Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MED9

Protein Details
Accession B8MED9    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-167STEKRIRYLKTRKSNAEKRANDHydrophilic
271-297DQLAIETRKKRQKKKEHGKGKQRAIKDBasic
308-337KHNPKKDYARACRRCRLKKKRCVMNPENTAHydrophilic
471-497QNQTQESYPTSRRRRRPGATLRRANVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-296RKKRQKKKEHGKGKQRAIK
483-486RRRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MTVNTRKRTERDFGSNQAESSARKRSKRDNSTEESHDTTQYEQDEKWPYIDSDGDYELDPDYVSPHRNNTIAGYQALQPIGHSVDEQAEDGDNEDNADDASSDDGDYKDEPYEDEVDDNDEMGPLDEEVEEWKKAEVKKIVNNINSTEKRIRYLKTRKSNAEKRANDKAEEYTREWNARNKGRSELDKIEAAKRAAQDQVQNAEDDLMKARDRLANHQARKAAVEQNARQEYMEAVRTRRVRIPRTRKEERHYDPGDLDDGDDSLSDQIADQLAIETRKKRQKKKEHGKGKQRAIKDDSEEGENEGPKHNPKKDYARACRRCRLKKKRCVMNPENTACANCIQDAKRCRLTDHVTGKQIHVNELQETQVKLDSALNELARFRAMSKISIGLDNPLAGITGYGPPTQKRAMQNWARMNRGLEPLSPLSAQASGSGGTPGKRKSPTDGNDSESSQAVKRQKTVPPQPKNFSFQNQTQESYPTSRRRRRPGATLRRANVQTQQKTKREEAAEKLFQEAQQQRLLYLQAQQAEPQQEKVEQQQKATR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.63
3 0.56
4 0.5
5 0.44
6 0.38
7 0.36
8 0.39
9 0.38
10 0.43
11 0.5
12 0.58
13 0.67
14 0.75
15 0.8
16 0.79
17 0.79
18 0.79
19 0.78
20 0.72
21 0.67
22 0.58
23 0.51
24 0.43
25 0.37
26 0.34
27 0.31
28 0.28
29 0.23
30 0.27
31 0.31
32 0.31
33 0.31
34 0.29
35 0.27
36 0.27
37 0.29
38 0.23
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.14
46 0.12
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.16
51 0.18
52 0.22
53 0.25
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.28
59 0.27
60 0.24
61 0.23
62 0.25
63 0.24
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.12
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.17
121 0.18
122 0.26
123 0.29
124 0.33
125 0.4
126 0.48
127 0.54
128 0.53
129 0.54
130 0.5
131 0.54
132 0.49
133 0.48
134 0.46
135 0.4
136 0.41
137 0.43
138 0.42
139 0.43
140 0.52
141 0.56
142 0.61
143 0.68
144 0.72
145 0.78
146 0.84
147 0.84
148 0.84
149 0.79
150 0.76
151 0.78
152 0.72
153 0.62
154 0.55
155 0.51
156 0.46
157 0.45
158 0.41
159 0.36
160 0.37
161 0.39
162 0.39
163 0.4
164 0.42
165 0.45
166 0.47
167 0.43
168 0.46
169 0.48
170 0.5
171 0.5
172 0.46
173 0.41
174 0.4
175 0.4
176 0.37
177 0.36
178 0.32
179 0.28
180 0.24
181 0.24
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.25
187 0.23
188 0.22
189 0.2
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.2
201 0.29
202 0.36
203 0.38
204 0.42
205 0.42
206 0.4
207 0.4
208 0.37
209 0.33
210 0.3
211 0.33
212 0.32
213 0.38
214 0.39
215 0.37
216 0.34
217 0.29
218 0.24
219 0.2
220 0.22
221 0.15
222 0.15
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.29
227 0.34
228 0.38
229 0.47
230 0.57
231 0.61
232 0.68
233 0.76
234 0.77
235 0.75
236 0.77
237 0.72
238 0.7
239 0.62
240 0.55
241 0.46
242 0.4
243 0.35
244 0.25
245 0.2
246 0.1
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.17
265 0.26
266 0.35
267 0.44
268 0.54
269 0.63
270 0.73
271 0.83
272 0.86
273 0.89
274 0.91
275 0.93
276 0.91
277 0.89
278 0.84
279 0.75
280 0.7
281 0.63
282 0.56
283 0.48
284 0.42
285 0.34
286 0.29
287 0.27
288 0.23
289 0.2
290 0.18
291 0.15
292 0.13
293 0.14
294 0.18
295 0.24
296 0.27
297 0.29
298 0.33
299 0.42
300 0.49
301 0.58
302 0.63
303 0.67
304 0.73
305 0.76
306 0.79
307 0.8
308 0.82
309 0.83
310 0.84
311 0.83
312 0.84
313 0.87
314 0.89
315 0.87
316 0.87
317 0.83
318 0.82
319 0.8
320 0.72
321 0.65
322 0.55
323 0.47
324 0.38
325 0.31
326 0.22
327 0.13
328 0.16
329 0.15
330 0.21
331 0.24
332 0.29
333 0.35
334 0.35
335 0.35
336 0.38
337 0.42
338 0.45
339 0.49
340 0.49
341 0.47
342 0.48
343 0.48
344 0.45
345 0.4
346 0.33
347 0.27
348 0.23
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.14
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.19
374 0.19
375 0.21
376 0.2
377 0.16
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.09
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.17
392 0.2
393 0.24
394 0.27
395 0.31
396 0.4
397 0.46
398 0.54
399 0.6
400 0.63
401 0.6
402 0.57
403 0.54
404 0.48
405 0.45
406 0.38
407 0.29
408 0.28
409 0.26
410 0.26
411 0.24
412 0.2
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.13
423 0.17
424 0.19
425 0.25
426 0.29
427 0.31
428 0.35
429 0.44
430 0.47
431 0.51
432 0.52
433 0.51
434 0.5
435 0.5
436 0.44
437 0.35
438 0.32
439 0.24
440 0.28
441 0.29
442 0.29
443 0.32
444 0.37
445 0.43
446 0.51
447 0.61
448 0.65
449 0.69
450 0.75
451 0.79
452 0.78
453 0.77
454 0.72
455 0.69
456 0.65
457 0.6
458 0.6
459 0.55
460 0.52
461 0.47
462 0.45
463 0.41
464 0.41
465 0.43
466 0.44
467 0.51
468 0.59
469 0.67
470 0.74
471 0.81
472 0.82
473 0.85
474 0.86
475 0.86
476 0.88
477 0.88
478 0.81
479 0.8
480 0.75
481 0.67
482 0.64
483 0.63
484 0.61
485 0.62
486 0.69
487 0.66
488 0.71
489 0.71
490 0.71
491 0.68
492 0.66
493 0.64
494 0.64
495 0.64
496 0.58
497 0.58
498 0.51
499 0.45
500 0.47
501 0.44
502 0.38
503 0.37
504 0.36
505 0.33
506 0.33
507 0.34
508 0.26
509 0.27
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.28
514 0.32
515 0.37
516 0.37
517 0.34
518 0.33
519 0.31
520 0.34
521 0.42
522 0.44
523 0.4