Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Z499

Protein Details
Accession A0A2C5Z499    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-404AGPPQVRRAKQSEREREREGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-400PQVRRAKQSERER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12611  RRM1_NGR1_NAM8_like  
cd12613  RRM2_NGR1_NAM8_like  
cd12346  RRM3_NGR1_NAM8_like  
Amino Acid Sequences MSFPNGTPPATDMSAVAPPPGGPQEQPKTTLWMGELEPWMDENFIKGVFLSAAGETVNVKVIRDKNSGNAGYCFVEFQTPEAATKALGLNGTPVPNSSRQFKLNWASGGGLVDRRDDRGPEYSIFVGDLGPEVNEYVLVSLFQARFPSCKSAKIMTDAMSGQSRGYGFVRFSDENDQQRALVDMQGVFCGNRPMRISTATPKNRGNHQFGGHGHHAGGPMMGAGMPQQHQMWGGMQGFPYGGYNPATQMNQFTDPNNTTVFVGGLSGYVTEDELRSFFQGFGEITYVKIPPGKGCGFVQFVHRHAAEMAINQMQGYPIGNSRVRLSWGRSQNNSGVGTPYRPAPPPPHYMGMPSHGPGPYGPQHFGAPAPGLQGPPGPPGPPGPAGPPQVRRAKQSEREREREGEGRAAEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.15
5 0.14
6 0.16
7 0.19
8 0.18
9 0.16
10 0.25
11 0.33
12 0.36
13 0.4
14 0.38
15 0.41
16 0.4
17 0.4
18 0.32
19 0.27
20 0.25
21 0.27
22 0.27
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.16
28 0.15
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.19
48 0.24
49 0.3
50 0.34
51 0.35
52 0.35
53 0.43
54 0.45
55 0.41
56 0.38
57 0.34
58 0.31
59 0.3
60 0.24
61 0.17
62 0.17
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.15
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.14
78 0.15
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.2
83 0.23
84 0.25
85 0.27
86 0.28
87 0.3
88 0.36
89 0.39
90 0.38
91 0.37
92 0.33
93 0.3
94 0.28
95 0.28
96 0.22
97 0.18
98 0.13
99 0.16
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.23
107 0.21
108 0.23
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.12
114 0.09
115 0.08
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.15
134 0.22
135 0.19
136 0.23
137 0.26
138 0.29
139 0.3
140 0.33
141 0.33
142 0.26
143 0.28
144 0.24
145 0.22
146 0.19
147 0.18
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.17
157 0.15
158 0.17
159 0.22
160 0.26
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.23
165 0.23
166 0.22
167 0.16
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.19
183 0.21
184 0.23
185 0.33
186 0.35
187 0.38
188 0.41
189 0.42
190 0.48
191 0.51
192 0.5
193 0.44
194 0.41
195 0.41
196 0.38
197 0.41
198 0.34
199 0.29
200 0.23
201 0.2
202 0.19
203 0.14
204 0.13
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.19
244 0.17
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.2
282 0.23
283 0.24
284 0.24
285 0.3
286 0.28
287 0.28
288 0.3
289 0.29
290 0.26
291 0.23
292 0.25
293 0.19
294 0.16
295 0.17
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.09
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.19
309 0.21
310 0.24
311 0.26
312 0.29
313 0.33
314 0.42
315 0.48
316 0.48
317 0.51
318 0.51
319 0.52
320 0.49
321 0.4
322 0.35
323 0.29
324 0.28
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.23
329 0.26
330 0.3
331 0.34
332 0.39
333 0.43
334 0.44
335 0.41
336 0.43
337 0.41
338 0.39
339 0.35
340 0.29
341 0.28
342 0.24
343 0.24
344 0.21
345 0.25
346 0.27
347 0.28
348 0.29
349 0.27
350 0.27
351 0.28
352 0.28
353 0.24
354 0.19
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.18
361 0.17
362 0.2
363 0.21
364 0.18
365 0.18
366 0.21
367 0.25
368 0.25
369 0.25
370 0.25
371 0.31
372 0.36
373 0.42
374 0.45
375 0.49
376 0.56
377 0.58
378 0.59
379 0.61
380 0.65
381 0.68
382 0.73
383 0.76
384 0.76
385 0.8
386 0.79
387 0.75
388 0.71
389 0.68
390 0.6
391 0.56