FuNGI

A0A2C6A1U3

Protein Details

Accession

A0A2C6A1U3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
127-147	DESDPRKPRKSNNGNTSTNKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MAAPSTFSYAQAAKGQGAPSTLSAIPNQSAAQAPGPQSSAAANKTASPPEGPNEPSDVSRPAEPRSSMIERQDADSTNGSESDLRSESAAERRPNSKRDDDAAGLERPWTRAERGTRSSSSTARSVDESDPRKPRKSNNGNTSTNKKPRVSDQQAGEQVAAAPEAEPTPAPEPPKVELSEAPIPSVNIWQQRKEAQLAKAKPAPAPAEDKVNGALAHVDEPSKVASPDQDPSSPVRDATSVNGAKTFGKPGETARPERNGSRGSRSTEREAKDGRVDLPPSVEDAASWPTPETAIKEDKRKSISAQADRQDREPKEGQDEGSQAKPRQKGKWVTYDYVPSVSFETQIPQLRTTKPRGGARGVNGTRTSLGGPTGGDKPAPPTQAGKFGDPKDRPREAGTAPDGAVSIPPSAKRASMDASGSKEQRKVPGQAMSDRTRDTVSQFAEHGQGARDRPEGRGDRGRGGYRSRGGHHSISTHPQHQAASAGYVPGPIPSRSQGPYSPPPRQGGHGQMFMAHSGRGGRGRNGAGPNFHRMSLPNGSTRLPPVQTQFGPYEYPMAPLSAMPFQPQPPYWDHVVLSMLRNQLEYYFSIENLCKDTFLRKKMDSQGFVKLDFVASFKRIRDLTSDMSMIRAVCESSTEIDYVVDNEDVERLRRRVGWQTWVMPVPKRDEEARTEGPAHITFKNRPFPLGTQYGAMTAYPLGVSPSMGYLPGDSQFPQFPDGQGLNGAFNGGGVSHGGGPSQLSADVPDFSPSGAAVAAGGLTGNSSLVAGNPSAGAEVVANGTHVEAPAVLGQANGHVDESGDNATSSGIDSEGPSGHDATQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.24
4	0.24
5	0.22
6	0.18
7	0.21
8	0.21
9	0.19
10	0.19
11	0.21
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.17
16	0.18
17	0.18
18	0.19
19	0.21
20	0.22
21	0.22
22	0.24
23	0.22
24	0.2
25	0.21
26	0.23
27	0.21
28	0.22
29	0.2
30	0.22
31	0.26
32	0.28
33	0.27
34	0.25
35	0.26
36	0.27
37	0.33
38	0.31
39	0.29
40	0.31
41	0.31
42	0.29
43	0.3
44	0.29
45	0.26
46	0.3
47	0.31
48	0.3
49	0.34
50	0.34
51	0.33
52	0.38
53	0.42
54	0.41
55	0.43
56	0.46
57	0.41
58	0.43
59	0.44
60	0.38
61	0.35
62	0.33
63	0.3
64	0.25
65	0.24
66	0.21
67	0.19
68	0.18
69	0.2
70	0.18
71	0.17
72	0.16
73	0.17
74	0.2
75	0.25
76	0.32
77	0.32
78	0.36
79	0.44
80	0.5
81	0.54
82	0.58
83	0.58
84	0.56
85	0.55
86	0.56
87	0.5
88	0.49
89	0.48
90	0.42
91	0.35
92	0.33
93	0.3
94	0.25
95	0.26
96	0.23
97	0.22
98	0.27
99	0.35
100	0.4
101	0.45
102	0.5
103	0.5
104	0.52
105	0.54
106	0.5
107	0.46
108	0.42
109	0.38
110	0.33
111	0.32
112	0.31
113	0.31
114	0.36
115	0.37
116	0.41
117	0.49
118	0.53
119	0.58
120	0.59
121	0.64
122	0.66
123	0.73
124	0.75
125	0.76
126	0.79
127	0.8
128	0.82
129	0.8
130	0.78
131	0.76
132	0.73
133	0.65
134	0.59
135	0.6
136	0.65
137	0.66
138	0.63
139	0.59
140	0.61
141	0.62
142	0.59
143	0.51
144	0.4
145	0.32
146	0.25
147	0.2
148	0.11
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.07
153	0.06
154	0.09
155	0.11
156	0.14
157	0.17
158	0.18
159	0.21
160	0.23
161	0.28
162	0.26
163	0.26
164	0.24
165	0.29
166	0.34
167	0.31
168	0.29
169	0.25
170	0.24
171	0.22
172	0.24
173	0.22
174	0.24
175	0.26
176	0.28
177	0.3
178	0.34
179	0.37
180	0.39
181	0.41
182	0.4
183	0.46
184	0.46
185	0.5
186	0.5
187	0.49
188	0.44
189	0.42
190	0.38
191	0.31
192	0.34
193	0.29
194	0.32
195	0.31
196	0.3
197	0.26
198	0.26
199	0.23
200	0.17
201	0.17
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.11
213	0.14
214	0.18
215	0.2
216	0.2
217	0.2
218	0.23
219	0.27
220	0.24
221	0.22
222	0.19
223	0.17
224	0.17
225	0.18
226	0.24
227	0.21
228	0.21
229	0.22
230	0.22
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.14
235	0.15
236	0.15
237	0.18
238	0.27
239	0.31
240	0.34
241	0.36
242	0.4
243	0.41
244	0.42
245	0.43
246	0.39
247	0.37
248	0.4
249	0.4
250	0.41
251	0.45
252	0.47
253	0.5
254	0.52
255	0.51
256	0.48
257	0.46
258	0.43
259	0.4
260	0.38
261	0.33
262	0.3
263	0.29
264	0.23
265	0.22
266	0.2
267	0.17
268	0.16
269	0.14
270	0.09
271	0.1
272	0.13
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.2
282	0.23
283	0.31
284	0.35
285	0.39
286	0.42
287	0.41
288	0.4
289	0.41
290	0.46
291	0.46
292	0.49
293	0.51
294	0.54
295	0.54
296	0.55
297	0.55
298	0.47
299	0.45
300	0.42
301	0.37
302	0.35
303	0.36
304	0.33
305	0.27
306	0.29
307	0.25
308	0.25
309	0.28
310	0.25
311	0.3
312	0.34
313	0.36
314	0.39
315	0.45
316	0.49
317	0.5
318	0.57
319	0.56
320	0.53
321	0.5
322	0.49
323	0.42
324	0.35
325	0.3
326	0.21
327	0.18
328	0.16
329	0.15
330	0.11
331	0.12
332	0.14
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.23
337	0.26
338	0.31
339	0.35
340	0.36
341	0.38
342	0.4
343	0.42
344	0.42
345	0.41
346	0.4
347	0.44
348	0.39
349	0.36
350	0.32
351	0.29
352	0.26
353	0.23
354	0.2
355	0.1
356	0.1
357	0.07
358	0.07
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.13
365	0.16
366	0.17
367	0.15
368	0.17
369	0.18
370	0.26
371	0.27
372	0.26
373	0.28
374	0.29
375	0.37
376	0.37
377	0.42
378	0.41
379	0.42
380	0.41
381	0.38
382	0.39
383	0.31
384	0.33
385	0.29
386	0.23
387	0.21
388	0.19
389	0.17
390	0.13
391	0.13
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.12
403	0.14
404	0.14
405	0.18
406	0.21
407	0.22
408	0.23
409	0.24
410	0.23
411	0.27
412	0.28
413	0.27
414	0.28
415	0.31
416	0.31
417	0.33
418	0.37
419	0.36
420	0.34
421	0.31
422	0.29
423	0.24
424	0.23
425	0.19
426	0.18
427	0.16
428	0.15
429	0.15
430	0.15
431	0.16
432	0.15
433	0.14
434	0.1
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.15
439	0.14
440	0.15
441	0.22
442	0.24
443	0.26
444	0.32
445	0.32
446	0.34
447	0.37
448	0.38
449	0.33
450	0.34
451	0.33
452	0.31
453	0.32
454	0.3
455	0.31
456	0.32
457	0.31
458	0.3
459	0.28
460	0.26
461	0.3
462	0.3
463	0.29
464	0.26
465	0.25
466	0.24
467	0.22
468	0.21
469	0.15
470	0.13
471	0.1
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.1
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.15
482	0.16
483	0.18
484	0.18
485	0.23
486	0.31
487	0.36
488	0.41
489	0.42
490	0.44
491	0.43
492	0.44
493	0.41
494	0.4
495	0.38
496	0.34
497	0.3
498	0.28
499	0.27
500	0.25
501	0.21
502	0.13
503	0.09
504	0.08
505	0.1
506	0.12
507	0.13
508	0.14
509	0.18
510	0.19
511	0.24
512	0.26
513	0.27
514	0.27
515	0.28
516	0.33
517	0.3
518	0.29
519	0.25
520	0.22
521	0.26
522	0.27
523	0.27
524	0.23
525	0.24
526	0.25
527	0.25
528	0.27
529	0.25
530	0.21
531	0.21
532	0.21
533	0.25
534	0.24
535	0.26
536	0.25
537	0.23
538	0.23
539	0.21
540	0.22
541	0.16
542	0.18
543	0.15
544	0.14
545	0.13
546	0.12
547	0.14
548	0.12
549	0.12
550	0.12
551	0.14
552	0.14
553	0.17
554	0.18
555	0.2
556	0.2
557	0.23
558	0.24
559	0.24
560	0.23
561	0.21
562	0.22
563	0.2
564	0.18
565	0.19
566	0.19
567	0.17
568	0.17
569	0.16
570	0.15
571	0.15
572	0.14
573	0.15
574	0.13
575	0.13
576	0.15
577	0.16
578	0.16
579	0.18
580	0.18
581	0.14
582	0.14
583	0.22
584	0.27
585	0.32
586	0.37
587	0.35
588	0.42
589	0.51
590	0.58
591	0.54
592	0.5
593	0.54
594	0.49
595	0.48
596	0.41
597	0.32
598	0.25
599	0.21
600	0.19
601	0.12
602	0.13
603	0.16
604	0.16
605	0.2
606	0.2
607	0.21
608	0.23
609	0.26
610	0.28
611	0.28
612	0.29
613	0.24
614	0.24
615	0.24
616	0.2
617	0.15
618	0.12
619	0.09
620	0.07
621	0.09
622	0.09
623	0.1
624	0.12
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.11
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.1
635	0.1
636	0.13
637	0.18
638	0.17
639	0.19
640	0.22
641	0.26
642	0.34
643	0.38
644	0.43
645	0.43
646	0.45
647	0.47
648	0.49
649	0.48
650	0.42
651	0.41
652	0.4
653	0.36
654	0.36
655	0.35
656	0.34
657	0.37
658	0.41
659	0.41
660	0.37
661	0.37
662	0.35
663	0.35
664	0.34
665	0.32
666	0.28
667	0.29
668	0.32
669	0.38
670	0.46
671	0.43
672	0.42
673	0.43
674	0.42
675	0.44
676	0.42
677	0.36
678	0.29
679	0.29
680	0.27
681	0.24
682	0.2
683	0.14
684	0.09
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.08
697	0.1
698	0.11
699	0.12
700	0.12
701	0.14
702	0.16
703	0.17
704	0.19
705	0.18
706	0.18
707	0.22
708	0.22
709	0.2
710	0.2
711	0.19
712	0.17
713	0.16
714	0.16
715	0.1
716	0.09
717	0.08
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.08
728	0.09
729	0.08
730	0.07
731	0.09
732	0.11
733	0.12
734	0.12
735	0.13
736	0.12
737	0.12
738	0.12
739	0.1
740	0.09
741	0.08
742	0.07
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.04
747	0.04
748	0.03
749	0.03
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.05
756	0.07
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.08
763	0.07
764	0.06
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.08
772	0.08
773	0.07
774	0.06
775	0.08
776	0.09
777	0.1
778	0.09
779	0.08
780	0.08
781	0.11
782	0.12
783	0.11
784	0.1
785	0.09
786	0.1
787	0.1
788	0.12
789	0.12
790	0.11
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.1
796	0.09
797	0.07
798	0.07
799	0.08
800	0.1
801	0.11
802	0.13
803	0.14
804	0.15

A0A2C6A1U3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer