Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YBB0

Protein Details
Accession A0A2C5YBB0    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-149VDESERWDRRKKKKAAHRDNNAFRDDBasic
232-255DMRRAEEQRLKKRRERMANNGDDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-139RRKKKKAA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPDITESEIKPPGAASDAQEDSAAPEPQEAGTASEPPQASASDDAAAKAGERLARFKALQARAKKSSETNLKEATKEAQRLASDPGQLTALRRKHAIASHKLLKAEVEEAGEDFERKRAWDWTVDESERWDRRKKKKAAHRDNNAFRDDHQESNKIYKRQLRNIKPDLEQYDRQKLAAVERAAASGGLDIVETDDGELIAVDKDGSFYSTADSTAFAQNKPDRAAVDRLVQDMRRAEEQRLKKRRERMANNGDDGDVTYINEKNEQFNQKLARFYDKYTADIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.21
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.16
16 0.14
17 0.12
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.2
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.17
41 0.22
42 0.22
43 0.26
44 0.33
45 0.38
46 0.44
47 0.49
48 0.54
49 0.56
50 0.58
51 0.56
52 0.5
53 0.52
54 0.54
55 0.51
56 0.49
57 0.51
58 0.5
59 0.48
60 0.46
61 0.42
62 0.38
63 0.35
64 0.31
65 0.28
66 0.27
67 0.28
68 0.31
69 0.28
70 0.25
71 0.22
72 0.22
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.23
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.26
82 0.31
83 0.36
84 0.35
85 0.4
86 0.46
87 0.47
88 0.46
89 0.43
90 0.38
91 0.31
92 0.25
93 0.18
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.13
107 0.18
108 0.21
109 0.24
110 0.28
111 0.28
112 0.27
113 0.27
114 0.33
115 0.32
116 0.33
117 0.36
118 0.41
119 0.5
120 0.61
121 0.66
122 0.68
123 0.74
124 0.82
125 0.85
126 0.86
127 0.86
128 0.86
129 0.86
130 0.8
131 0.72
132 0.6
133 0.49
134 0.47
135 0.39
136 0.33
137 0.26
138 0.26
139 0.25
140 0.33
141 0.38
142 0.32
143 0.33
144 0.37
145 0.42
146 0.48
147 0.57
148 0.57
149 0.61
150 0.65
151 0.66
152 0.6
153 0.59
154 0.54
155 0.49
156 0.47
157 0.42
158 0.44
159 0.4
160 0.38
161 0.35
162 0.31
163 0.28
164 0.29
165 0.25
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.16
170 0.15
171 0.12
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.16
202 0.18
203 0.16
204 0.23
205 0.25
206 0.29
207 0.3
208 0.29
209 0.25
210 0.27
211 0.32
212 0.28
213 0.31
214 0.29
215 0.29
216 0.31
217 0.3
218 0.29
219 0.27
220 0.28
221 0.28
222 0.29
223 0.32
224 0.38
225 0.47
226 0.55
227 0.62
228 0.66
229 0.66
230 0.74
231 0.79
232 0.81
233 0.8
234 0.8
235 0.81
236 0.81
237 0.77
238 0.68
239 0.59
240 0.48
241 0.39
242 0.3
243 0.2
244 0.13
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.19
249 0.19
250 0.22
251 0.29
252 0.36
253 0.34
254 0.39
255 0.46
256 0.45
257 0.5
258 0.48
259 0.49
260 0.45
261 0.47
262 0.49
263 0.43
264 0.43
265 0.42
266 0.43
267 0.37
268 0.37
269 0.38
270 0.35
271 0.36
272 0.33