Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1BXN9

Protein Details
Accession A0A0D1BXN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-193DPAKTAKKERLAKKQKNEKQRLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-129PREKSMPKPKPLTKWEKFAKQKGIQSRKK
176-190AKKERLAKKQKNEKQ
334-341KRGKRASK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 7.666, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007023  Ribosom_reg  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG uma:UMAG_04751  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04939  RRS1  
Amino Acid Sequences MPEVIVSNATTSLDGTALAAASTSKYKPTTVDQGSTPYQFDVGLLASINPNPVTACSAAHLADRTRDGVQSLVNKIFALPITRDPDHGPLASLPAFTSKLPREKSMPKPKPLTKWEKFAKQKGIQSRKKDKMVFDENTQEWVPRWGFKGANKDLEEQWIHELKNNGNTDMDPAKTAKKERLAKKQKNEKQRLGNLARAAASTAASSAASSSSKGGLGDANPAKLARAAAREKRKAELEADVLRSRASTASMGRFDKTLQGEQKQKGLKRKFDPNEKDVGAERASNLALLNKLGTAAMRKNAKLAQGQGDRELVNTRKAVQFATAGHGVTSMNAKRGKRASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.11
10 0.11
11 0.15
12 0.17
13 0.18
14 0.21
15 0.27
16 0.36
17 0.37
18 0.4
19 0.37
20 0.42
21 0.45
22 0.43
23 0.38
24 0.28
25 0.23
26 0.19
27 0.18
28 0.13
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.17
48 0.15
49 0.17
50 0.19
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.18
68 0.24
69 0.24
70 0.26
71 0.27
72 0.29
73 0.29
74 0.27
75 0.22
76 0.16
77 0.19
78 0.18
79 0.16
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.18
85 0.2
86 0.27
87 0.29
88 0.32
89 0.36
90 0.43
91 0.54
92 0.6
93 0.63
94 0.63
95 0.7
96 0.73
97 0.76
98 0.77
99 0.77
100 0.69
101 0.71
102 0.7
103 0.71
104 0.73
105 0.71
106 0.71
107 0.66
108 0.68
109 0.69
110 0.73
111 0.71
112 0.73
113 0.76
114 0.74
115 0.76
116 0.73
117 0.66
118 0.63
119 0.64
120 0.57
121 0.49
122 0.48
123 0.41
124 0.4
125 0.37
126 0.29
127 0.21
128 0.22
129 0.2
130 0.15
131 0.17
132 0.17
133 0.19
134 0.22
135 0.31
136 0.3
137 0.36
138 0.36
139 0.36
140 0.33
141 0.35
142 0.32
143 0.23
144 0.24
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.17
150 0.24
151 0.24
152 0.21
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.25
165 0.34
166 0.41
167 0.51
168 0.6
169 0.65
170 0.74
171 0.81
172 0.79
173 0.82
174 0.83
175 0.79
176 0.77
177 0.75
178 0.74
179 0.66
180 0.63
181 0.53
182 0.45
183 0.38
184 0.29
185 0.23
186 0.14
187 0.11
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.1
213 0.15
214 0.22
215 0.3
216 0.39
217 0.46
218 0.46
219 0.49
220 0.5
221 0.46
222 0.41
223 0.37
224 0.33
225 0.31
226 0.33
227 0.3
228 0.28
229 0.25
230 0.23
231 0.2
232 0.15
233 0.12
234 0.1
235 0.13
236 0.18
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.23
242 0.26
243 0.27
244 0.28
245 0.29
246 0.34
247 0.42
248 0.43
249 0.5
250 0.51
251 0.53
252 0.56
253 0.59
254 0.62
255 0.61
256 0.7
257 0.72
258 0.76
259 0.79
260 0.73
261 0.72
262 0.64
263 0.59
264 0.49
265 0.44
266 0.35
267 0.27
268 0.24
269 0.18
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.15
283 0.21
284 0.26
285 0.26
286 0.3
287 0.33
288 0.37
289 0.37
290 0.38
291 0.41
292 0.42
293 0.44
294 0.43
295 0.43
296 0.38
297 0.35
298 0.37
299 0.3
300 0.28
301 0.27
302 0.28
303 0.29
304 0.3
305 0.3
306 0.25
307 0.27
308 0.23
309 0.27
310 0.26
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.19
315 0.16
316 0.22
317 0.18
318 0.23
319 0.29
320 0.29
321 0.37