
187	0.3
188	0.29
189	0.25
190	0.21
191	0.24
192	0.24
193	0.21
194	0.15
195	0.15
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.13
203	0.14
204	0.16
205	0.18
206	0.22
207	0.3
208	0.33
209	0.37
210	0.4
211	0.44
212	0.48
213	0.51
214	0.55
215	0.56
216	0.57
217	0.57
218	0.56
219	0.59
220	0.54
221	0.48
222	0.4
223	0.32
224	0.26
225	0.26
226	0.2
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.06
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.18
245	0.2
246	0.24
247	0.25
248	0.26
249	0.25
250	0.28
251	0.27
252	0.24
253	0.3
254	0.28
255	0.31
256	0.33
257	0.35
258	0.33
259	0.36
260	0.45
261	0.42
262	0.47
263	0.47
264	0.51
265	0.56
266	0.58
267	0.6
268	0.53
269	0.49
270	0.42
271	0.44
272	0.39
273	0.33
274	0.31
275	0.32
276	0.33
277	0.39
278	0.46
279	0.41
280	0.43
281	0.41
282	0.44
283	0.4
284	0.44
285	0.44
286	0.36
287	0.34
288	0.32
289	0.31
290	0.28
291	0.32
292	0.28
293	0.22
294	0.23
295	0.24
296	0.21
297	0.21
298	0.19
299	0.16
300	0.18
301	0.18
302	0.15
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.12
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.13
313	0.16
314	0.16
315	0.17
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.22
320	0.22
321	0.2
322	0.23
323	0.23
324	0.24
325	0.24
326	0.24
327	0.2
328	0.15
329	0.14
330	0.1
331	0.1
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.11
348	0.15
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.09
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.13
378	0.14
379	0.16
380	0.16
381	0.17
382	0.18
383	0.17
384	0.16
385	0.12
386	0.13
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.11
396	0.12
397	0.2
398	0.26
399	0.28
400	0.37
401	0.39
402	0.42
403	0.48
404	0.57
405	0.59
406	0.63
407	0.65
408	0.6
409	0.64
410	0.65
411	0.65
412	0.61
413	0.55
414	0.53
415	0.55
416	0.56
417	0.56
418	0.6
419	0.6
420	0.63
421	0.66
422	0.61
423	0.61
424	0.57
425	0.62
426	0.61
427	0.63
428	0.64
429	0.66
430	0.66
431	0.68
432	0.74
433	0.73
434	0.7
435	0.68
436	0.67
437	0.62
438	0.6
439	0.54
440	0.47
441	0.37
442	0.3
443	0.23
444	0.15
445	0.12
446	0.1
447	0.08
448	0.13
449	0.19
450	0.21
451	0.23
452	0.21
453	0.27
454	0.3
455	0.34
456	0.33
457	0.29
458	0.28
459	0.25
460	0.25
461	0.19
462	0.15
463	0.11
464	0.07
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.09
472	0.1
473	0.11
474	0.14
475	0.21
476	0.25
477	0.33
478	0.35
479	0.32
480	0.32
481	0.33
482	0.3
483	0.27
484	0.26
485	0.21
486	0.19
487	0.2
488	0.19
489	0.18
490	0.18
491	0.15
492	0.13
493	0.12
494	0.13
495	0.15
496	0.21
497	0.22
498	0.22
499	0.23
500	0.21
501	0.19
502	0.18
503	0.16
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.15
514	0.19
515	0.16
516	0.18
517	0.18
518	0.16
519	0.15
520	0.16
521	0.14
522	0.1
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.08
540	0.09
541	0.1
542	0.09
543	0.06
544	0.06
545	0.09
546	0.12
547	0.15
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.19
552	0.2
553	0.18
554	0.16
555	0.15
556	0.17
557	0.17
558	0.15
559	0.13
560	0.13
561	0.13
562	0.11
563	0.09
564	0.06
565	0.08
566	0.09
567	0.1
568	0.1
569	0.15
570	0.17
571	0.17
572	0.19
573	0.18
574	0.2
575	0.2
576	0.2
577	0.17
578	0.17
579	0.17
580	0.18
581	0.19
582	0.19
583	0.19
584	0.17
585	0.17
586	0.16
587	0.17
588	0.15
589	0.13
590	0.12
591	0.14
592	0.18
593	0.17
594	0.18
595	0.17
596	0.22
597	0.22
598	0.23
599	0.22
600	0.24
601	0.24
602	0.26
603	0.3
604	0.26
605	0.25
606	0.27
607	0.34
608	0.29
609	0.29
610	0.27
611	0.23
612	0.28
613	0.28
614	0.25
615	0.18
616	0.21
617	0.2
618	0.23
619	0.22
620	0.16
621	0.16
622	0.14
623	0.13
624	0.1
625	0.09
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.08
635	0.12
636	0.14
637	0.14
638	0.17
639	0.17
640	0.23
641	0.26
642	0.28
643	0.26
644	0.25
645	0.24
646	0.22
647	0.22
648	0.18
649	0.15
650	0.13
651	0.11
652	0.1
653	0.12
654	0.11
655	0.09
656	0.14
657	0.13
658	0.14
659	0.14
660	0.16
661	0.15
662	0.17
663	0.25
664	0.25
665	0.34
666	0.41
667	0.44
668	0.45
669	0.49
670	0.49
671	0.43
672	0.41
673	0.33
674	0.27
675	0.25
676	0.23
677	0.17
678	0.15
679	0.13
680	0.11
681	0.11
682	0.1
683	0.08
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.14
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.15
692	0.14
693	0.16
694	0.18
695	0.14
696	0.09
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.1
701	0.08
702	0.1
703	0.09
704	0.1
705	0.1
706	0.1
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.1
711	0.14
712	0.14
713	0.14
714	0.16
715	0.15
716	0.17
717	0.18
718	0.17
719	0.15
720	0.14
721	0.14
722	0.16
723	0.17
724	0.15
725	0.14
726	0.13
727	0.11
728	0.11
729	0.1
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.07
736	0.11
737	0.12
738	0.14
739	0.14
740	0.14
741	0.14
742	0.15
743	0.13
744	0.12
745	0.13
746	0.15
747	0.23
748	0.26
749	0.26
750	0.26
751	0.25
752	0.22
753	0.21
754	0.19
755	0.1
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.12
767	0.13
768	0.14
769	0.15
770	0.16
771	0.12
772	0.15
773	0.15
774	0.15
775	0.14
776	0.15
777	0.18
778	0.17
779	0.19
780	0.25
781	0.33
782	0.42
783	0.49
784	0.56
785	0.59
786	0.63
787	0.7
788	0.65
789	0.61
790	0.57
791	0.53
792	0.45
793	0.42
794	0.39
795	0.3
796	0.28
797	0.23
798	0.18
799	0.16
800	0.18
801	0.13
802	0.19
803	0.23
804	0.24
805	0.29
806	0.31
807	0.3
808	0.29
809	0.32
810	0.3
811	0.3
812	0.29
813	0.25
814	0.23
815	0.25
816	0.26
817	0.24
818	0.2
819	0.16
820	0.17
821	0.19
822	0.2
823	0.18
824	0.16
825	0.15
826	0.15
827	0.14
828	0.12
829	0.1
830	0.1
831	0.14
832	0.15
833	0.19
834	0.2
835	0.2
836	0.22
837	0.24
838	0.27
839	0.31
840	0.32
841	0.31
842	0.34
843	0.4
844	0.44
845	0.49
846	0.46
847	0.39
848	0.41
849	0.44
850	0.46
851	0.41
852	0.35
853	0.33
854	0.35
855	0.37
856	0.37
857	0.34
858	0.29
859	0.3
860	0.34
861	0.3
862	0.26
863	0.29
864	0.25
865	0.27
866	0.3
867	0.29
868	0.28
869	0.33
870	0.39
871	0.38
872	0.45
873	0.43
874	0.46
875	0.45
876	0.46
877	0.43
878	0.39
879	0.36
880	0.31
881	0.3
882	0.25
883	0.25
884	0.23
885	0.21
886	0.21
887	0.24
888	0.23
889	0.24
890	0.29
891	0.36
892	0.4
893	0.42
894	0.42
895	0.39
896	0.41
897	0.47
898	0.49
899	0.5
900	0.51
901	0.51
902	0.54
903	0.53
904	0.5
905	0.43
906	0.37
907	0.29
908	0.24
909	0.21
910	0.19
911	0.18
912	0.23
913	0.23
914	0.2
915	0.2
916	0.17
917	0.18
918	0.18
919	0.2
920	0.16
921	0.17
922	0.18
923	0.18
924	0.18
925	0.17
926	0.14
927	0.12
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.13
932	0.15
933	0.16
934	0.2
935	0.26
936	0.32
937	0.39
938	0.41
939	0.43
940	0.46
941	0.48
942	0.48
943	0.52
944	0.54
945	0.48
946	0.47
947	0.44
948	0.41
949	0.41
950	0.4
951	0.32
952	0.28
953	0.3
954	0.29
955	0.32
956	0.31
957	0.3
958	0.29
959	0.29
960	0.25
961	0.28
962	0.29
963	0.29
964	0.3
965	0.28
966	0.26
967	0.29
968	0.32
969	0.28
970	0.27
971	0.26
972	0.26
973	0.27
974	0.28
975	0.26
976	0.22
977	0.21
978	0.23
979	0.25
980	0.26
981	0.28
982	0.3
983	0.29
984	0.3
985	0.31
986	0.35
987	0.37
988	0.34
989	0.31
990	0.28
991	0.28
992	0.31
993	0.35
994	0.31
995	0.34
996	0.38
997	0.41
998	0.41
999	0.4
1000	0.43
1001	0.45
1002	0.44
1003	0.42
1004	0.41
1005	0.42
1006	0.43
1007	0.45
1008	0.39
1009	0.34
1010	0.38
1011	0.32
1012	0.32
1013	0.3
1014	0.3
1015	0.3
1016	0.34
1017	0.39
1018	0.41
1019	0.42
1020	0.4
1021	0.4
1022	0.41

B8M0U5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer