Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X1L1

Protein Details
Accession A0A2C5X1L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-147AYGTGEKRQRGGRKNKNKRRNHEQRETDWEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-137KRQRGGRKNKNKRRN
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSSQSPAKPAGLSLYADLLEPEPGASNATDSNAAAKKKAADSALRFQPIRRTAPTKQKPKSVFSAPVPAPNAPNSATPAQSVAAPTTASSTSASTTQAPPVRSRLSDWAPSKADEWAYGTGEKRQRGGRKNKNKRRNHEQRETDWEDVYDPSRPTNVDEYLKSDERIGEIREWKDILYGHRKSYSRSVSPSSGSRSDLSSDEGRDQRPGLGARIAPPPGLNFAPPPEPQEIPMDISGDDVYARRQAMSQGQKPDPSAPTPTLVPASASVGVVASSAPVRYAHVQRDNDSNDPEEGEDWDDDPRPALGLGHSSTANDDDNYDDANIGAPRANRPGQSGFAGRMMAKYGWTKGSGLGAESDGITSALSVAVEKRRKRPDAEGGGWAEPAGSRNKVLGGQRNNGDSGQFGKMSDVVVLRGMLDGMEDLAHEIELGLGQEIGEECGEKYGRVERLYIDQASRRVFIKFTNQISALRAVSELNGRMFSGNTIKPAYYDSEKFEACIYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.14
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.18
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.28
24 0.29
25 0.34
26 0.31
27 0.34
28 0.39
29 0.47
30 0.52
31 0.53
32 0.51
33 0.49
34 0.54
35 0.53
36 0.52
37 0.5
38 0.5
39 0.53
40 0.64
41 0.72
42 0.73
43 0.73
44 0.77
45 0.76
46 0.74
47 0.73
48 0.69
49 0.66
50 0.6
51 0.63
52 0.54
53 0.56
54 0.53
55 0.47
56 0.42
57 0.36
58 0.34
59 0.26
60 0.27
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.21
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.22
84 0.25
85 0.27
86 0.28
87 0.33
88 0.35
89 0.33
90 0.35
91 0.36
92 0.36
93 0.43
94 0.43
95 0.44
96 0.42
97 0.42
98 0.4
99 0.35
100 0.31
101 0.23
102 0.23
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.25
108 0.29
109 0.3
110 0.3
111 0.35
112 0.42
113 0.5
114 0.6
115 0.64
116 0.7
117 0.8
118 0.87
119 0.9
120 0.92
121 0.91
122 0.92
123 0.92
124 0.9
125 0.9
126 0.86
127 0.82
128 0.81
129 0.78
130 0.68
131 0.57
132 0.47
133 0.38
134 0.31
135 0.27
136 0.21
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.2
143 0.23
144 0.22
145 0.22
146 0.26
147 0.3
148 0.31
149 0.29
150 0.26
151 0.22
152 0.2
153 0.22
154 0.19
155 0.18
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.23
164 0.26
165 0.28
166 0.29
167 0.35
168 0.36
169 0.37
170 0.43
171 0.44
172 0.38
173 0.4
174 0.42
175 0.38
176 0.4
177 0.4
178 0.36
179 0.32
180 0.3
181 0.26
182 0.23
183 0.22
184 0.2
185 0.21
186 0.18
187 0.17
188 0.2
189 0.22
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.11
210 0.14
211 0.14
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.2
217 0.19
218 0.17
219 0.17
220 0.14
221 0.11
222 0.12
223 0.1
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.16
234 0.23
235 0.27
236 0.32
237 0.33
238 0.34
239 0.35
240 0.36
241 0.3
242 0.25
243 0.23
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.12
250 0.11
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.06
266 0.1
267 0.13
268 0.19
269 0.26
270 0.28
271 0.29
272 0.35
273 0.37
274 0.35
275 0.33
276 0.28
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.13
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.16
317 0.18
318 0.17
319 0.21
320 0.23
321 0.23
322 0.25
323 0.24
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.17
328 0.15
329 0.15
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.15
338 0.17
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.07
355 0.15
356 0.23
357 0.27
358 0.36
359 0.45
360 0.49
361 0.53
362 0.58
363 0.61
364 0.63
365 0.62
366 0.59
367 0.54
368 0.5
369 0.45
370 0.37
371 0.26
372 0.17
373 0.16
374 0.14
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.19
380 0.24
381 0.3
382 0.33
383 0.38
384 0.41
385 0.42
386 0.42
387 0.38
388 0.33
389 0.25
390 0.22
391 0.19
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.13
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.11
429 0.12
430 0.11
431 0.13
432 0.19
433 0.24
434 0.24
435 0.26
436 0.24
437 0.3
438 0.35
439 0.35
440 0.33
441 0.33
442 0.37
443 0.38
444 0.38
445 0.33
446 0.3
447 0.28
448 0.28
449 0.33
450 0.37
451 0.38
452 0.42
453 0.42
454 0.42
455 0.44
456 0.44
457 0.34
458 0.27
459 0.23
460 0.18
461 0.18
462 0.21
463 0.2
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.23
471 0.22
472 0.24
473 0.26
474 0.25
475 0.25
476 0.27
477 0.3
478 0.3
479 0.31
480 0.33
481 0.36
482 0.36
483 0.36