Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C6AMM3

Protein Details
Accession A0A2C6AMM3    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-135DAKSWLTGQKKRQKKIEKTRKLEEELAHydrophilic
286-312AASEIKVKKPKKKKGKGTRQKPHDEDDBasic
612-631GKGKTEKKLKQIEEEKRREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-85AKKRREAKSAAIRKAR
118-128KKRQKKIEKTR
291-306KVKKPKKKKGKGTRQK
360-368ALKKRKRIR
608-622GKGSGKGKTEKKLKQ
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 13.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIQETNRIRLSLGMKPLPVPGAQPSQQTNRRDASDSDDDTEAASTLETRQAQAYDNYKSHLEAEAAKKRREAKSAAIRKAREAAQRFAVLEGKGLGEPEESGEVDAKSWLTGQKKRQKKIEKTRKLEEELAAAEAAAAEAVQYTSKDLAGIKVSHDTTAFAEGDEQILTLKDATIEEYEEAGDELENINIREGEKLTDRLELKKKRPGYNPQDDEIGGRSILSQYDDEIFGKKSKKFTLDADGAIAELSDILDQPVQKTNKLQNISLDDIVGDTPTSSDYLAASEIKVKKPKKKKGKGTRQKPHDEDDIIPTEAGSSAMEVDTSGQVANRKRKAVTEAFVDDDDLQSSLAIQRKDALKKRKRIRPEDFAKQLKEQAEGKGDEESEDESQQGLVIGEISEFVATLSKHDDDEQSRLKRQQRAATRQAAEPDTHDPDQQDQPMDDAPILESGATSHVDEDAATGGAEDNNLDEEKTVGESMGATLALLRERGLIEKSRGDLSHQSNRERQEFLKRKLQLEEELDEKARQARERDRASGKLERMSRADREEYARQQNAWRDHQHARKMAELISSTYKPNVELKYTDEHGRRLDRKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKKLKQIEEEKRREAQSLFDASQGSGMNAATTQQTKKRNEAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.37
4 0.37
5 0.36
6 0.36
7 0.38
8 0.35
9 0.31
10 0.26
11 0.23
12 0.28
13 0.29
14 0.33
15 0.36
16 0.44
17 0.51
18 0.53
19 0.53
20 0.51
21 0.52
22 0.51
23 0.47
24 0.45
25 0.46
26 0.45
27 0.42
28 0.38
29 0.34
30 0.31
31 0.3
32 0.21
33 0.13
34 0.1
35 0.07
36 0.08
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.18
42 0.2
43 0.26
44 0.3
45 0.31
46 0.31
47 0.33
48 0.31
49 0.31
50 0.3
51 0.26
52 0.23
53 0.23
54 0.31
55 0.39
56 0.44
57 0.45
58 0.48
59 0.54
60 0.58
61 0.57
62 0.52
63 0.53
64 0.58
65 0.66
66 0.7
67 0.7
68 0.66
69 0.63
70 0.65
71 0.61
72 0.58
73 0.53
74 0.49
75 0.46
76 0.48
77 0.45
78 0.41
79 0.38
80 0.29
81 0.25
82 0.21
83 0.17
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.14
101 0.2
102 0.27
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.63
107 0.71
108 0.77
109 0.81
110 0.86
111 0.87
112 0.88
113 0.87
114 0.89
115 0.86
116 0.81
117 0.75
118 0.64
119 0.57
120 0.47
121 0.4
122 0.3
123 0.22
124 0.16
125 0.11
126 0.09
127 0.05
128 0.04
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.15
149 0.19
150 0.17
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.22
189 0.23
190 0.29
191 0.38
192 0.44
193 0.46
194 0.52
195 0.59
196 0.61
197 0.68
198 0.71
199 0.71
200 0.74
201 0.73
202 0.66
203 0.61
204 0.53
205 0.46
206 0.37
207 0.27
208 0.16
209 0.12
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.2
223 0.22
224 0.25
225 0.27
226 0.31
227 0.32
228 0.33
229 0.37
230 0.35
231 0.33
232 0.29
233 0.26
234 0.22
235 0.19
236 0.15
237 0.07
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.2
250 0.26
251 0.32
252 0.34
253 0.33
254 0.3
255 0.34
256 0.36
257 0.31
258 0.25
259 0.18
260 0.17
261 0.16
262 0.11
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.12
276 0.15
277 0.19
278 0.26
279 0.31
280 0.39
281 0.5
282 0.6
283 0.65
284 0.73
285 0.8
286 0.84
287 0.9
288 0.92
289 0.93
290 0.92
291 0.9
292 0.89
293 0.8
294 0.73
295 0.66
296 0.57
297 0.47
298 0.41
299 0.35
300 0.26
301 0.23
302 0.18
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.09
318 0.14
319 0.22
320 0.25
321 0.27
322 0.27
323 0.29
324 0.34
325 0.34
326 0.31
327 0.28
328 0.26
329 0.25
330 0.25
331 0.24
332 0.18
333 0.14
334 0.12
335 0.08
336 0.06
337 0.04
338 0.05
339 0.07
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.13
344 0.18
345 0.26
346 0.34
347 0.41
348 0.46
349 0.56
350 0.65
351 0.7
352 0.74
353 0.77
354 0.78
355 0.77
356 0.77
357 0.76
358 0.75
359 0.73
360 0.66
361 0.57
362 0.53
363 0.44
364 0.4
365 0.32
366 0.26
367 0.25
368 0.24
369 0.23
370 0.2
371 0.19
372 0.16
373 0.14
374 0.14
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.15
400 0.15
401 0.21
402 0.28
403 0.29
404 0.33
405 0.39
406 0.45
407 0.48
408 0.52
409 0.54
410 0.56
411 0.61
412 0.65
413 0.67
414 0.62
415 0.58
416 0.56
417 0.49
418 0.4
419 0.33
420 0.3
421 0.27
422 0.25
423 0.24
424 0.21
425 0.23
426 0.26
427 0.25
428 0.22
429 0.17
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.13
434 0.1
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.08
480 0.1
481 0.12
482 0.15
483 0.18
484 0.2
485 0.22
486 0.24
487 0.24
488 0.26
489 0.31
490 0.34
491 0.41
492 0.43
493 0.46
494 0.48
495 0.53
496 0.52
497 0.48
498 0.44
499 0.46
500 0.51
501 0.52
502 0.56
503 0.55
504 0.55
505 0.56
506 0.57
507 0.52
508 0.46
509 0.43
510 0.36
511 0.34
512 0.32
513 0.27
514 0.25
515 0.24
516 0.23
517 0.24
518 0.29
519 0.35
520 0.43
521 0.48
522 0.55
523 0.55
524 0.56
525 0.58
526 0.6
527 0.54
528 0.52
529 0.5
530 0.46
531 0.46
532 0.46
533 0.44
534 0.42
535 0.42
536 0.38
537 0.41
538 0.44
539 0.47
540 0.51
541 0.5
542 0.46
543 0.48
544 0.53
545 0.54
546 0.54
547 0.5
548 0.48
549 0.55
550 0.61
551 0.63
552 0.62
553 0.58
554 0.55
555 0.52
556 0.48
557 0.43
558 0.36
559 0.32
560 0.32
561 0.31
562 0.27
563 0.28
564 0.26
565 0.25
566 0.29
567 0.29
568 0.27
569 0.27
570 0.29
571 0.33
572 0.36
573 0.42
574 0.39
575 0.39
576 0.41
577 0.49
578 0.51
579 0.5
580 0.56
581 0.56
582 0.61
583 0.65
584 0.68
585 0.65
586 0.62
587 0.65
588 0.65
589 0.64
590 0.59
591 0.6
592 0.53
593 0.51
594 0.55
595 0.51
596 0.49
597 0.47
598 0.5
599 0.47
600 0.53
601 0.57
602 0.58
603 0.65
604 0.65
605 0.69
606 0.73
607 0.72
608 0.74
609 0.77
610 0.79
611 0.8
612 0.81
613 0.77
614 0.74
615 0.72
616 0.65
617 0.55
618 0.5
619 0.46
620 0.45
621 0.39
622 0.35
623 0.34
624 0.3
625 0.33
626 0.27
627 0.2
628 0.14
629 0.13
630 0.11
631 0.1
632 0.11
633 0.12
634 0.16
635 0.22
636 0.28
637 0.37
638 0.42
639 0.5
640 0.57
641 0.62
642 0.65