Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C6AFP0

Protein Details
Accession A0A2C6AFP0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSSMRNAVHRRPHRERAQPLERRRLGHydrophilic
208-233REFERAKSLRRLKRQLDHARKKFKALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-14R
214-231KSLRRLKRQLDHARKKFK
254-270GGLTRKGHKIRVRTRKR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVHRRPHRERAQPLERRRLGLLEKHKDYSLRAQDYNKKKAQLKALRQKAADRNEDEFYFGMMSRKGPGSRIKGGKGWSGTLQGDRGNQSMDVDMVRLLKTQDMGYVRTMRQVVSKEVARLEEQLALARALGQLDEDAGAKDSEDDSGDETGPRAGAPLAARKIVFADNEEERDEAMEEAAAADEAEHEPSADKHEEEEEQEREFERAKSLRRLKRQLDHARKKFKALTEAEQRLEVQRAKMAKTATSGGLTRKGHKIRVRTRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.83
4 0.85
5 0.85
6 0.84
7 0.85
8 0.79
9 0.72
10 0.64
11 0.6
12 0.54
13 0.53
14 0.55
15 0.53
16 0.55
17 0.54
18 0.54
19 0.5
20 0.49
21 0.49
22 0.49
23 0.45
24 0.44
25 0.49
26 0.57
27 0.65
28 0.7
29 0.65
30 0.63
31 0.63
32 0.65
33 0.68
34 0.69
35 0.71
36 0.72
37 0.77
38 0.76
39 0.71
40 0.73
41 0.71
42 0.68
43 0.64
44 0.57
45 0.52
46 0.49
47 0.47
48 0.41
49 0.33
50 0.25
51 0.19
52 0.16
53 0.14
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.25
61 0.3
62 0.37
63 0.41
64 0.42
65 0.42
66 0.44
67 0.45
68 0.39
69 0.34
70 0.27
71 0.26
72 0.25
73 0.22
74 0.21
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.19
99 0.18
100 0.21
101 0.21
102 0.18
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.06
149 0.07
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.12
159 0.14
160 0.15
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.16
189 0.19
190 0.24
191 0.21
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.18
198 0.19
199 0.23
200 0.27
201 0.36
202 0.46
203 0.54
204 0.62
205 0.7
206 0.72
207 0.76
208 0.82
209 0.83
210 0.84
211 0.87
212 0.86
213 0.87
214 0.81
215 0.79
216 0.73
217 0.67
218 0.65
219 0.59
220 0.58
221 0.58
222 0.62
223 0.56
224 0.52
225 0.48
226 0.42
227 0.42
228 0.36
229 0.27
230 0.27
231 0.29
232 0.29
233 0.32
234 0.31
235 0.27
236 0.28
237 0.3
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.34
243 0.34
244 0.36
245 0.43
246 0.46
247 0.51
248 0.55
249 0.62
250 0.65