FuNGI

A0A0D1CMK5

Protein Details

Accession

A0A0D1CMK5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-34	VYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHN	Hydrophilic
384-408	NNSTAKKPTYKKKKKAQREKEEAEA	Hydrophilic
430-458	AAVAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKE	Basic
473-497	AAANGKPSKPKSKKKQKEEAASKSL	Hydrophilic
503-523	GSPDKDKKATPKKTAAKKPAA	Hydrophilic
529-548	STAKKKTTAKSEKKSNNVTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
389-541	KKPTYKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAEAAKKKAEEEAAAAAAAVAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEKEEKQRKEKEAAAANGKPSKPKSKKKQKEEAASKSLAKNAPGSPDKDKKATPKKTAAKKPAAATAAASTAKKKTTAKSEK

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 8.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	uma:UMAG_03989 -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATTASVYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHNHHFRFERQNGMFLFDSPVKAFLGYIRDQKVPADLIDVLTESGVRFFEGCLLVDVHDHRSHAAASESILGPRELHGMSAAGQARATGAQAIDSQSGLASSLFYLQEGGRYGARKMVGGAASFDPRTGGLGGVEIYRIVLHPTSETLWADIKMLDDMAGGMWSDQEALEVEAKILALTAPPLCLTPDPQATRIANLMLSSTALPSAYNPSHDSPYRSAKKRGANSIEMEKEEANRQRREKIMRLMQHGHKSVLPPQVGMANSLARPGPAMVETGGSTSAAAATAFVPTFDRMTFIERWRIGRNAALNGGMPAVPPAGAATNATNSAASGSNAKGGKDAAKPNDKDDVTDTANNSTAKKPTYKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAEAAKKKAEEEAAAAAAAVAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEKEEKQRKEKEAAAANGKPSKPKSKKKQKEEAASKSLAKNAPGSPDKDKKATPKKTAAKKPAAATAAASTAKKKTTAKSEKKSNNVTAANATAATGSANGVTETPTMPHAVVQGTPILGSATPSVQSTPTPAHRSIPSQPQQQQQMQQQQMQQQLTQQQLQQAALAGMFPNMANQLPFGAGVSQPGVAGIGAGGFGMPMMNGGFPPTSNPQITAAALAAMQGMGIGQFGAAGAGNFGNAAQMQQMMQMMNAGGMVGFNGMPFAQQMQQSAQGQQAQGQQQQQAAPGQGADMPVGVGLAGLANWGTGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.49
3	0.56
4	0.64
5	0.71
6	0.79
7	0.85
8	0.88
9	0.9
10	0.9
11	0.9
12	0.89
13	0.86
14	0.83
15	0.81
16	0.8
17	0.75
18	0.73
19	0.71
20	0.68
21	0.61
22	0.58
23	0.54
24	0.5
25	0.54
26	0.5
27	0.53
28	0.47
29	0.52
30	0.47
31	0.49
32	0.44
33	0.35
34	0.36
35	0.28
36	0.29
37	0.23
38	0.24
39	0.19
40	0.18
41	0.17
42	0.15
43	0.19
44	0.21
45	0.28
46	0.3
47	0.32
48	0.32
49	0.33
50	0.33
51	0.29
52	0.25
53	0.21
54	0.18
55	0.17
56	0.17
57	0.17
58	0.13
59	0.11
60	0.11
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.17
74	0.19
75	0.2
76	0.2
77	0.2
78	0.19
79	0.2
80	0.2
81	0.18
82	0.18
83	0.13
84	0.12
85	0.16
86	0.16
87	0.16
88	0.16
89	0.15
90	0.14
91	0.14
92	0.17
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.11
97	0.12
98	0.18
99	0.19
100	0.15
101	0.15
102	0.15
103	0.15
104	0.14
105	0.14
106	0.09
107	0.07
108	0.08
109	0.1
110	0.12
111	0.12
112	0.11
113	0.11
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.07
118	0.06
119	0.05
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.1
124	0.09
125	0.12
126	0.13
127	0.15
128	0.15
129	0.16
130	0.17
131	0.19
132	0.2
133	0.18
134	0.17
135	0.2
136	0.18
137	0.17
138	0.2
139	0.18
140	0.21
141	0.2
142	0.19
143	0.15
144	0.13
145	0.14
146	0.12
147	0.1
148	0.07
149	0.08
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.1
162	0.11
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.13
171	0.1
172	0.1
173	0.08
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.05
195	0.04
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.09
203	0.11
204	0.14
205	0.22
206	0.23
207	0.25
208	0.3
209	0.29
210	0.3
211	0.28
212	0.24
213	0.17
214	0.15
215	0.14
216	0.08
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.12
225	0.12
226	0.14
227	0.17
228	0.19
229	0.23
230	0.25
231	0.28
232	0.27
233	0.37
234	0.44
235	0.46
236	0.5
237	0.53
238	0.59
239	0.61
240	0.66
241	0.61
242	0.57
243	0.55
244	0.56
245	0.51
246	0.43
247	0.39
248	0.3
249	0.26
250	0.28
251	0.31
252	0.31
253	0.35
254	0.37
255	0.41
256	0.46
257	0.51
258	0.52
259	0.54
260	0.55
261	0.55
262	0.58
263	0.6
264	0.6
265	0.61
266	0.56
267	0.48
268	0.41
269	0.37
270	0.37
271	0.36
272	0.3
273	0.23
274	0.22
275	0.24
276	0.22
277	0.22
278	0.17
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.12
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.12
312	0.16
313	0.17
314	0.23
315	0.24
316	0.27
317	0.28
318	0.29
319	0.25
320	0.25
321	0.25
322	0.2
323	0.2
324	0.17
325	0.14
326	0.13
327	0.13
328	0.1
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.12
354	0.15
355	0.18
356	0.23
357	0.24
358	0.31
359	0.31
360	0.33
361	0.39
362	0.35
363	0.32
364	0.3
365	0.28
366	0.23
367	0.24
368	0.23
369	0.17
370	0.2
371	0.19
372	0.19
373	0.16
374	0.16
375	0.16
376	0.22
377	0.27
378	0.34
379	0.45
380	0.55
381	0.63
382	0.7
383	0.79
384	0.84
385	0.9
386	0.91
387	0.9
388	0.89
389	0.83
390	0.78
391	0.7
392	0.58
393	0.47
394	0.36
395	0.25
396	0.15
397	0.11
398	0.06
399	0.03
400	0.03
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.04
419	0.04
420	0.07
421	0.11
422	0.15
423	0.2
424	0.28
425	0.39
426	0.49
427	0.6
428	0.68
429	0.76
430	0.82
431	0.88
432	0.89
433	0.9
434	0.9
435	0.89
436	0.88
437	0.85
438	0.81
439	0.8
440	0.78
441	0.78
442	0.78
443	0.74
444	0.72
445	0.7
446	0.69
447	0.69
448	0.67
449	0.68
450	0.68
451	0.69
452	0.7
453	0.7
454	0.69
455	0.64
456	0.62
457	0.58
458	0.55
459	0.52
460	0.48
461	0.44
462	0.43
463	0.43
464	0.39
465	0.37
466	0.34
467	0.41
468	0.44
469	0.53
470	0.61
471	0.67
472	0.77
473	0.83
474	0.9
475	0.88
476	0.89
477	0.89
478	0.86
479	0.8
480	0.72
481	0.65
482	0.56
483	0.52
484	0.42
485	0.33
486	0.29
487	0.24
488	0.28
489	0.28
490	0.31
491	0.33
492	0.4
493	0.41
494	0.41
495	0.43
496	0.46
497	0.54
498	0.6
499	0.59
500	0.62
501	0.68
502	0.75
503	0.82
504	0.81
505	0.78
506	0.74
507	0.69
508	0.65
509	0.57
510	0.47
511	0.38
512	0.3
513	0.25
514	0.21
515	0.19
516	0.15
517	0.16
518	0.17
519	0.21
520	0.22
521	0.24
522	0.34
523	0.45
524	0.53
525	0.6
526	0.69
527	0.73
528	0.78
529	0.8
530	0.73
531	0.7
532	0.61
533	0.53
534	0.45
535	0.38
536	0.3
537	0.23
538	0.19
539	0.11
540	0.09
541	0.08
542	0.06
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.1
574	0.12
575	0.16
576	0.22
577	0.26
578	0.27
579	0.3
580	0.32
581	0.37
582	0.4
583	0.45
584	0.46
585	0.5
586	0.55
587	0.57
588	0.62
589	0.62
590	0.63
591	0.61
592	0.64
593	0.59
594	0.58
595	0.55
596	0.54
597	0.55
598	0.5
599	0.42
600	0.36
601	0.38
602	0.37
603	0.36
604	0.31
605	0.29
606	0.29
607	0.29
608	0.25
609	0.2
610	0.17
611	0.14
612	0.13
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.07
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.08
632	0.08
633	0.08
634	0.06
635	0.06
636	0.04
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.02
642	0.03
643	0.03
644	0.02
645	0.03
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.06
650	0.07
651	0.07
652	0.12
653	0.16
654	0.21
655	0.22
656	0.23
657	0.24
658	0.26
659	0.26
660	0.23
661	0.18
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.08
666	0.06
667	0.05
668	0.04
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.02
674	0.03
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.03
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.06
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.07
689	0.07
690	0.09
691	0.11
692	0.1
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.07
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.04
705	0.05
706	0.05
707	0.06
708	0.06
709	0.09
710	0.12
711	0.13
712	0.16
713	0.18
714	0.25
715	0.27
716	0.28
717	0.3
718	0.3
719	0.29
720	0.31
721	0.35
722	0.34
723	0.37
724	0.4
725	0.38
726	0.38
727	0.38
728	0.37
729	0.33
730	0.29
731	0.24
732	0.2
733	0.18
734	0.17
735	0.16
736	0.13
737	0.1
738	0.08
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.03
746	0.04
747	0.04

A0A0D1CMK5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer