Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XIT9

Protein Details
Accession A0A2C5XIT9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-71AKKPKASSKSTPKEKSTPNSKKIKASKPEPEPKPHydrophilic
337-380PAQEKETKPTPKKGKASPNPKAKASPKTAQKPTRASTRNKKVAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-72IKNKRKAAEDSSPAVAKKPKASSKSTPKEKSTPNSKKIKASKPEPEPKPE
343-379TKPTPKKGKASPNPKAKASPKTAQKPTRASTRNKKVA
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRNAASASPAVVKTTPIKNKRKAAEDSSPAVAKKPKASSKSTPKEKSTPNSKKIKASKPEPEPKPEPKADAMDVDEDETATVADITIQDEDVEEEVDAELQALAAGLDSDNDAPSKSTFKAGQDVGKIPSIKAKKSVKSHEKEKPGVVYIGRIPHGFYENEMKQYFGQFGPILRLRMSRNKRTGASKHFAFIEFREESTASIVAKTMDNYLLFGHILKCKVVPTEKLHADVWKGANKRFKKIPYNKMEALSLKKPKTESNWTKRVERENQKRLENAKKLKAIGYSYKPTVAKNATVPPAIENADAPKAIEEKESVAMEETQPVAKQEPSEPAQEKETKPTPKKGKASPNPKAKASPKTAQKPTRASTRNKKVAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.39
4 0.33
5 0.32
6 0.31
7 0.36
8 0.41
9 0.47
10 0.57
11 0.64
12 0.72
13 0.77
14 0.79
15 0.76
16 0.75
17 0.74
18 0.71
19 0.66
20 0.61
21 0.57
22 0.49
23 0.47
24 0.44
25 0.38
26 0.39
27 0.44
28 0.48
29 0.5
30 0.58
31 0.64
32 0.69
33 0.76
34 0.8
35 0.78
36 0.77
37 0.79
38 0.8
39 0.79
40 0.8
41 0.79
42 0.78
43 0.8
44 0.78
45 0.8
46 0.81
47 0.81
48 0.79
49 0.78
50 0.78
51 0.79
52 0.84
53 0.8
54 0.79
55 0.77
56 0.75
57 0.74
58 0.67
59 0.61
60 0.54
61 0.53
62 0.46
63 0.41
64 0.35
65 0.28
66 0.26
67 0.23
68 0.19
69 0.14
70 0.13
71 0.1
72 0.08
73 0.05
74 0.05
75 0.03
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.11
109 0.11
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.23
114 0.24
115 0.26
116 0.27
117 0.28
118 0.27
119 0.28
120 0.27
121 0.22
122 0.27
123 0.27
124 0.24
125 0.31
126 0.36
127 0.39
128 0.46
129 0.57
130 0.6
131 0.63
132 0.71
133 0.7
134 0.71
135 0.67
136 0.62
137 0.54
138 0.46
139 0.41
140 0.32
141 0.26
142 0.21
143 0.21
144 0.2
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.18
152 0.18
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.13
160 0.14
161 0.1
162 0.1
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.14
167 0.17
168 0.18
169 0.28
170 0.34
171 0.38
172 0.42
173 0.45
174 0.47
175 0.51
176 0.55
177 0.52
178 0.51
179 0.43
180 0.39
181 0.37
182 0.35
183 0.29
184 0.23
185 0.21
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.14
214 0.16
215 0.2
216 0.22
217 0.3
218 0.31
219 0.33
220 0.33
221 0.32
222 0.3
223 0.29
224 0.27
225 0.25
226 0.26
227 0.27
228 0.35
229 0.36
230 0.41
231 0.44
232 0.48
233 0.53
234 0.61
235 0.67
236 0.67
237 0.72
238 0.7
239 0.64
240 0.6
241 0.52
242 0.48
243 0.46
244 0.46
245 0.39
246 0.39
247 0.39
248 0.4
249 0.43
250 0.48
251 0.51
252 0.53
253 0.61
254 0.61
255 0.65
256 0.66
257 0.68
258 0.67
259 0.67
260 0.69
261 0.69
262 0.72
263 0.71
264 0.71
265 0.69
266 0.69
267 0.68
268 0.65
269 0.64
270 0.61
271 0.59
272 0.56
273 0.53
274 0.47
275 0.46
276 0.44
277 0.42
278 0.39
279 0.43
280 0.41
281 0.38
282 0.41
283 0.36
284 0.32
285 0.31
286 0.36
287 0.34
288 0.34
289 0.34
290 0.28
291 0.28
292 0.26
293 0.22
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.13
304 0.13
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.18
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.25
321 0.26
322 0.33
323 0.35
324 0.35
325 0.4
326 0.45
327 0.44
328 0.45
329 0.51
330 0.54
331 0.57
332 0.65
333 0.69
334 0.72
335 0.78
336 0.79
337 0.82
338 0.82
339 0.87
340 0.86
341 0.87
342 0.83
343 0.78
344 0.78
345 0.74
346 0.74
347 0.71
348 0.7
349 0.7
350 0.74
351 0.8
352 0.79
353 0.81
354 0.8
355 0.77
356 0.79
357 0.76
358 0.77
359 0.77
360 0.8