Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Z079

Protein Details
Accession A0A2C5Z079    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-483NRTDRTGKDRGQRVRKLQLSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MLIDNAVYYVDPPERPAIERKERTPMELFVRKLVYSDLTKKNYGKILKQIRRFHWEEADVVFILEKVFSKPGKVKYGNIHLLGILLSALNRYHSEFVVKVIDNVIESVCVGLEQNDFRFFQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDSMYKIMTFGYGGPPVPGRLNPFDPPDDFFRIRLIATVLETCGVFFNRGVAGKKLDYFLAFFQYYVHTKSSLPMEMEFIVQDIFALTRPQWKLASTLEEATKAFQLAIAQDQKTSGADRALEPDEATSVASSEDENGDVDDIEPYGDGEDETASEDDEAEQDDEDDSAHESDFNDETLVVTRQEETIDPYDEAEFEREYARMMSESLESRKFERKQLFDVPLPVRPKNRDVAALTAQGDDSNATSNTMAFSLLTRRGNRQQTRTVELPSDSTFAIAMKTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLQHSEDQEGHDRLPTFHHNRTDRTGKDRGQRVRKLQLSDVDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.35
4 0.41
5 0.48
6 0.54
7 0.55
8 0.61
9 0.6
10 0.62
11 0.58
12 0.54
13 0.53
14 0.53
15 0.51
16 0.46
17 0.47
18 0.42
19 0.38
20 0.35
21 0.3
22 0.29
23 0.37
24 0.4
25 0.43
26 0.49
27 0.5
28 0.53
29 0.56
30 0.55
31 0.52
32 0.54
33 0.6
34 0.63
35 0.71
36 0.75
37 0.73
38 0.76
39 0.74
40 0.69
41 0.65
42 0.58
43 0.51
44 0.43
45 0.39
46 0.31
47 0.27
48 0.21
49 0.14
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.14
55 0.14
56 0.19
57 0.26
58 0.33
59 0.42
60 0.45
61 0.48
62 0.52
63 0.61
64 0.63
65 0.57
66 0.5
67 0.4
68 0.38
69 0.32
70 0.23
71 0.13
72 0.07
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.16
82 0.15
83 0.18
84 0.22
85 0.21
86 0.19
87 0.19
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.14
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.08
100 0.1
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.24
106 0.23
107 0.27
108 0.29
109 0.31
110 0.32
111 0.36
112 0.38
113 0.33
114 0.34
115 0.29
116 0.26
117 0.23
118 0.21
119 0.17
120 0.16
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.18
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.19
129 0.14
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.21
153 0.23
154 0.25
155 0.26
156 0.26
157 0.27
158 0.28
159 0.3
160 0.28
161 0.25
162 0.24
163 0.22
164 0.21
165 0.19
166 0.15
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.17
226 0.21
227 0.16
228 0.18
229 0.16
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.1
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.1
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.16
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.14
338 0.17
339 0.2
340 0.21
341 0.24
342 0.33
343 0.34
344 0.39
345 0.44
346 0.44
347 0.47
348 0.54
349 0.56
350 0.5
351 0.55
352 0.49
353 0.47
354 0.48
355 0.46
356 0.44
357 0.43
358 0.44
359 0.42
360 0.42
361 0.41
362 0.38
363 0.4
364 0.38
365 0.37
366 0.34
367 0.29
368 0.27
369 0.21
370 0.19
371 0.14
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.07
382 0.08
383 0.12
384 0.18
385 0.24
386 0.25
387 0.32
388 0.41
389 0.51
390 0.57
391 0.59
392 0.63
393 0.63
394 0.67
395 0.64
396 0.58
397 0.51
398 0.44
399 0.41
400 0.33
401 0.29
402 0.22
403 0.19
404 0.16
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.12
409 0.15
410 0.19
411 0.22
412 0.25
413 0.27
414 0.31
415 0.36
416 0.43
417 0.42
418 0.47
419 0.5
420 0.53
421 0.58
422 0.56
423 0.53
424 0.48
425 0.45
426 0.41
427 0.38
428 0.36
429 0.29
430 0.32
431 0.3
432 0.27
433 0.27
434 0.24
435 0.23
436 0.22
437 0.24
438 0.26
439 0.27
440 0.26
441 0.29
442 0.29
443 0.27
444 0.31
445 0.37
446 0.37
447 0.42
448 0.51
449 0.52
450 0.56
451 0.64
452 0.67
453 0.62
454 0.63
455 0.64
456 0.62
457 0.67
458 0.71
459 0.73
460 0.74
461 0.78
462 0.8
463 0.81
464 0.8
465 0.77
466 0.74