Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5WIG7

Protein Details
Accession A0A2C5WIG7    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-259AAKSSKSSDKKKVRDKDRDSGKDKBasic
627-656KGEKPEKSEKGSSRRNRGRRGGSGKKEKDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-273KREKDKDAGGAGRGSRSARQEARLAAKSSKSSDKKKVRDKDRDSGKDKEKSERMTDKIKILK
384-400SSKREPGRTRGRGRGKG
619-663KATGEKAEKGEKPEKSEKGSSRRNRGRRGGSGKKEKDGGRGVKEA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTAAQTKAVRPGSLTAGATGTNANLPSSKSSGRNGRSRNQALGVMVKIRLLPPAMQEAECLKLLPEEWHVGKGKVDSFRYTPGKVSNRPGRPSHASVAYFQLSREDDVVSFGEAVKLIVWEDAGDTFHDSCLKAKPYLERCVYRKNPMEKDRGDSLQGTIDQDPEFIHFLENLTRVAANEKEEDKTAAQTPEVEKSTEKPTSTPLVEYMREKREKDKDAGGAGRGSRSARQEARLAAKSSKSSDKKKVRDKDRDSGKDKEKSERMTDKIKILKKAATADAPGTSKNAAAAGNGSQAPGSQSSSKTKRATIAAAARVLQRDHGLSPGAAHRRARAEIAKVEMENKTAAAAAATTSGASTSKKDSPKEPSQTPTETSKPAEPAAGSSKREPGRTRGRGRGKGSGDTNAAKAQQQEPVKPIILLKKKPEIDASPASIQSPSLKTNEAPRIAEASTKGASEPATQPSASSSKGKLAEKSNNNSKARKADRQDAKSGASAPLTVTPGATKAFIKNVNPSCGINASSLRTALSCFGAINAIDIELRKGFAYVEFSQHESLVAAVKAGSISIGQGQIRVAERKVKKPAPGPAASIAQGSSGSPSGNGSLEKTDEKDAEKAKTGDSKATGEKAEKGEKPEKSEKGSSRRNRGRRGGSGKKEKDGGRGVKEASTGGDKGVKGSGPGAAALAPGPASALAST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.25
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.19
7 0.14
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.18
14 0.22
15 0.26
16 0.27
17 0.35
18 0.44
19 0.5
20 0.57
21 0.6
22 0.63
23 0.69
24 0.7
25 0.67
26 0.6
27 0.56
28 0.49
29 0.47
30 0.41
31 0.33
32 0.29
33 0.25
34 0.23
35 0.2
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.24
41 0.26
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.26
46 0.25
47 0.22
48 0.15
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.2
54 0.21
55 0.27
56 0.29
57 0.29
58 0.3
59 0.31
60 0.33
61 0.34
62 0.36
63 0.34
64 0.34
65 0.43
66 0.45
67 0.43
68 0.41
69 0.43
70 0.49
71 0.5
72 0.58
73 0.59
74 0.62
75 0.66
76 0.66
77 0.65
78 0.64
79 0.63
80 0.59
81 0.56
82 0.49
83 0.45
84 0.47
85 0.42
86 0.35
87 0.29
88 0.29
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.18
93 0.15
94 0.17
95 0.17
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.2
119 0.23
120 0.23
121 0.25
122 0.34
123 0.38
124 0.47
125 0.52
126 0.53
127 0.54
128 0.63
129 0.65
130 0.64
131 0.67
132 0.67
133 0.7
134 0.7
135 0.74
136 0.66
137 0.67
138 0.64
139 0.57
140 0.5
141 0.41
142 0.34
143 0.29
144 0.28
145 0.24
146 0.19
147 0.19
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.11
155 0.09
156 0.1
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.22
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.19
175 0.18
176 0.2
177 0.21
178 0.24
179 0.25
180 0.23
181 0.2
182 0.22
183 0.28
184 0.29
185 0.27
186 0.22
187 0.25
188 0.29
189 0.29
190 0.27
191 0.25
192 0.25
193 0.27
194 0.3
195 0.33
196 0.36
197 0.4
198 0.41
199 0.46
200 0.5
201 0.53
202 0.52
203 0.51
204 0.46
205 0.46
206 0.46
207 0.4
208 0.33
209 0.29
210 0.26
211 0.22
212 0.19
213 0.18
214 0.19
215 0.25
216 0.24
217 0.27
218 0.29
219 0.31
220 0.37
221 0.38
222 0.37
223 0.33
224 0.33
225 0.33
226 0.33
227 0.39
228 0.39
229 0.42
230 0.5
231 0.58
232 0.64
233 0.72
234 0.78
235 0.79
236 0.83
237 0.83
238 0.82
239 0.83
240 0.82
241 0.78
242 0.76
243 0.74
244 0.7
245 0.65
246 0.64
247 0.58
248 0.53
249 0.55
250 0.53
251 0.49
252 0.48
253 0.49
254 0.47
255 0.49
256 0.5
257 0.47
258 0.42
259 0.42
260 0.37
261 0.38
262 0.34
263 0.28
264 0.24
265 0.21
266 0.21
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.12
288 0.19
289 0.24
290 0.31
291 0.32
292 0.32
293 0.34
294 0.34
295 0.33
296 0.31
297 0.32
298 0.28
299 0.27
300 0.26
301 0.24
302 0.23
303 0.21
304 0.16
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.14
313 0.16
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.21
318 0.22
319 0.23
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.22
324 0.21
325 0.18
326 0.2
327 0.17
328 0.16
329 0.13
330 0.11
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.05
335 0.04
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.09
346 0.16
347 0.2
348 0.22
349 0.25
350 0.33
351 0.41
352 0.46
353 0.46
354 0.43
355 0.44
356 0.44
357 0.43
358 0.4
359 0.34
360 0.3
361 0.28
362 0.27
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.15
367 0.15
368 0.2
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.28
373 0.29
374 0.33
375 0.33
376 0.34
377 0.41
378 0.48
379 0.53
380 0.56
381 0.63
382 0.67
383 0.69
384 0.69
385 0.61
386 0.56
387 0.52
388 0.46
389 0.39
390 0.33
391 0.3
392 0.23
393 0.22
394 0.18
395 0.18
396 0.16
397 0.19
398 0.2
399 0.21
400 0.21
401 0.23
402 0.22
403 0.2
404 0.21
405 0.24
406 0.3
407 0.32
408 0.34
409 0.4
410 0.41
411 0.42
412 0.43
413 0.37
414 0.36
415 0.35
416 0.34
417 0.28
418 0.27
419 0.26
420 0.22
421 0.2
422 0.17
423 0.16
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.15
428 0.23
429 0.29
430 0.29
431 0.27
432 0.26
433 0.28
434 0.27
435 0.27
436 0.2
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.15
445 0.15
446 0.17
447 0.16
448 0.16
449 0.18
450 0.2
451 0.19
452 0.19
453 0.17
454 0.21
455 0.27
456 0.29
457 0.3
458 0.35
459 0.42
460 0.47
461 0.54
462 0.58
463 0.61
464 0.64
465 0.61
466 0.59
467 0.59
468 0.59
469 0.59
470 0.56
471 0.57
472 0.62
473 0.65
474 0.66
475 0.59
476 0.54
477 0.47
478 0.43
479 0.35
480 0.25
481 0.2
482 0.16
483 0.16
484 0.15
485 0.13
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.16
494 0.2
495 0.21
496 0.29
497 0.33
498 0.36
499 0.36
500 0.35
501 0.32
502 0.3
503 0.29
504 0.22
505 0.2
506 0.19
507 0.18
508 0.18
509 0.16
510 0.14
511 0.14
512 0.13
513 0.12
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.08
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.16
532 0.15
533 0.2
534 0.21
535 0.23
536 0.23
537 0.23
538 0.22
539 0.15
540 0.15
541 0.12
542 0.11
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.04
550 0.05
551 0.07
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.14
557 0.17
558 0.2
559 0.19
560 0.26
561 0.31
562 0.39
563 0.49
564 0.5
565 0.54
566 0.58
567 0.65
568 0.64
569 0.62
570 0.57
571 0.52
572 0.5
573 0.44
574 0.37
575 0.28
576 0.2
577 0.18
578 0.14
579 0.12
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.14
589 0.16
590 0.18
591 0.2
592 0.22
593 0.23
594 0.25
595 0.29
596 0.32
597 0.33
598 0.37
599 0.36
600 0.36
601 0.41
602 0.4
603 0.39
604 0.38
605 0.39
606 0.37
607 0.39
608 0.38
609 0.33
610 0.37
611 0.37
612 0.42
613 0.41
614 0.45
615 0.49
616 0.5
617 0.56
618 0.6
619 0.6
620 0.59
621 0.65
622 0.66
623 0.67
624 0.74
625 0.75
626 0.77
627 0.82
628 0.85
629 0.86
630 0.87
631 0.86
632 0.86
633 0.86
634 0.86
635 0.86
636 0.88
637 0.83
638 0.79
639 0.77
640 0.7
641 0.67
642 0.66
643 0.63
644 0.58
645 0.58
646 0.54
647 0.49
648 0.47
649 0.39
650 0.33
651 0.29
652 0.23
653 0.2
654 0.24
655 0.21
656 0.22
657 0.25
658 0.22
659 0.19
660 0.19
661 0.2
662 0.15
663 0.16
664 0.14
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.1
669 0.07
670 0.06
671 0.07
672 0.06